Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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