Protein–RNA interactions for Protein: A2A588

Krtap1-3, Keratin-associated protein 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap1-3A2A588 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Krtap1-3A2A588 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Krtap1-3A2A588 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Krtap1-3A2A588 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Krtap1-3A2A588 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Krtap1-3A2A588 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Krtap1-3A2A588 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Krtap1-3A2A588 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Krtap1-3A2A588 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Krtap1-3A2A588 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Krtap1-3A2A588 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Krtap1-3A2A588 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Krtap1-3A2A588 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Krtap1-3A2A588 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Krtap1-3A2A588 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Krtap1-3A2A588 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Krtap1-3A2A588 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Krtap1-3A2A588 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Krtap1-3A2A588 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Krtap1-3A2A588 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Krtap1-3A2A588 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Krtap1-3A2A588 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Krtap1-3A2A588 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Krtap1-3A2A588 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Krtap1-3A2A588 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Krtap1-3A2A588 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Krtap1-3A2A588 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Krtap1-3A2A588 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Krtap1-3A2A588 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Krtap1-3A2A588 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Krtap1-3A2A588 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Krtap1-3A2A588 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Krtap1-3A2A588 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Krtap1-3A2A588 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Krtap1-3A2A588 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Krtap1-3A2A588 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Krtap1-3A2A588 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Krtap1-3A2A588 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Krtap1-3A2A588 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Krtap1-3A2A588 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Krtap1-3A2A588 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Krtap1-3A2A588 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Krtap1-3A2A588 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Krtap1-3A2A588 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Krtap1-3A2A588 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Krtap1-3A2A588 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Krtap1-3A2A588 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Krtap1-3A2A588 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Krtap1-3A2A588 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Krtap1-3A2A588 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Krtap1-3A2A588 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Krtap1-3A2A588 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Krtap1-3A2A588 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Krtap1-3A2A588 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Krtap1-3A2A588 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Krtap1-3A2A588 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Krtap1-3A2A588 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Krtap1-3A2A588 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Krtap1-3A2A588 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Krtap1-3A2A588 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Krtap1-3A2A588 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Krtap1-3A2A588 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Krtap1-3A2A588 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Krtap1-3A2A588 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Krtap1-3A2A588 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Krtap1-3A2A588 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Krtap1-3A2A588 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Krtap1-3A2A588 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Krtap1-3A2A588 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Krtap1-3A2A588 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Krtap1-3A2A588 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Krtap1-3A2A588 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Krtap1-3A2A588 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Krtap1-3A2A588 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Krtap1-3A2A588 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Krtap1-3A2A588 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Krtap1-3A2A588 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Krtap1-3A2A588 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Krtap1-3A2A588 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Krtap1-3A2A588 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Krtap1-3A2A588 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Krtap1-3A2A588 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Krtap1-3A2A588 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Krtap1-3A2A588 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Krtap1-3A2A588 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Krtap1-3A2A588 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Krtap1-3A2A588 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Krtap1-3A2A588 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Krtap1-3A2A588 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Krtap1-3A2A588 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Krtap1-3A2A588 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Krtap1-3A2A588 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Krtap1-3A2A588 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Krtap1-3A2A588 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Krtap1-3A2A588 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Krtap1-3A2A588 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Krtap1-3A2A588 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Krtap1-3A2A588 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.03
Krtap1-3A2A588 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Krtap1-3A2A588 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms