Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Gm15018-201ENSMUST00000117090 633 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Olfr1327-ps1-201ENSMUST00000117953 835 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm11285-201ENSMUST00000118443 322 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm15988-201ENSMUST00000118677 367 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm11429-201ENSMUST00000119089 144 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm12507-201ENSMUST00000119155 415 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm7219-201ENSMUST00000119619 297 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm13210-201ENSMUST00000121483 273 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm15065-201ENSMUST00000121699 273 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm11414-201ENSMUST00000121795 263 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Snrpert-201ENSMUST00000121967 279 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Zfp931-204ENSMUST00000131702 704 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm16274-201ENSMUST00000139251 592 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm22637-201ENSMUST00000158144 283 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm24503-201ENSMUST00000158454 135 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm25906-201ENSMUST00000158489 126 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm16236-201ENSMUST00000159588 379 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Vmn1r238-201ENSMUST00000165255 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm5967-201ENSMUST00000172723 494 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Snord53-201ENSMUST00000175146 78 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Olfr1187-ps1-201ENSMUST00000177576 334 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm2950-201ENSMUST00000185530 520 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm18800-202ENSMUST00000188688 1105 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm29740-201ENSMUST00000193182 655 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 9530097N15Rik-201ENSMUST00000197819 1068 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm43228-201ENSMUST00000200735 264 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Lyrm1-209ENSMUST00000208424 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Olfr1464-ps1-201ENSMUST00000208760 923 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 CT573422.1-201ENSMUST00000216655 405 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 AC161254.1-201ENSMUST00000220310 3842 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 S100z-201ENSMUST00000022186 399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 AC154552.4-201ENSMUST00000222171 151 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 CT030184.1-201ENSMUST00000222393 416 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 AC154198.1-201ENSMUST00000222839 424 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 AC166113.1-201ENSMUST00000225258 475 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 AC130823.2-201ENSMUST00000226169 290 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 AC108416.2-201ENSMUST00000226792 367 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 1110032A03Rik-202ENSMUST00000042576 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm9765-201ENSMUST00000043170 321 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Vmn1r79-201ENSMUST00000062811 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Scgb1b2-201ENSMUST00000080635 424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 4930512M02Rik-201ENSMUST00000081896 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm26203-201ENSMUST00000082911 114 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 n-R5s85-201ENSMUST00000083453 113 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Xlr5c-201ENSMUST00000088450 540 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm27013-202ENSMUST00000205067 1436 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm42614-201ENSMUST00000198724 1554 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm7739-201ENSMUST00000221131 1560 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm42445-201ENSMUST00000196996 2893 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Lrif1-201ENSMUST00000098750 3103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
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Trappc1Q5NCF2 Gm12268-201ENSMUST00000118398 442 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
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Trappc1Q5NCF2 Gm37708-201ENSMUST00000192337 895 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
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Trappc1Q5NCF2 4930503O07Rik-201ENSMUST00000193395 578 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
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Trappc1Q5NCF2 4930453C13Rik-201ENSMUST00000222376 765 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm18026-201ENSMUST00000222789 727 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm7745-202ENSMUST00000222914 567 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 AC165366.1-201ENSMUST00000225905 505 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 AC122448.1-201ENSMUST00000226317 772 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Prr32-201ENSMUST00000040002 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Olfr513-201ENSMUST00000055146 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
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Trappc1Q5NCF2 Gm6030-201ENSMUST00000078768 402 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm25126-201ENSMUST00000083343 102 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
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Trappc1Q5NCF2 Gm8935-201ENSMUST00000066794 2798 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm5127-201ENSMUST00000101296 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Tlr7-202ENSMUST00000112161 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Vmn1r29-204ENSMUST00000228038 4520 ntAPPRIS P1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Vmn2r38-201ENSMUST00000108554 3663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Mrpl1-203ENSMUST00000121477 1550 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Omd-201ENSMUST00000065494 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
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