Protein–RNA interactions for Protein: A0A0R4J054

4921501E09Rik, RIKEN cDNA 4921501E09, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921501E09RikA0A0R4J054 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
4921501E09RikA0A0R4J054 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4921501E09RikA0A0R4J054 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
4921501E09RikA0A0R4J054 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
4921501E09RikA0A0R4J054 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
4921501E09RikA0A0R4J054 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4921501E09RikA0A0R4J054 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4921501E09RikA0A0R4J054 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4921501E09RikA0A0R4J054 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4921501E09RikA0A0R4J054 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
4921501E09RikA0A0R4J054 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4921501E09RikA0A0R4J054 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4921501E09RikA0A0R4J054 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4921501E09RikA0A0R4J054 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4921501E09RikA0A0R4J054 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
4921501E09RikA0A0R4J054 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
4921501E09RikA0A0R4J054 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
4921501E09RikA0A0R4J054 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4921501E09RikA0A0R4J054 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4921501E09RikA0A0R4J054 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
4921501E09RikA0A0R4J054 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
4921501E09RikA0A0R4J054 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4921501E09RikA0A0R4J054 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
4921501E09RikA0A0R4J054 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4921501E09RikA0A0R4J054 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4921501E09RikA0A0R4J054 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4921501E09RikA0A0R4J054 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4921501E09RikA0A0R4J054 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
4921501E09RikA0A0R4J054 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4921501E09RikA0A0R4J054 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4921501E09RikA0A0R4J054 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4921501E09RikA0A0R4J054 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4921501E09RikA0A0R4J054 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4921501E09RikA0A0R4J054 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4921501E09RikA0A0R4J054 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4921501E09RikA0A0R4J054 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4921501E09RikA0A0R4J054 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4921501E09RikA0A0R4J054 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4921501E09RikA0A0R4J054 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
4921501E09RikA0A0R4J054 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4921501E09RikA0A0R4J054 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4921501E09RikA0A0R4J054 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
4921501E09RikA0A0R4J054 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4921501E09RikA0A0R4J054 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
4921501E09RikA0A0R4J054 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4921501E09RikA0A0R4J054 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
4921501E09RikA0A0R4J054 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4921501E09RikA0A0R4J054 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4921501E09RikA0A0R4J054 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
4921501E09RikA0A0R4J054 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
4921501E09RikA0A0R4J054 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4921501E09RikA0A0R4J054 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4921501E09RikA0A0R4J054 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4921501E09RikA0A0R4J054 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
4921501E09RikA0A0R4J054 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4921501E09RikA0A0R4J054 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4921501E09RikA0A0R4J054 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4921501E09RikA0A0R4J054 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4921501E09RikA0A0R4J054 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4921501E09RikA0A0R4J054 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4921501E09RikA0A0R4J054 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
4921501E09RikA0A0R4J054 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4921501E09RikA0A0R4J054 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4921501E09RikA0A0R4J054 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
4921501E09RikA0A0R4J054 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4921501E09RikA0A0R4J054 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4921501E09RikA0A0R4J054 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4921501E09RikA0A0R4J054 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4921501E09RikA0A0R4J054 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
4921501E09RikA0A0R4J054 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4921501E09RikA0A0R4J054 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
4921501E09RikA0A0R4J054 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
4921501E09RikA0A0R4J054 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4921501E09RikA0A0R4J054 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4921501E09RikA0A0R4J054 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4921501E09RikA0A0R4J054 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4921501E09RikA0A0R4J054 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4921501E09RikA0A0R4J054 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4921501E09RikA0A0R4J054 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4921501E09RikA0A0R4J054 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
4921501E09RikA0A0R4J054 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms