Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQ45

6430628N08Rik, MCG1049118, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
6430628N08RikA0A0U1RQ45 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
6430628N08RikA0A0U1RQ45 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
6430628N08RikA0A0U1RQ45 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
6430628N08RikA0A0U1RQ45 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
6430628N08RikA0A0U1RQ45 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
6430628N08RikA0A0U1RQ45 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
6430628N08RikA0A0U1RQ45 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
6430628N08RikA0A0U1RQ45 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
6430628N08RikA0A0U1RQ45 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
6430628N08RikA0A0U1RQ45 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
6430628N08RikA0A0U1RQ45 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms