Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm6207-201ENSMUST00000120075 1386 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Ccdc18Q640L5 Gm6228-201ENSMUST00000178856 1386 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Ccdc18Q640L5 AC154552.6-201ENSMUST00000221365 1342 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Ccdc18Q640L5 n-R5s200-201ENSMUST00000104194 113 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Ccdc18Q640L5 Gm13862-201ENSMUST00000121220 197 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Ccdc18Q640L5 Gm16232-201ENSMUST00000162856 167 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Ccdc18Q640L5 Gm26621-201ENSMUST00000180413 700 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Ccdc18Q640L5 Gm45150-201ENSMUST00000206051 467 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Ccdc18Q640L5 Olfr1129-203ENSMUST00000214773 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Ccdc18Q640L5 Zfp873-201ENSMUST00000105313 1893 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
Ccdc18Q640L5 Gm37470-201ENSMUST00000193378 2798 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Ccdc18Q640L5 Gm23424-201ENSMUST00000103889 110 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Ccdc18Q640L5 1700063A18Rik-201ENSMUST00000190901 356 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
Ccdc18Q640L5 Gm37629-201ENSMUST00000193635 1050 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Ccdc18Q640L5 Gm7588-201ENSMUST00000216866 571 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Ccdc18Q640L5 Gm8274-201ENSMUST00000219820 463 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Ccdc18Q640L5 Dst-211ENSMUST00000183034 23201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Ccdc18Q640L5 Gm37602-201ENSMUST00000195187 3310 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Ccdc18Q640L5 Olfr592-203ENSMUST00000218618 5978 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Ccdc18Q640L5 Olfr910-201ENSMUST00000215122 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Ccdc18Q640L5 Gm14877-201ENSMUST00000119803 478 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Ccdc18Q640L5 Klra17-202ENSMUST00000122219 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
Ccdc18Q640L5 Gm15178-201ENSMUST00000132100 472 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Ccdc18Q640L5 Gm29012-201ENSMUST00000187882 469 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Ccdc18Q640L5 Olfr907-202ENSMUST00000214003 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Ccdc18Q640L5 Olfr1133-201ENSMUST00000099855 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Ccdc18Q640L5 Olfr1308-202ENSMUST00000207560 2093 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Ccdc18Q640L5 Gm43540-201ENSMUST00000196320 3848 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Ccdc18Q640L5 Olfr836-202ENSMUST00000212730 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Ccdc18Q640L5 Olfr747-204ENSMUST00000213238 1416 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Ccdc18Q640L5 Olfr681-205ENSMUST00000216247 4729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Ccdc18Q640L5 Gm45483-201ENSMUST00000209845 1682 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Ccdc18Q640L5 Pcdh11x-206ENSMUST00000192677 9097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Ccdc18Q640L5 Gm11285-201ENSMUST00000118443 322 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Ccdc18Q640L5 Gm12849-201ENSMUST00000120013 739 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Ccdc18Q640L5 Gm16355-201ENSMUST00000128606 231 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Ccdc18Q640L5 Olfr187-201ENSMUST00000206428 978 ntAPPRIS P1 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Ccdc18Q640L5 AC153955.1-201ENSMUST00000217458 663 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Ccdc18Q640L5 4930455B14Rik-203ENSMUST00000223613 640 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Ccdc18Q640L5 AC160999.1-201ENSMUST00000225675 810 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Ccdc18Q640L5 Olfr478-201ENSMUST00000049719 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Ccdc18Q640L5 Gm7135-202ENSMUST00000191257 1905 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Ccdc18Q640L5 Csmd3-204ENSMUST00000160658 12460 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Ccdc18Q640L5 Gm26077-201ENSMUST00000104064 123 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Ccdc18Q640L5 Vmn1r-ps45-201ENSMUST00000174106 955 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Ccdc18Q640L5 2310010J17Rik-201ENSMUST00000181189 490 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
