Protein–RNA interactions for Protein: A2A3U9

Gm6268, Predicted gene 6268, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6268A2A3U9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm6268A2A3U9 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm6268A2A3U9 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm6268A2A3U9 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm6268A2A3U9 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm6268A2A3U9 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm6268A2A3U9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm6268A2A3U9 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm6268A2A3U9 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm6268A2A3U9 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm6268A2A3U9 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm6268A2A3U9 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm6268A2A3U9 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm6268A2A3U9 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm6268A2A3U9 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm6268A2A3U9 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm6268A2A3U9 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm6268A2A3U9 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm6268A2A3U9 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm6268A2A3U9 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm6268A2A3U9 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm6268A2A3U9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm6268A2A3U9 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm6268A2A3U9 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm6268A2A3U9 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm6268A2A3U9 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm6268A2A3U9 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm6268A2A3U9 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm6268A2A3U9 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm6268A2A3U9 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm6268A2A3U9 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm6268A2A3U9 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm6268A2A3U9 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm6268A2A3U9 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm6268A2A3U9 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm6268A2A3U9 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm6268A2A3U9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm6268A2A3U9 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm6268A2A3U9 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm6268A2A3U9 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm6268A2A3U9 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm6268A2A3U9 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm6268A2A3U9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm6268A2A3U9 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm6268A2A3U9 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm6268A2A3U9 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm6268A2A3U9 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm6268A2A3U9 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm6268A2A3U9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm6268A2A3U9 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm6268A2A3U9 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm6268A2A3U9 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm6268A2A3U9 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm6268A2A3U9 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm6268A2A3U9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm6268A2A3U9 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm6268A2A3U9 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm6268A2A3U9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm6268A2A3U9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm6268A2A3U9 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm6268A2A3U9 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm6268A2A3U9 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm6268A2A3U9 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm6268A2A3U9 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm6268A2A3U9 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm6268A2A3U9 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm6268A2A3U9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm6268A2A3U9 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm6268A2A3U9 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm6268A2A3U9 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm6268A2A3U9 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm6268A2A3U9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm6268A2A3U9 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm6268A2A3U9 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm6268A2A3U9 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm6268A2A3U9 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm6268A2A3U9 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm6268A2A3U9 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm6268A2A3U9 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm6268A2A3U9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm6268A2A3U9 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm6268A2A3U9 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm6268A2A3U9 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm6268A2A3U9 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm6268A2A3U9 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm6268A2A3U9 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm6268A2A3U9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm6268A2A3U9 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm6268A2A3U9 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm6268A2A3U9 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm6268A2A3U9 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm6268A2A3U9 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm6268A2A3U9 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm6268A2A3U9 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm6268A2A3U9 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm6268A2A3U9 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm6268A2A3U9 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm6268A2A3U9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm6268A2A3U9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm6268A2A3U9 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms