Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm609-201ENSMUST00000114585 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Gm15195-201ENSMUST00000118775 263 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Gm13433-201ENSMUST00000121701 240 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Gm14559-201ENSMUST00000121745 496 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Gm26171-201ENSMUST00000158422 131 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Gm25069-201ENSMUST00000175238 86 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Gm23617-201ENSMUST00000175410 95 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 AU023070-201ENSMUST00000176972 387 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Gm37751-201ENSMUST00000192440 1198 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Obox4-ps24-201ENSMUST00000197686 540 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Gm45571-201ENSMUST00000209671 569 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Trdn-207ENSMUST00000219931 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 AC126554.4-201ENSMUST00000221055 409 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 AC144819.1-201ENSMUST00000227015 620 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Gm9174-201ENSMUST00000078149 255 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Olfr251-202ENSMUST00000214865 4930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Gm12580-201ENSMUST00000127456 1751 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Gm43662-201ENSMUST00000198310 2271 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Fat3-201ENSMUST00000082170 18456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Gm7135-202ENSMUST00000191257 1905 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 AC154552.6-201ENSMUST00000221365 1342 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Igkv8-16-201ENSMUST00000103392 362 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Mier1-203ENSMUST00000106855 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Gm27399-201ENSMUST00000184250 78 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Gm27952-201ENSMUST00000184748 105 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Gm38283-201ENSMUST00000193041 695 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Gm42828-201ENSMUST00000199669 469 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Gm43415-201ENSMUST00000201934 750 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 AC158622.1-201ENSMUST00000217107 230 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 AC153361.2-203ENSMUST00000218083 661 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Olfr790-204ENSMUST00000218901 1070 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 AC162376.1-201ENSMUST00000220120 435 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 AC211878.5-201ENSMUST00000221697 409 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 AC117656.3-205ENSMUST00000224606 1205 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Olfr790-201ENSMUST00000056002 1070 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Gm43879-201ENSMUST00000203811 3760 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Gm36969-201ENSMUST00000194551 2809 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Gm36669-201ENSMUST00000201757 3650 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Olfr1132-202ENSMUST00000216082 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Olfr109-204ENSMUST00000217602 5437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Trbv15-201ENSMUST00000103273 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Gm13868-201ENSMUST00000122411 294 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 C130026I21Rik-207ENSMUST00000162421 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Gm27153-201ENSMUST00000184492 407 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Gm29023-201ENSMUST00000190543 325 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Gm38008-201ENSMUST00000195333 518 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Gm17893-201ENSMUST00000203017 770 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Gm19253-201ENSMUST00000204279 307 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Gm44845-201ENSMUST00000208773 335 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Gm7588-201ENSMUST00000216866 571 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 AC111044.1-201ENSMUST00000220206 555 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 AC154224.1-201ENSMUST00000224367 403 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Olfr1370-201ENSMUST00000058168 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Olfr1469-201ENSMUST00000077538 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Gm23264-201ENSMUST00000083372 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r80-202ENSMUST00000227205 10892 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Olfr509-204ENSMUST00000215075 3418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r71-207ENSMUST00000228248 5469 ntAPPRIS P2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Gm37602-201ENSMUST00000195187 3310 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r74-202ENSMUST00000228471 6608 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 U2surp-202ENSMUST00000079659 7630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Olfr617-202ENSMUST00000215755 3000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Dmd-203ENSMUST00000114000 14910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Pak3-203ENSMUST00000112864 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Gm23472-201ENSMUST00000101806 191 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Gm13756-201ENSMUST00000117618 222 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Gm14159-201ENSMUST00000119832 451 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Gm15536-201ENSMUST00000121411 114 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Gm13555-201ENSMUST00000121668 319 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Tmsb15l-201ENSMUST00000127404 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Gm3848-202ENSMUST00000151564 301 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Gm22330-201ENSMUST00000158068 115 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Gm25025-201ENSMUST00000175018 111 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Gm24497-201ENSMUST00000177868 191 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Spin2f-201ENSMUST00000177990 765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Gm25939-201ENSMUST00000179876 191 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Gm27786-201ENSMUST00000184337 70 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Gm37543-201ENSMUST00000192443 1031 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 AC160999.1-201ENSMUST00000225675 810 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 AC107369.1-201ENSMUST00000227373 860 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Olfr497-201ENSMUST00000076406 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Gm5239-201ENSMUST00000081864 369 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Gm23444-201ENSMUST00000082922 191 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Mir365-2-201ENSMUST00000083555 112 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Olfr1133-201ENSMUST00000099855 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Gm43882-201ENSMUST00000204871 2264 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Gm12845-202ENSMUST00000204276 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Gm9495-201ENSMUST00000200846 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r45-208ENSMUST00000228662 3309 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Gm8935-201ENSMUST00000066794 2798 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Gm25938-201ENSMUST00000104139 166 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Gm24670-201ENSMUST00000104154 132 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Gm17146-201ENSMUST00000108464 372 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Gm14125-201ENSMUST00000113442 680 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Gm13314-201ENSMUST00000118742 335 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Gm12443-201ENSMUST00000122308 323 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Gm23889-201ENSMUST00000122689 104 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Gm11712-201ENSMUST00000129139 367 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Ppp1r2-ps7-201ENSMUST00000140102 609 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 161.5 ms