Protein–RNA interactions for Protein: A2A9K7

Cnksr1, Connector enhancer of kinase suppressor of Ras 1, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnksr1A2A9K7 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnksr1A2A9K7 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnksr1A2A9K7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnksr1A2A9K7 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnksr1A2A9K7 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnksr1A2A9K7 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cnksr1A2A9K7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cnksr1A2A9K7 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cnksr1A2A9K7 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cnksr1A2A9K7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cnksr1A2A9K7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cnksr1A2A9K7 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cnksr1A2A9K7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cnksr1A2A9K7 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cnksr1A2A9K7 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cnksr1A2A9K7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cnksr1A2A9K7 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cnksr1A2A9K7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cnksr1A2A9K7 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnksr1A2A9K7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnksr1A2A9K7 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnksr1A2A9K7 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnksr1A2A9K7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnksr1A2A9K7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnksr1A2A9K7 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnksr1A2A9K7 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnksr1A2A9K7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnksr1A2A9K7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnksr1A2A9K7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnksr1A2A9K7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnksr1A2A9K7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnksr1A2A9K7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnksr1A2A9K7 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnksr1A2A9K7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnksr1A2A9K7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnksr1A2A9K7 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnksr1A2A9K7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnksr1A2A9K7 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnksr1A2A9K7 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnksr1A2A9K7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnksr1A2A9K7 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnksr1A2A9K7 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnksr1A2A9K7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnksr1A2A9K7 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnksr1A2A9K7 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnksr1A2A9K7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnksr1A2A9K7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnksr1A2A9K7 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnksr1A2A9K7 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnksr1A2A9K7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnksr1A2A9K7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnksr1A2A9K7 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnksr1A2A9K7 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnksr1A2A9K7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnksr1A2A9K7 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnksr1A2A9K7 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnksr1A2A9K7 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnksr1A2A9K7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnksr1A2A9K7 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnksr1A2A9K7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnksr1A2A9K7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnksr1A2A9K7 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnksr1A2A9K7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnksr1A2A9K7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnksr1A2A9K7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnksr1A2A9K7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnksr1A2A9K7 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnksr1A2A9K7 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnksr1A2A9K7 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnksr1A2A9K7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnksr1A2A9K7 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnksr1A2A9K7 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnksr1A2A9K7 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnksr1A2A9K7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnksr1A2A9K7 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnksr1A2A9K7 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnksr1A2A9K7 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnksr1A2A9K7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnksr1A2A9K7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnksr1A2A9K7 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnksr1A2A9K7 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnksr1A2A9K7 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnksr1A2A9K7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnksr1A2A9K7 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnksr1A2A9K7 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnksr1A2A9K7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnksr1A2A9K7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnksr1A2A9K7 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnksr1A2A9K7 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Cnksr1A2A9K7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnksr1A2A9K7 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnksr1A2A9K7 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnksr1A2A9K7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnksr1A2A9K7 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnksr1A2A9K7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnksr1A2A9K7 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnksr1A2A9K7 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnksr1A2A9K7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnksr1A2A9K7 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnksr1A2A9K7 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms