Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A3

Trdv4, T cell receptor delta variable 4 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv4Q5R1A3 Mrgprb1-202ENSMUST00000188095 472 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Trdv4Q5R1A3 Gm21497-201ENSMUST00000189455 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Trdv4Q5R1A3 Gm28654-201ENSMUST00000189801 379 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Trdv4Q5R1A3 Gm29516-201ENSMUST00000190402 468 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Trdv4Q5R1A3 Gm20811-201ENSMUST00000190500 553 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Trdv4Q5R1A3 Gm38333-201ENSMUST00000193608 604 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Trdv4Q5R1A3 4930558C23Rik-201ENSMUST00000196239 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Trdv4Q5R1A3 Gm44349-201ENSMUST00000197048 123 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Trdv4Q5R1A3 Gm42621-201ENSMUST00000198114 275 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Trdv4Q5R1A3 Gm43415-201ENSMUST00000201934 750 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Trdv4Q5R1A3 Gm39380-201ENSMUST00000214710 192 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Trdv4Q5R1A3 Gm18903-201ENSMUST00000215343 480 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Trdv4Q5R1A3 Vmn1r-ps50-201ENSMUST00000216908 453 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Trdv4Q5R1A3 AC087891.1-201ENSMUST00000217867 318 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Trdv4Q5R1A3 AC158631.1-201ENSMUST00000219202 138 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Trdv4Q5R1A3 AC141642.1-201ENSMUST00000220598 229 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Trdv4Q5R1A3 AC159239.1-201ENSMUST00000221767 603 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Trdv4Q5R1A3 Gm9628-201ENSMUST00000222169 725 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Trdv4Q5R1A3 Sult3a2-202ENSMUST00000223295 930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Trdv4Q5R1A3 AC091783.5-201ENSMUST00000224928 671 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Trdv4Q5R1A3 AC090496.1-201ENSMUST00000226020 260 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Trdv4Q5R1A3 AC154252.1-201ENSMUST00000226041 473 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Trdv4Q5R1A3 CT025157.1-201ENSMUST00000226241 292 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Trdv4Q5R1A3 Olfr854-201ENSMUST00000072419 948 ntAPPRIS P2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Trdv4Q5R1A3 Olfr1487-201ENSMUST00000076856 948 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Trdv4Q5R1A3 Gm10058-201ENSMUST00000079797 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Trdv4Q5R1A3 Gm24035-201ENSMUST00000082867 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Trdv4Q5R1A3 Mir27a-201ENSMUST00000083510 87 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Trdv4Q5R1A3 Defb33-201ENSMUST00000098908 424 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Trdv4Q5R1A3 Olfr1141-201ENSMUST00000099846 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Trdv4Q5R1A3 1110015O18Rik-202ENSMUST00000183944 1533 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Trdv4Q5R1A3 Olfr744-203ENSMUST00000216690 1765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Trdv4Q5R1A3 Olfr1211-204ENSMUST00000215205 4220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Trdv4Q5R1A3 Gm44715-201ENSMUST00000209049 3839 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Trdv4Q5R1A3 Olfr1454-203ENSMUST00000214695 4049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Trdv4Q5R1A3 AC154634.4-201ENSMUST00000226077 2665 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trdv4Q5R1A3 Gm45662-201ENSMUST00000210054 2098 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trdv4Q5R1A3 Gm12010-201ENSMUST00000122400 2017 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trdv4Q5R1A3 Igkv1-110-201ENSMUST00000103321 401 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Trdv4Q5R1A3 Igkv5-48-201ENSMUST00000103364 360 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Trdv4Q5R1A3 Gm16431-201ENSMUST00000117454 431 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trdv4Q5R1A3 Gm13678-201ENSMUST00000118926 340 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trdv4Q5R1A3 Gm13064-201ENSMUST00000119125 557 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trdv4Q5R1A3 Gm6664-201ENSMUST00000119138 468 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trdv4Q5R1A3 Gm15452-201ENSMUST00000119877 240 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trdv4Q5R1A3 Gm12607-201ENSMUST00000120724 493 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trdv4Q5R1A3 Gm6591-201ENSMUST00000121063 434 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trdv4Q5R1A3 Snrpert-201ENSMUST00000121967 279 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trdv4Q5R1A3 Gm6182-201ENSMUST00000156439 1208 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trdv4Q5R1A3 