Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 AC174082.1-201ENSMUST00000221106 307 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 AL590503.1-201ENSMUST00000222053 321 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 AC153646.1-201ENSMUST00000223229 1279 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 AC126673.3-201ENSMUST00000223414 3829 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 AC117588.3-201ENSMUST00000228517 325 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Olfr1031-201ENSMUST00000050942 1011 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Olfr745-201ENSMUST00000062534 1175 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm24533-201ENSMUST00000083138 196 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Clhc1-204ENSMUST00000208530 2062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Vmn1r49-202ENSMUST00000203791 1356 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Olfr267-202ENSMUST00000216719 4050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Tfpi-204ENSMUST00000111714 3614 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm26423-201ENSMUST00000104277 128 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Hnmt-202ENSMUST00000114497 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm11488-201ENSMUST00000117277 863 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm12656-201ENSMUST00000118149 577 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm9001-201ENSMUST00000121642 399 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm15563-201ENSMUST00000124953 410 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm15733-201ENSMUST00000132957 242 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm22817-201ENSMUST00000157448 356 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm25557-201ENSMUST00000158084 315 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm25977-201ENSMUST00000158697 85 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm17061-201ENSMUST00000163167 499 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Cfap54-204ENSMUST00000164979 945 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm3486-201ENSMUST00000169361 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Zfp131-202ENSMUST00000178271 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Mup-ps7-201ENSMUST00000178292 545 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Mup-ps8-201ENSMUST00000178663 545 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Mup-ps9-201ENSMUST00000178847 545 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Mup-ps6-201ENSMUST00000179564 545 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm20619-204ENSMUST00000181343 786 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm27648-201ENSMUST00000184315 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm5731-201ENSMUST00000190969 481 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm38281-201ENSMUST00000192301 315 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Ighv1-17-1-201ENSMUST00000194849 351 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 4930437M23Rik-201ENSMUST00000197456 968 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Igkv13-62-1-201ENSMUST00000198690 317 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm43214-201ENSMUST00000199242 352 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm44076-201ENSMUST00000203072 520 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm43899-201ENSMUST00000203675 246 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm20039-201ENSMUST00000210329 394 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 AC160016.1-201ENSMUST00000215589 448 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 AC159380.1-201ENSMUST00000218096 121 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 LOC667541-201ENSMUST00000223408 278 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 AC160958.1-201ENSMUST00000224833 368 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 AC090496.1-201ENSMUST00000226020 260 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 AC121114.1-201ENSMUST00000228522 570 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Olfr1008-201ENSMUST00000054868 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Cd52-201ENSMUST00000000696 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Olfr776-201ENSMUST00000073704 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm21286-201ENSMUST00000098035 545 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Olfr1168-202ENSMUST00000215996 2322 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm4567-202ENSMUST00000190554 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm10668-202ENSMUST00000191073 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Pcdh11x-206ENSMUST00000192677 9097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm7869-201ENSMUST00000121457 1322 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm28359-201ENSMUST00000187470 1322 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Mrgprc2-ps-201ENSMUST00000188039 1516 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 A530053G22Rik-201ENSMUST00000060147 1526 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Olfr965-202ENSMUST00000213335 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Olfr355-201ENSMUST00000100147 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm23609-201ENSMUST00000104542 127 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Olfr160-201ENSMUST00000104875 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm14825-201ENSMUST00000113538 701 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm12739-201ENSMUST00000119769 382 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm6762-201ENSMUST00000121769 289 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm14564-201ENSMUST00000122159 294 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 1700046C09Rik-201ENSMUST00000139973 543 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm11998-201ENSMUST00000146304 972 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm22818-201ENSMUST00000157446 104 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
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Cln8Q9QUK3 Gm15946-201ENSMUST00000160654 423 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 1700129C05Rik-203ENSMUST00000162271 325 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 1700129C05Rik-204ENSMUST00000162674 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Mir5127-201ENSMUST00000175295 71 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Mir6411-201ENSMUST00000183556 108 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 2900035J10Rik-201ENSMUST00000194966 532 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm34091-201ENSMUST00000200875 604 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm5317-201ENSMUST00000204445 847 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm6112-201ENSMUST00000208037 629 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 AL929265.1-201ENSMUST00000213427 125 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm18903-201ENSMUST00000215343 480 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 AC153977.1-201ENSMUST00000219416 506 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 AC154552.3-201ENSMUST00000220741 444 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 AC133498.1-206ENSMUST00000223254 385 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 AC126275.2-201ENSMUST00000225224 253 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 AC166369.3-201ENSMUST00000227286 409 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Klra7-201ENSMUST00000032286 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 1110032A03Rik-202ENSMUST00000042576 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Olfr103-201ENSMUST00000058826 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm25131-201ENSMUST00000082653 151 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm24254-201ENSMUST00000083702 104 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Olfr877-201ENSMUST00000086063 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm43715-201ENSMUST00000196307 2715 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Olfr1226-202ENSMUST00000214709 5270 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Olfr1104-202ENSMUST00000214857 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm43875-201ENSMUST00000203319 2475 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Zfp709-201ENSMUST00000034259 2181 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Olfr298-202ENSMUST00000213223 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 2810403D21Rik-202ENSMUST00000124329 1660 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
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