Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP08

1700028J19Rik, RIKEN cDNA 1700028J19 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms