Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rbbp8nlA2ABX0 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rbbp8nlA2ABX0 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rbbp8nlA2ABX0 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Rbbp8nlA2ABX0 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Rbbp8nlA2ABX0 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rbbp8nlA2ABX0 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rbbp8nlA2ABX0 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rbbp8nlA2ABX0 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rbbp8nlA2ABX0 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rbbp8nlA2ABX0 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rbbp8nlA2ABX0 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rbbp8nlA2ABX0 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rbbp8nlA2ABX0 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Rbbp8nlA2ABX0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rbbp8nlA2ABX0 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rbbp8nlA2ABX0 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rbbp8nlA2ABX0 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rbbp8nlA2ABX0 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rbbp8nlA2ABX0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rbbp8nlA2ABX0 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rbbp8nlA2ABX0 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rbbp8nlA2ABX0 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rbbp8nlA2ABX0 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rbbp8nlA2ABX0 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rbbp8nlA2ABX0 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rbbp8nlA2ABX0 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rbbp8nlA2ABX0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rbbp8nlA2ABX0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rbbp8nlA2ABX0 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rbbp8nlA2ABX0 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rbbp8nlA2ABX0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rbbp8nlA2ABX0 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rbbp8nlA2ABX0 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rbbp8nlA2ABX0 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rbbp8nlA2ABX0 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rbbp8nlA2ABX0 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rbbp8nlA2ABX0 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rbbp8nlA2ABX0 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rbbp8nlA2ABX0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rbbp8nlA2ABX0 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rbbp8nlA2ABX0 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rbbp8nlA2ABX0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rbbp8nlA2ABX0 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rbbp8nlA2ABX0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rbbp8nlA2ABX0 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rbbp8nlA2ABX0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rbbp8nlA2ABX0 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rbbp8nlA2ABX0 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rbbp8nlA2ABX0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rbbp8nlA2ABX0 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rbbp8nlA2ABX0 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rbbp8nlA2ABX0 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rbbp8nlA2ABX0 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rbbp8nlA2ABX0 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rbbp8nlA2ABX0 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rbbp8nlA2ABX0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rbbp8nlA2ABX0 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rbbp8nlA2ABX0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rbbp8nlA2ABX0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rbbp8nlA2ABX0 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Rbbp8nlA2ABX0 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rbbp8nlA2ABX0 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rbbp8nlA2ABX0 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rbbp8nlA2ABX0 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms