Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 Gm37834-201ENSMUST00000194517 3035 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Clcn1Q64347 Olfr403-202ENSMUST00000206114 3444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Clcn1Q64347 Zfp106-211ENSMUST00000171215 6391 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Clcn1Q64347 Zfp26-203ENSMUST00000159569 11276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Clcn1Q64347 Nme7-202ENSMUST00000191947 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Clcn1Q64347 Gm3696-201ENSMUST00000167923 1814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Clcn1Q64347 Gm43210-201ENSMUST00000196743 6152 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Clcn1Q64347 AC126439.1-201ENSMUST00000226772 2104 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Clcn1Q64347 Gabra6-201ENSMUST00000020703 2436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Clcn1Q64347 Slc39a12-202ENSMUST00000114731 2648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Clcn1Q64347 Vmn1r169-205ENSMUST00000228832 2749 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Clcn1Q64347 AC162908.1-201ENSMUST00000219164 4563 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Clcn1Q64347 Ktn1-203ENSMUST00000185940 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Clcn1Q64347 Gm25537-201ENSMUST00000103851 109 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Clcn1Q64347 Gm25419-201ENSMUST00000104215 191 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Clcn1Q64347 Mir743b-201ENSMUST00000104751 77 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Clcn1Q64347 Gm16019-201ENSMUST00000149538 261 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Clcn1Q64347 Gm24175-201ENSMUST00000158931 129 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Clcn1Q64347 Gm27528-201ENSMUST00000183544 205 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Clcn1Q64347 Gm23925-202ENSMUST00000188429 132 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Clcn1Q64347 Gm9775-201ENSMUST00000189402 331 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Clcn1Q64347 Gm29140-201ENSMUST00000190187 476 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Clcn1Q64347 Mir691-201ENSMUST00000199719 78 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Clcn1Q64347 Rho-205ENSMUST00000203877 939 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Clcn1Q64347 Gm45083-201ENSMUST00000205216 712 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Clcn1Q64347 1700026F02Rik-205ENSMUST00000212266 787 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Clcn1Q64347 AC158955.1-201ENSMUST00000227140 385 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Clcn1Q64347 Gm25815-201ENSMUST00000082755 107 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Clcn1Q64347 Olfr716-206ENSMUST00000215284 3515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Clcn1Q64347 Gm43085-201ENSMUST00000202859 3132 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Clcn1Q64347 Gm37205-201ENSMUST00000194820 2736 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Clcn1Q64347 Gm37268-201ENSMUST00000192254 2614 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Clcn1Q64347 Vmn1r178-203ENSMUST00000226489 2644 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Clcn1Q64347 F13a1-201ENSMUST00000037491 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Clcn1Q64347 Gm37767-201ENSMUST00000193239 1834 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Clcn1Q64347 Zfp995-201ENSMUST00000106026 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Clcn1Q64347 Gbp7-201ENSMUST00000045097 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Clcn1Q64347 Slc22a22-202ENSMUST00000110196 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Clcn1Q64347 Vmn1r201-203ENSMUST00000226965 4741 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Clcn1Q64347 Pramef6-202ENSMUST00000105767 1967 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Clcn1Q64347 Gm19619-201ENSMUST00000200707 3201 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Clcn1Q64347 Gm7792-201ENSMUST00000201555 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Clcn1Q64347 Olfr78-204ENSMUST00000217123 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Clcn1Q64347 Olfr1493-ps1-202ENSMUST00000208667 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Clcn1Q64347 Gm14101-201ENSMUST00000121502 473 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Clcn1Q64347 Olfr660-ps1-201ENSMUST00000121526 375 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Clcn1Q64347 Gm12110-201ENSMUST00000121601 579 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Clcn1Q64347 Gm22097-201ENSMUST00000157929 278 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Clcn1Q64347 Gm16378-201ENSMUST00000179168 342 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Clcn1Q64347 Gm27492-201ENSMUST00000185194 187 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Clcn1Q64347 