Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H1

Trbv12-2, T cell receptor beta, variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 124 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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