Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P1

Trbv30, T cell receptor beta, variable 30 (Fragment), mousemouse

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv30A0A0B4J1P1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Trbv30A0A0B4J1P1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Trbv30A0A0B4J1P1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Trbv30A0A0B4J1P1 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trbv30A0A0B4J1P1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trbv30A0A0B4J1P1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trbv30A0A0B4J1P1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trbv30A0A0B4J1P1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Trbv30A0A0B4J1P1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Trbv30A0A0B4J1P1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Trbv30A0A0B4J1P1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Trbv30A0A0B4J1P1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trbv30A0A0B4J1P1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Trbv30A0A0B4J1P1 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trbv30A0A0B4J1P1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trbv30A0A0B4J1P1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Trbv30A0A0B4J1P1 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trbv30A0A0B4J1P1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trbv30A0A0B4J1P1 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trbv30A0A0B4J1P1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trbv30A0A0B4J1P1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trbv30A0A0B4J1P1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trbv30A0A0B4J1P1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trbv30A0A0B4J1P1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trbv30A0A0B4J1P1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trbv30A0A0B4J1P1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trbv30A0A0B4J1P1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trbv30A0A0B4J1P1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trbv30A0A0B4J1P1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trbv30A0A0B4J1P1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Trbv30A0A0B4J1P1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trbv30A0A0B4J1P1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trbv30A0A0B4J1P1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Trbv30A0A0B4J1P1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC13□□□□□ -0.33
Trbv30A0A0B4J1P1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trbv30A0A0B4J1P1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trbv30A0A0B4J1P1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trbv30A0A0B4J1P1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trbv30A0A0B4J1P1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trbv30A0A0B4J1P1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Trbv30A0A0B4J1P1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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