Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1G7

Trbv1, T cell receptor beta, variable 1 (Fragment), mousemouse

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv1A0A0B4J1G7 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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