Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Ighv8-1-201ENSMUST00000194897 291 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn6Q9Z262 Gm7652-201ENSMUST00000200440 1151 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn6Q9Z262 Olfr1542-ps1-201ENSMUST00000204175 752 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn6Q9Z262 Gm45513-201ENSMUST00000210228 376 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn6Q9Z262 Gm45829-201ENSMUST00000212466 334 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn6Q9Z262 AC107808.1-201ENSMUST00000213260 386 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn6Q9Z262 AC122301.3-201ENSMUST00000217707 716 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn6Q9Z262 Gm46194-201ENSMUST00000218136 320 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn6Q9Z262 Gm20474-202ENSMUST00000220772 462 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn6Q9Z262 Defb8-201ENSMUST00000033854 287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn6Q9Z262 Olfr970-201ENSMUST00000071132 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn6Q9Z262 mt-Cytb-201ENSMUST00000082421 1144 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn6Q9Z262 Olfr1256-201ENSMUST00000099763 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn6Q9Z262 Gm42547-201ENSMUST00000201159 3798 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn6Q9Z262 Ifi208-201ENSMUST00000085876 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn6Q9Z262 Fbxw21-201ENSMUST00000054925 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn6Q9Z262 Olfr483-202ENSMUST00000215159 2691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn6Q9Z262 Mir499-201ENSMUST00000102357 79 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn6Q9Z262 Gm22023-201ENSMUST00000104354 130 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn6Q9Z262 Gm11367-201ENSMUST00000117802 120 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn6Q9Z262 Gm11577-201ENSMUST00000118030 737 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn6Q9Z262 Gm15195-201ENSMUST00000118775 263 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn6Q9Z262 Gm12803-201ENSMUST00000118907 821 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn6Q9Z262 Gm14627-201ENSMUST00000118931 567 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn6Q9Z262 Gm14901-201ENSMUST00000119001 283 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn6Q9Z262 Gm15231-201ENSMUST00000119174 447 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn6Q9Z262 Etaa1os-201ENSMUST00000140161 550 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn6Q9Z262 Gm24190-201ENSMUST00000157976 216 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn6Q9Z262 Gm20456-201ENSMUST00000174690 385 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn6Q9Z262 Clec5a-204ENSMUST00000177178 665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn6Q9Z262 Gm20268-201ENSMUST00000187932 845 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn6Q9Z262 Gm1833-201ENSMUST00000191608 682 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn6Q9Z262 Gm37629-201ENSMUST00000193635 1050 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn6Q9Z262 Gm37288-201ENSMUST00000193963 334 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn6Q9Z262 4930558F17Rik-201ENSMUST00000197789 786 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn6Q9Z262 4933402J10Rik-202ENSMUST00000198882 1167 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn6Q9Z262 Gm43640-201ENSMUST00000199000 786 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn6Q9Z262 Gm33847-201ENSMUST00000199294 786 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn6Q9Z262 Gm43492-201ENSMUST00000199522 786 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn6Q9Z262 Gm42474-201ENSMUST00000201073 505 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn6Q9Z262 Olfr1142-ps1-201ENSMUST00000213624 805 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn6Q9Z262 Gm18015-201ENSMUST00000214879 316 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn6Q9Z262 AC123618.1-201ENSMUST00000220174 360 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn6Q9Z262 AC156952.1-201ENSMUST00000220361 793 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn6Q9Z262 Olfr1463-201ENSMUST00000064102 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn6Q9Z262 AF357341-201ENSMUST00000083088 75 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn6Q9Z262 Gm23850-201ENSMUST00000083830 169 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn6Q9Z262 CT025577.1-201ENSMUST00000220862 2846 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn6Q9Z262 Gm38083-201ENSMUST00000194758 3498 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn6Q9Z262 Olfr509-204ENSMUST00000215075 3418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn6Q9Z262 