Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5J5

Trbv31, T cell receptor beta, variable 31, mousemouse

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv31A0A075B5J5 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trbv31A0A075B5J5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trbv31A0A075B5J5 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trbv31A0A075B5J5 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trbv31A0A075B5J5 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Trbv31A0A075B5J5 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Trbv31A0A075B5J5 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Trbv31A0A075B5J5 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trbv31A0A075B5J5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trbv31A0A075B5J5 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trbv31A0A075B5J5 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trbv31A0A075B5J5 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trbv31A0A075B5J5 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
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Trbv31A0A075B5J5 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trbv31A0A075B5J5 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trbv31A0A075B5J5 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trbv31A0A075B5J5 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trbv31A0A075B5J5 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Trbv31A0A075B5J5 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trbv31A0A075B5J5 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Trbv31A0A075B5J5 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trbv31A0A075B5J5 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
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Trbv31A0A075B5J5 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trbv31A0A075B5J5 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trbv31A0A075B5J5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trbv31A0A075B5J5 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trbv31A0A075B5J5 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Trbv31A0A075B5J5 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trbv31A0A075B5J5 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Trbv31A0A075B5J5 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trbv31A0A075B5J5 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trbv31A0A075B5J5 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trbv31A0A075B5J5 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trbv31A0A075B5J5 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Trbv31A0A075B5J5 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Trbv31A0A075B5J5 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trbv31A0A075B5J5 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Trbv31A0A075B5J5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trbv31A0A075B5J5 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trbv31A0A075B5J5 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trbv31A0A075B5J5 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Trbv31A0A075B5J5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trbv31A0A075B5J5 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Trbv31A0A075B5J5 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trbv31A0A075B5J5 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trbv31A0A075B5J5 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trbv31A0A075B5J5 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trbv31A0A075B5J5 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trbv31A0A075B5J5 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trbv31A0A075B5J5 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Trbv31A0A075B5J5 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trbv31A0A075B5J5 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trbv31A0A075B5J5 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trbv31A0A075B5J5 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trbv31A0A075B5J5 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trbv31A0A075B5J5 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trbv31A0A075B5J5 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Trbv31A0A075B5J5 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Trbv31A0A075B5J5 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trbv31A0A075B5J5 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trbv31A0A075B5J5 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trbv31A0A075B5J5 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trbv31A0A075B5J5 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trbv31A0A075B5J5 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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