Protein–RNA interactions for Protein: Q99LU0

Chmp1b1, Charged multivesicular body protein 1b-1, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1b1Q99LU0 Gm26045-201ENSMUST00000157862 97 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Chmp1b1Q99LU0 Gm25224-201ENSMUST00000158195 68 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Chmp1b1Q99LU0 Gm16243-201ENSMUST00000160351 494 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Chmp1b1Q99LU0 Clec9a-203ENSMUST00000164513 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Chmp1b1Q99LU0 Gm6486-201ENSMUST00000166202 434 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Chmp1b1Q99LU0 Vmn1r-ps74-201ENSMUST00000173518 570 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Chmp1b1Q99LU0 Rpl48-ps1-201ENSMUST00000177147 556 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Chmp1b1Q99LU0 Gm21865-201ENSMUST00000177713 498 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Chmp1b1Q99LU0 Gm25874-201ENSMUST00000178030 79 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Chmp1b1Q99LU0 Gm11168-204ENSMUST00000179881 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Chmp1b1Q99LU0 Gm27535-201ENSMUST00000183814 157 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Chmp1b1Q99LU0 Gm20897-201ENSMUST00000185240 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Chmp1b1Q99LU0 Gm20883-201ENSMUST00000185245 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Chmp1b1Q99LU0 Gm20916-202ENSMUST00000185338 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Chmp1b1Q99LU0 Gm28897-201ENSMUST00000185340 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Chmp1b1Q99LU0 Gm20736-202ENSMUST00000185550 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Chmp1b1Q99LU0 Gm20835-201ENSMUST00000185565 923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Chmp1b1Q99LU0 Gm29564-201ENSMUST00000185575 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Chmp1b1Q99LU0 Gm29299-201ENSMUST00000185609 923 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Chmp1b1Q99LU0 Gm21317-201ENSMUST00000185636 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Chmp1b1Q99LU0 Gm21095-202ENSMUST00000185776 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Chmp1b1Q99LU0 Gm28553-201ENSMUST00000185924 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Chmp1b1Q99LU0 Gm20908-201ENSMUST00000186004 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Chmp1b1Q99LU0 Gm28598-201ENSMUST00000186490 615 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Chmp1b1Q99LU0 Gm20906-201ENSMUST00000186493 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Chmp1b1Q99LU0 Gm20929-201ENSMUST00000186578 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Chmp1b1Q99LU0 Gm20824-201ENSMUST00000186739 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Chmp1b1Q99LU0 Gm21518-202ENSMUST00000186938 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Chmp1b1Q99LU0 Gm20855-202ENSMUST00000186996 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Chmp1b1Q99LU0 Gm20911-201ENSMUST00000187135 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Chmp1b1Q99LU0 Gm28102-201ENSMUST00000187146 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Chmp1b1Q99LU0 Gm28827-201ENSMUST00000187165 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Chmp1b1Q99LU0 Gm20931-202ENSMUST00000187293 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Chmp1b1Q99LU0 Gm21760-202ENSMUST00000187433 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Chmp1b1Q99LU0 Gm20920-201ENSMUST00000187477 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Chmp1b1Q99LU0 Gm21627-201ENSMUST00000187768 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Chmp1b1Q99LU0 Gm29554-201ENSMUST00000187922 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Chmp1b1Q99LU0 Gm29268-201ENSMUST00000188669 615 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Chmp1b1Q99LU0 Gm20850-201ENSMUST00000188672 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Chmp1b1Q99LU0 Gm21488-201ENSMUST00000188744 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Chmp1b1Q99LU0 Gm20820-201ENSMUST00000188754 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Chmp1b1Q99LU0 Gm20894-201ENSMUST00000188864 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Chmp1b1Q99LU0 Gm20869-201ENSMUST00000188958 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Chmp1b1Q99LU0 Gm21173-201ENSMUST00000189238 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
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Chmp1b1Q99LU0 Gm20903-201ENSMUST00000189346 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Chmp1b1Q99LU0 Gm21209-202ENSMUST00000189354 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Chmp1b1Q99LU0 Gm20937-203ENSMUST00000189422 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Chmp1b1Q99LU0 Gm20890-201ENSMUST00000189518 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Chmp1b1Q99LU0 Gm21477-202ENSMUST00000189543 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Chmp1b1Q99LU0 Gm29110-201ENSMUST00000189924 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