Gm42675-201ENSMUST00000197552 4035 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn6Q9Z262 Gm7905-201ENSMUST00000119933 1386 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn6Q9Z262 Gm6221-201ENSMUST00000180064 1386 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn6Q9Z262 Olfr910-201ENSMUST00000215122 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn6Q9Z262 Igkv5-48-201ENSMUST00000103364 360 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn6Q9Z262 S100a5-201ENSMUST00000001049 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn6Q9Z262 Gm14518-201ENSMUST00000117351 542 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn6Q9Z262 Olfr1073-ps1-201ENSMUST00000117635 381 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn6Q9Z262 Gm15126-201ENSMUST00000118631 833 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn6Q9Z262 Gm12150-201ENSMUST00000130874 468 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn6Q9Z262 Gm12898-201ENSMUST00000144407 642 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn6Q9Z262 A630050E04Rik-201ENSMUST00000151443 581 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn6Q9Z262 Gm25066-201ENSMUST00000158145 123 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn6Q9Z262 Gm8161-201ENSMUST00000168739 481 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn6Q9Z262 Gm18520-201ENSMUST00000174783 658 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn6Q9Z262 Gm26585-201ENSMUST00000180890 630 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn6Q9Z262 Gm26991-201ENSMUST00000180950 620 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn6Q9Z262 Gm27700-201ENSMUST00000185003 81 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn6Q9Z262 1700101O22Rik-201ENSMUST00000187396 339 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn6Q9Z262 Gm29012-201ENSMUST00000187882 469 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn6Q9Z262 Gm37853-201ENSMUST00000195748 660 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn6Q9Z262 Igkv15-101-1-201ENSMUST00000196661 258 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn6Q9Z262 Igkv1-115-201ENSMUST00000198714 302 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn6Q9Z262 Mir3073b-201ENSMUST00000199383 60 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn6Q9Z262 Gm45316-201ENSMUST00000210128 162 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn6Q9Z262 Gm45273-201ENSMUST00000211559 281 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn6Q9Z262 AC124433.2-201ENSMUST00000223867 291 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn6Q9Z262 AC126275.1-201ENSMUST00000224881 446 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn6Q9Z262 Vmn1r31-204ENSMUST00000226390 912 ntAPPRIS P2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn6Q9Z262 AC107453.2-201ENSMUST00000227714 655 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn6Q9Z262 Olfr902-201ENSMUST00000050733 1056 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn6Q9Z262 Olfr1489-201ENSMUST00000053113 1111 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn6Q9Z262 Mup5-201ENSMUST00000082287 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn6Q9Z262 Gm23297-201ENSMUST00000083184 127 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn6Q9Z262 Tex16-201ENSMUST00000038546 3972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn6Q9Z262 Olfr657-203ENSMUST00000215454 2397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn6Q9Z262 Gm37848-201ENSMUST00000195288 3103 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn6Q9Z262 Olfr896-ps1-202ENSMUST00000215219 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn6Q9Z262 Krcc1-201ENSMUST00000080949 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn6Q9Z262 Olfr679-204ENSMUST00000215704 5018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Cldn6Q9Z262 Olfr33-202ENSMUST00000216312 2372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Cldn6Q9Z262 Gm5362-201ENSMUST00000211968 3085 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cldn6Q9Z262 Gm11693-201ENSMUST00000119625 565 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cldn6Q9Z262 Gm11446-201ENSMUST00000121319 866 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cldn6Q9Z262 Gm14578-201ENSMUST00000122166 391 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cldn6Q9Z262 Gm22478-201ENSMUST00000122570 154 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cldn6Q9Z262 Gm23325-201ENSMUST00000157422 129 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cldn6Q9Z262 Gm22521-201ENSMUST00000158272 134 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cldn6Q9Z262 1700010K23Rik-201ENSMUST00000174502 376 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Cldn6Q9Z262 Spin2f-201ENSMUST00000177990 765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94 ms