Gm7837-201ENSMUST00000190873 412 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Clcn1Q64347 Igkv13-78-1-201ENSMUST00000199298 200 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Clcn1Q64347 Gm4321-201ENSMUST00000200520 442 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Clcn1Q64347 4930505K13Rik-201ENSMUST00000208641 546 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Clcn1Q64347 AC158798.1-201ENSMUST00000219714 711 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Clcn1Q64347 Gm5045-201ENSMUST00000027054 810 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Clcn1Q64347 Gm5265-201ENSMUST00000076828 342 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Clcn1Q64347 Zscan4a-201ENSMUST00000210573 2279 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Clcn1Q64347 Zfp101-201ENSMUST00000167107 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Clcn1Q64347 Olfr1262-202ENSMUST00000111508 6068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Clcn1Q64347 Olfr364-ps1-201ENSMUST00000104995 1766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Clcn1Q64347 Wdr64-201ENSMUST00000094288 3817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Clcn1Q64347 Sult1d1-201ENSMUST00000113314 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Clcn1Q64347 AC116797.2-201ENSMUST00000224763 4221 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Clcn1Q64347 Gm830-201ENSMUST00000142458 3502 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Clcn1Q64347 Olfr1195-202ENSMUST00000213545 2585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Clcn1Q64347 Olfr1564-202ENSMUST00000208645 5213 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Clcn1Q64347 Slamf6-207ENSMUST00000195656 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Clcn1Q64347 Trbv17-201ENSMUST00000103275 374 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Clcn1Q64347 Gm14971-201ENSMUST00000117980 663 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Clcn1Q64347 Gm11822-201ENSMUST00000119177 415 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Clcn1Q64347 Ogt-202ENSMUST00000119299 3840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Clcn1Q64347 Gm12281-201ENSMUST00000119536 298 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Clcn1Q64347 Gm5384-201ENSMUST00000120313 463 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Clcn1Q64347 Gm13396-201ENSMUST00000120617 271 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Clcn1Q64347 Gm11849-201ENSMUST00000121293 261 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Clcn1Q64347 Gm15905-201ENSMUST00000137042 298 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Clcn1Q64347 Crem-235ENSMUST00000154705 529 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Clcn1Q64347 Gm10075-201ENSMUST00000162030 545 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Clcn1Q64347 Gm20484-201ENSMUST00000173738 231 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Clcn1Q64347 Gm20711-201ENSMUST00000177351 714 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Clcn1Q64347 Gm27421-201ENSMUST00000184729 167 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Clcn1Q64347 Gm6075-201ENSMUST00000186816 486 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Clcn1Q64347 Gm38098-201ENSMUST00000194115 241 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Clcn1Q64347 Gm6059-201ENSMUST00000196903 340 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Clcn1Q64347 Gm29884-201ENSMUST00000218403 453 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Clcn1Q64347 2610044O15Rik8-201ENSMUST00000079272 264 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Clcn1Q64347 Olfr506-202ENSMUST00000209296 3228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Clcn1Q64347 Xcr1-201ENSMUST00000182350 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Clcn1Q64347 Gm381-201ENSMUST00000117443 2037 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Clcn1Q64347 Cep112os1-201ENSMUST00000137907 3005 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Clcn1Q64347 Zscan4f-202ENSMUST00000145237 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Clcn1Q64347 Gm12185-201ENSMUST00000059930 5252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Clcn1Q64347 Nop58-215ENSMUST00000191142 9507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Clcn1Q64347 Olfr362-202ENSMUST00000213817 4059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Clcn1Q64347 Herc1-201ENSMUST00000042824 15153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Clcn1Q64347 Gm10635-201ENSMUST00000217201 3721 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Clcn1Q64347 Mmp8-201ENSMUST00000018765 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Clcn1Q64347 Far1-202ENSMUST00000067929 4935 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Clcn1Q64347 Nlrp4a-201ENSMUST00000068767 4259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79 ms