Ccdc18Q640L5 Gm37579-201ENSMUST00000194291 142 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Ccdc18Q640L5 AC158598.1-201ENSMUST00000214349 3847 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Ccdc18Q640L5 AC126673.3-201ENSMUST00000223414 3829 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Ccdc18Q640L5 AC124104.1-201ENSMUST00000226279 417 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Ccdc18Q640L5 AC131720.1-201ENSMUST00000218629 2132 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Ccdc18Q640L5 AC125374.3-201ENSMUST00000214983 2810 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Ccdc18Q640L5 Trdn-201ENSMUST00000095762 4514 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Ccdc18Q640L5 Gm42483-201ENSMUST00000197556 1742 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Ccdc18Q640L5 Olfr1225-202ENSMUST00000216961 3231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Ccdc18Q640L5 Snora36b-201ENSMUST00000104383 132 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Ccdc18Q640L5 Gm24601-201ENSMUST00000157970 143 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Ccdc18Q640L5 Rpl26-ps4-201ENSMUST00000170279 438 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Ccdc18Q640L5 Gm22192-201ENSMUST00000175128 85 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Ccdc18Q640L5 Gm19257-201ENSMUST00000186121 183 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Ccdc18Q640L5 Gm28724-202ENSMUST00000194218 295 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Ccdc18Q640L5 Gm38216-201ENSMUST00000194872 1214 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Ccdc18Q640L5 AC168062.3-201ENSMUST00000227025 165 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Ccdc18Q640L5 Olfr1370-201ENSMUST00000058168 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Ccdc18Q640L5 Olfr825-201ENSMUST00000076814 1159 ntAPPRIS P1 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Ccdc18Q640L5 Gm25632-201ENSMUST00000083112 85 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Ccdc18Q640L5 4930467E23Rik-201ENSMUST00000098909 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Ccdc18Q640L5 Gm37895-201ENSMUST00000192448 4550 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Ccdc18Q640L5 5930409G06Rik-201ENSMUST00000192347 1544 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Ccdc18Q640L5 Gm12022-201ENSMUST00000143311 1340 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
Ccdc18Q640L5 Snord14c-201ENSMUST00000101927 86 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Ccdc18Q640L5 Gm38283-201ENSMUST00000193041 695 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Ccdc18Q640L5 Ighv1-79-201ENSMUST00000200152 350 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Ccdc18Q640L5 Gm45395-201ENSMUST00000209891 559 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Ccdc18Q640L5 AC172751.1-201ENSMUST00000226887 440 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Ccdc18Q640L5 AC118639.1-201ENSMUST00000227204 338 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Ccdc18Q640L5 Snord21-201ENSMUST00000082519 94 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Ccdc18Q640L5 Gm25636-201ENSMUST00000082666 133 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Ccdc18Q640L5 Gm43320-201ENSMUST00000196047 2916 ntBASIC3.9□□□□□ -1.78
Ccdc18Q640L5 Gm7173-205ENSMUST00000197180 9412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
Ccdc18Q640L5 Oog1-203ENSMUST00000222332 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Ccdc18Q640L5 Gm6373-201ENSMUST00000121026 360 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Ccdc18Q640L5 Mrgprb13-201ENSMUST00000188191 985 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Ccdc18Q640L5 4930448F12Rik-201ENSMUST00000220795 859 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
Ccdc18Q640L5 Olfr194-201ENSMUST00000072608 921 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Ccdc18Q640L5 Olfr203-201ENSMUST00000089305 924 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Ccdc18Q640L5 Gm45159-201ENSMUST00000208630 25241 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Ccdc18Q640L5 Olfr361-203ENSMUST00000216663 2617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Ccdc18Q640L5 Crisp1-201ENSMUST00000026498 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
Ccdc18Q640L5 Mir758-201ENSMUST00000103260 81 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Ccdc18Q640L5 Rps27-ps1-201ENSMUST00000118179 246 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Ccdc18Q640L5 Gm11414-201ENSMUST00000121795 263 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Ccdc18Q640L5 Gm22517-201ENSMUST00000158265 136 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Ccdc18Q640L5 Gm23005-201ENSMUST00000158950 136 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Ccdc18Q640L5 Agmo-205ENSMUST00000160768 741 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
Ccdc18Q640L5 Gm27330-201ENSMUST00000184689 132 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Ccdc18Q640L5 Gm19418-201ENSMUST00000197436 580 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Ccdc18Q640L5 Rpl27-ps2-201ENSMUST00000120378 399 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Ccdc18Q640L5 Gm12042-201ENSMUST00000120479 301 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Ccdc18Q640L5 n-R5s164-201ENSMUST00000122664 112 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.3 ms