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Chmp1b1Q99LU0 Gm20814-201ENSMUST00000190173 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Chmp1b1Q99LU0 Gm29573-201ENSMUST00000190291 919 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Chmp1b1Q99LU0 Sly-202ENSMUST00000190292 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Chmp1b1Q99LU0 Gm21650-202ENSMUST00000190551 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Chmp1b1Q99LU0 Gm20905-201ENSMUST00000190782 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Chmp1b1Q99LU0 Gm29218-205ENSMUST00000190846 615 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Chmp1b1Q99LU0 Gm28978-201ENSMUST00000191120 615 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Chmp1b1Q99LU0 Gm20817-201ENSMUST00000191123 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Chmp1b1Q99LU0 Gm21258-202ENSMUST00000191553 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Chmp1b1Q99LU0 Gm29866-201ENSMUST00000191675 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Chmp1b1Q99LU0 Gm37172-201ENSMUST00000191926 615 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Chmp1b1Q99LU0 Gm31571-201ENSMUST00000192521 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
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Chmp1b1Q99LU0 Igkv11-114-201ENSMUST00000200013 346 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Chmp1b1Q99LU0 Gm44355-201ENSMUST00000200417 104 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Chmp1b1Q99LU0 Gm43975-201ENSMUST00000203023 481 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Chmp1b1Q99LU0 Gm45146-201ENSMUST00000207108 221 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Chmp1b1Q99LU0 Olfr581-ps1-201ENSMUST00000209214 556 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Chmp1b1Q99LU0 Gm34779-201ENSMUST00000210036 263 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Chmp1b1Q99LU0 AC161520.1-201ENSMUST00000210954 939 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Chmp1b1Q99LU0 Olfr542-ps1-201ENSMUST00000211706 831 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Chmp1b1Q99LU0 AC093926.1-201ENSMUST00000213730 243 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Chmp1b1Q99LU0 AC167250.1-201ENSMUST00000213739 3813 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Chmp1b1Q99LU0 Olfr27-202ENSMUST00000216405 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Chmp1b1Q99LU0 AC160865.1-201ENSMUST00000219873 151 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Chmp1b1Q99LU0 Gm38560-201ENSMUST00000220169 646 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Chmp1b1Q99LU0 Gm4036-201ENSMUST00000220842 626 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Chmp1b1Q99LU0 Gm7119-201ENSMUST00000221345 695 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Chmp1b1Q99LU0 Gm18026-201ENSMUST00000222789 727 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Chmp1b1Q99LU0 AC168059.2-201ENSMUST00000224473 333 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Chmp1b1Q99LU0 AC133598.4-202ENSMUST00000225267 469 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Chmp1b1Q99LU0 Gm22265-201ENSMUST00000082947 116 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Chmp1b1Q99LU0 Vmn1r81-201ENSMUST00000086232 921 ntAPPRIS P2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Chmp1b1Q99LU0 Olfr1154-201ENSMUST00000099844 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Chmp1b1Q99LU0 Gm8011-201ENSMUST00000172163 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Chmp1b1Q99LU0 Gm43665-201ENSMUST00000198672 1659 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Chmp1b1Q99LU0 Gm44120-201ENSMUST00000203022 3023 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Chmp1b1Q99LU0 Zfp493-201ENSMUST00000164936 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Chmp1b1Q99LU0 Prl7d1-203ENSMUST00000224026 3657 ntAPPRIS P2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Chmp1b1Q99LU0 Olfr361-203ENSMUST00000216663 2617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Chmp1b1Q99LU0 Vmn2r90-201ENSMUST00000169805 2592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Chmp1b1Q99LU0 Vmn1r89-202ENSMUST00000226717 4120 ntAPPRIS P2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Chmp1b1Q99LU0 Olfr109-203ENSMUST00000214938 5550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Chmp1b1Q99LU0 Trbv13-1-201ENSMUST00000103268 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Chmp1b1Q99LU0 Gm11110-201ENSMUST00000112915 1013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
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