Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Itgb4A2A863 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Itgb4A2A863 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Itgb4A2A863 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Itgb4A2A863 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Itgb4A2A863 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Itgb4A2A863 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Itgb4A2A863 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Itgb4A2A863 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Itgb4A2A863 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Itgb4A2A863 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Itgb4A2A863 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Itgb4A2A863 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Itgb4A2A863 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Itgb4A2A863 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Itgb4A2A863 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Itgb4A2A863 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Itgb4A2A863 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Itgb4A2A863 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Itgb4A2A863 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Itgb4A2A863 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Itgb4A2A863 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Itgb4A2A863 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Itgb4A2A863 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Itgb4A2A863 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Itgb4A2A863 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Itgb4A2A863 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Itgb4A2A863 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Itgb4A2A863 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Itgb4A2A863 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Itgb4A2A863 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Itgb4A2A863 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Itgb4A2A863 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Itgb4A2A863 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Itgb4A2A863 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Itgb4A2A863 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Itgb4A2A863 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Itgb4A2A863 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Itgb4A2A863 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Itgb4A2A863 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Itgb4A2A863 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Itgb4A2A863 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Itgb4A2A863 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Itgb4A2A863 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Itgb4A2A863 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Itgb4A2A863 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Itgb4A2A863 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Itgb4A2A863 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Itgb4A2A863 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Itgb4A2A863 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Itgb4A2A863 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Itgb4A2A863 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Itgb4A2A863 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Itgb4A2A863 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Itgb4A2A863 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Itgb4A2A863 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Itgb4A2A863 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Itgb4A2A863 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Itgb4A2A863 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Itgb4A2A863 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Itgb4A2A863 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Itgb4A2A863 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Itgb4A2A863 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Itgb4A2A863 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Itgb4A2A863 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Itgb4A2A863 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Itgb4A2A863 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Itgb4A2A863 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Itgb4A2A863 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itgb4A2A863 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itgb4A2A863 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itgb4A2A863 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itgb4A2A863 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itgb4A2A863 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itgb4A2A863 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itgb4A2A863 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itgb4A2A863 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itgb4A2A863 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itgb4A2A863 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itgb4A2A863 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itgb4A2A863 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itgb4A2A863 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itgb4A2A863 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itgb4A2A863 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itgb4A2A863 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itgb4A2A863 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itgb4A2A863 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itgb4A2A863 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itgb4A2A863 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itgb4A2A863 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itgb4A2A863 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itgb4A2A863 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itgb4A2A863 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itgb4A2A863 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itgb4A2A863 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itgb4A2A863 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itgb4A2A863 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itgb4A2A863 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itgb4A2A863 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itgb4A2A863 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms