Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H0

Trbv12-1, T cell receptor beta, variable 12-1 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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