Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Gm13092-201ENSMUST00000136346 260 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm11861-201ENSMUST00000141571 382 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm5755-201ENSMUST00000152394 837 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm22059-201ENSMUST00000157544 104 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm22136-201ENSMUST00000158751 268 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm21978-201ENSMUST00000179696 377 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm37692-201ENSMUST00000192633 232 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm8069-201ENSMUST00000197887 154 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm43925-201ENSMUST00000203498 206 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Olfr515-ps1-201ENSMUST00000208389 189 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 AC156798.1-201ENSMUST00000220508 224 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Olfr944-201ENSMUST00000079650 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm26228-201ENSMUST00000082512 107 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm25080-201ENSMUST00000082526 107 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm23515-201ENSMUST00000082829 107 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm23679-201ENSMUST00000083161 119 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm25518-201ENSMUST00000083864 107 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Nlrp4c-204ENSMUST00000208360 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Slc31a1-202ENSMUST00000122092 4154 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Brcc3-202ENSMUST00000114074 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Pgap1-201ENSMUST00000097739 10583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Vmn2r21-201ENSMUST00000163607 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Vmn2r20-201ENSMUST00000172199 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Med14-203ENSMUST00000115481 3729 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm14910-201ENSMUST00000121037 1805 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Kcnma1-204ENSMUST00000112423 3664 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm5615-201ENSMUST00000098900 2348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Olfr329-ps-203ENSMUST00000219448 4052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm17275-201ENSMUST00000181811 2550 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Scn7a-201ENSMUST00000042792 7338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Csrnp3-204ENSMUST00000122912 10672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Zfhx4-201ENSMUST00000026284 13874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Olfr1035-ps1-201ENSMUST00000120109 966 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm11775-201ENSMUST00000136500 773 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm6058-201ENSMUST00000154261 399 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Ear-ps12-201ENSMUST00000161720 451 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Rpl31-ps21-201ENSMUST00000181182 374 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm26871-205ENSMUST00000181926 742 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm7858-201ENSMUST00000190177 622 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm43645-201ENSMUST00000200129 341 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm44041-201ENSMUST00000203678 396 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm45814-201ENSMUST00000212646 775 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 AC154472.2-201ENSMUST00000221186 288 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 AC132315.1-201ENSMUST00000221771 390 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Rps24-205ENSMUST00000223999 525 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 AC115289.1-201ENSMUST00000224915 522 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Defb7-201ENSMUST00000047851 306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm25793-201ENSMUST00000083287 107 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 AC142245.1-201ENSMUST00000226611 1505 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Xlr3c-201ENSMUST00000080839 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Olfr988-202ENSMUST00000111597 1702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Vmn1r202-202ENSMUST00000228020 5441 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 AC168274.1-201ENSMUST00000218657 1864 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Olfr102-202ENSMUST00000217590 2783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Zfp120-201ENSMUST00000089207 4127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Inpp4b-209ENSMUST00000172031 8067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Olfr1250-203ENSMUST00000215730 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Rc3h1-201ENSMUST00000035911 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Olfr705-202ENSMUST00000213721 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 4921511C20Rik-201ENSMUST00000051530 1606 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Serpini1-201ENSMUST00000029423 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm43793-201ENSMUST00000201645 1333 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm12893-201ENSMUST00000121732 275 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm12226-201ENSMUST00000144172 876 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 4930517O19Rik-202ENSMUST00000145018 571 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm24477-201ENSMUST00000157438 103 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm16038-201ENSMUST00000159317 193 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Snrpe-203ENSMUST00000166291 360 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm24464-201ENSMUST00000179697 107 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm26189-201ENSMUST00000179879 107 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm10105-201ENSMUST00000184601 270 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Mir6363-201ENSMUST00000184880 114 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm27190-201ENSMUST00000184890 542 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
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Hdac6Q9Z2V5 Gm38180-201ENSMUST00000192381 395 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm44349-201ENSMUST00000197048 123 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm44274-201ENSMUST00000203417 256 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Crs-ps-201ENSMUST00000203723 760 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm44870-201ENSMUST00000207291 357 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm17990-201ENSMUST00000211728 553 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm8249-201ENSMUST00000219225 465 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm8274-201ENSMUST00000219820 463 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm8785-201ENSMUST00000220259 487 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Eif1-ps2-201ENSMUST00000221990 339 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 U90926-201ENSMUST00000031356 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Olfr992-203ENSMUST00000214895 2222 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Olfr1226-207ENSMUST00000220416 3387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm7195-201ENSMUST00000190869 1707 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Olfr536-201ENSMUST00000064392 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Casp12-201ENSMUST00000027009 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Olfr1317-203ENSMUST00000214801 2578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm13085-201ENSMUST00000118356 171 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Itpa-ps3-201ENSMUST00000119034 395 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm22204-201ENSMUST00000122654 327 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 4930421P07Rik-201ENSMUST00000147322 399 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm24784-201ENSMUST00000157640 62 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm25982-201ENSMUST00000157920 101 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm23016-201ENSMUST00000158431 62 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm25264-201ENSMUST00000158519 117 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm23579-201ENSMUST00000158528 103 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
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