Gm22277-201ENSMUST00000157204 277 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trdv4Q5R1A3 Gm22059-201ENSMUST00000157544 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trdv4Q5R1A3 Mir1934-201ENSMUST00000158127 83 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trdv4Q5R1A3 Ear-ps10-201ENSMUST00000161871 460 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trdv4Q5R1A3 Gm3298-201ENSMUST00000165289 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Trdv4Q5R1A3 Gm8206-202ENSMUST00000168733 516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Trdv4Q5R1A3 Vmn1r-ps34-201ENSMUST00000174046 943 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trdv4Q5R1A3 Gm24819-201ENSMUST00000175094 166 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trdv4Q5R1A3 Vmn1r-ps49-201ENSMUST00000177009 879 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trdv4Q5R1A3 Gm22108-201ENSMUST00000177961 106 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trdv4Q5R1A3 Gm24798-201ENSMUST00000179334 106 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trdv4Q5R1A3 Mir6413-201ENSMUST00000184049 108 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trdv4Q5R1A3 Gm28560-201ENSMUST00000186091 315 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trdv4Q5R1A3 Gm28334-201ENSMUST00000186653 315 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trdv4Q5R1A3 Gm29064-201ENSMUST00000187014 813 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trdv4Q5R1A3 Gm29633-204ENSMUST00000187737 675 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Trdv4Q5R1A3 Gm28495-201ENSMUST00000188452 315 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trdv4Q5R1A3 Gm28232-201ENSMUST00000188683 315 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trdv4Q5R1A3 Gm28481-201ENSMUST00000189231 315 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trdv4Q5R1A3 Gm29059-201ENSMUST00000191534 315 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trdv4Q5R1A3 Gm37803-201ENSMUST00000191620 711 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Trdv4Q5R1A3 Gm37765-201ENSMUST00000192395 315 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trdv4Q5R1A3 Gm37237-201ENSMUST00000192893 315 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trdv4Q5R1A3 Gm37972-201ENSMUST00000193497 379 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Trdv4Q5R1A3 Gm20162-201ENSMUST00000193629 871 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trdv4Q5R1A3 Gm37097-201ENSMUST00000193676 336 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trdv4Q5R1A3 Gm36968-201ENSMUST00000193737 315 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trdv4Q5R1A3 Gm38290-201ENSMUST00000195238 315 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trdv4Q5R1A3 Gm43070-201ENSMUST00000196938 415 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trdv4Q5R1A3 Gm44927-201ENSMUST00000207573 716 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trdv4Q5R1A3 Gm18602-201ENSMUST00000209794 851 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trdv4Q5R1A3 Gm45245-201ENSMUST00000210082 376 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trdv4Q5R1A3 CT009748.1-201ENSMUST00000216068 269 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Trdv4Q5R1A3 Prl7d1-201ENSMUST00000021776 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Trdv4Q5R1A3 AC155929.1-201ENSMUST00000220217 1276 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trdv4Q5R1A3 AC154506.3-201ENSMUST00000225417 213 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trdv4Q5R1A3 AC154598.1-201ENSMUST00000227079 347 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trdv4Q5R1A3 Olfr970-201ENSMUST00000071132 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Trdv4Q5R1A3 Gm2710-201ENSMUST00000073196 603 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trdv4Q5R1A3 Vmn1r229-201ENSMUST00000076759 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Trdv4Q5R1A3 Gm22304-201ENSMUST00000082688 129 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trdv4Q5R1A3 Mgat4c-212ENSMUST00000179929 4272 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Trdv4Q5R1A3 Ccr2-202ENSMUST00000165984 3515 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Trdv4Q5R1A3 Ifi203-ps-201ENSMUST00000155076 2556 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trdv4Q5R1A3 Sult2a8-201ENSMUST00000063509 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Trdv4Q5R1A3 Vmn1r21-202ENSMUST00000203488 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Trdv4Q5R1A3 Gabra2-203ENSMUST00000197284 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Trdv4Q5R1A3 Gm43923-201ENSMUST00000203992 2911 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trdv4Q5R1A3 Olfr361-203ENSMUST00000216663 2617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Trdv4Q5R1A3 Macf1-203ENSMUST00000097897 23495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Trdv4Q5R1A3 2810428J06Rik-201ENSMUST00000198336 2696 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.9 ms