Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Gm14714-201ENSMUST00000119743 439 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Gm13717-201ENSMUST00000119868 365 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Gm15168-201ENSMUST00000121057 316 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Gm22597-201ENSMUST00000157602 80 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Gm16545-201ENSMUST00000161968 463 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Skint1-205ENSMUST00000162885 603 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Gm27385-201ENSMUST00000184747 104 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Gm37565-201ENSMUST00000192277 491 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Trbv11-201ENSMUST00000194354 260 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Gm30043-201ENSMUST00000196689 733 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Gm43700-201ENSMUST00000200967 316 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Gm45032-201ENSMUST00000205375 520 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 AC155921.1-201ENSMUST00000216568 3841 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 AC140285.1-201ENSMUST00000220472 452 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 AC154623.1-201ENSMUST00000224348 805 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Snord14e-201ENSMUST00000082857 90 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Gm16261-201ENSMUST00000096813 205 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Olfr235-202ENSMUST00000207969 2447 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 AC113059.2-201ENSMUST00000213462 3016 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Vmn1r43-203ENSMUST00000226741 12542 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 C130079G13Rik-201ENSMUST00000049476 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Nlrp2-201ENSMUST00000045022 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Fbxw24-201ENSMUST00000073962 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Txndc8-201ENSMUST00000102897 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Zfp972-203ENSMUST00000108986 192 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm11794-201ENSMUST00000119446 237 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm14269-201ENSMUST00000120455 306 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm2005-201ENSMUST00000120759 542 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm3669-202ENSMUST00000127852 397 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm2101-201ENSMUST00000128191 397 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm2165-205ENSMUST00000155337 397 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm22791-201ENSMUST00000157232 145 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm23496-201ENSMUST00000157741 248 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm22839-201ENSMUST00000158436 304 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm7925-201ENSMUST00000166690 401 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm22716-201ENSMUST00000177596 107 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm25671-201ENSMUST00000178612 105 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm23307-201ENSMUST00000179167 105 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm14527-201ENSMUST00000179300 639 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm25286-201ENSMUST00000179790 105 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Mir6410-201ENSMUST00000184204 104 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm23925-202ENSMUST00000188429 132 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 4930420N18Rik-201ENSMUST00000191831 676 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm19202-201ENSMUST00000198096 808 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm44648-201ENSMUST00000208267 329 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Olfr1478-ps1-201ENSMUST00000208393 391 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm38405-203ENSMUST00000208548 400 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 AC138290.2-201ENSMUST00000218822 369 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 CT030254.2-201ENSMUST00000225902 502 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm25853-201ENSMUST00000082793 132 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm26886-204ENSMUST00000181772 2085 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Olfr575-202ENSMUST00000213477 3512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm29325-201ENSMUST00000190705 2528 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm45211-201ENSMUST00000206208 2650 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Olfr875-202ENSMUST00000215128 2039 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Fbxw21-201ENSMUST00000054925 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
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RpainQ9CWY9 Olfr1020-202ENSMUST00000215347 2640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm42447-201ENSMUST00000200102 2903 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm45160-201ENSMUST00000207112 3099 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Olfr1341-202ENSMUST00000214131 4300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 9330158H04Rik-201ENSMUST00000101535 3174 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Klhl13-205ENSMUST00000115319 3349 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Mcmdc2-202ENSMUST00000118098 2072 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Scaper-205ENSMUST00000217647 4370 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
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RpainQ9CWY9 Gm43658-201ENSMUST00000202348 4176 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Olfr933-202ENSMUST00000216238 4475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
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RpainQ9CWY9 Gm7363-201ENSMUST00000119883 399 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
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RpainQ9CWY9 Vmn1r-ps32-201ENSMUST00000174389 956 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Btbd35f13-201ENSMUST00000177912 1701 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
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RpainQ9CWY9 Esp4-201ENSMUST00000178498 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm8649-201ENSMUST00000181799 233 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 1700010I02Rik-201ENSMUST00000187729 438 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm29020-201ENSMUST00000191166 290 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm18403-201ENSMUST00000192907 529 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm37749-201ENSMUST00000193917 1899 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Spcs2-202ENSMUST00000207063 727 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm5373-201ENSMUST00000212113 1050 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Olfr927-ps1-201ENSMUST00000216759 782 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 AC126554.1-201ENSMUST00000222161 271 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 AC121804.2-201ENSMUST00000222531 316 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 AC154626.1-201ENSMUST00000226070 311 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Scgb1a1-201ENSMUST00000025554 476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Olfr235-201ENSMUST00000073507 1079 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm22508-201ENSMUST00000082772 110 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm24610-201ENSMUST00000083270 109 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm25579-201ENSMUST00000083407 106 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm43882-201ENSMUST00000204871 2264 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm42616-201ENSMUST00000198989 4184 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Slco1a1-201ENSMUST00000042119 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Olfr919-202ENSMUST00000215612 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Olfr709-ps1-202ENSMUST00000215468 5078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
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