Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Otx2os1-201ENSMUST00000183522 866 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ssbp4Q3U4B1 Ranbp2-ps8-201ENSMUST00000183723 345 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Ssbp4Q3U4B1 Mir6401-201ENSMUST00000184499 109 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm20897-201ENSMUST00000185240 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm20883-201ENSMUST00000185245 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm20916-202ENSMUST00000185338 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm28897-201ENSMUST00000185340 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm20736-202ENSMUST00000185550 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm20835-201ENSMUST00000185565 923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm29564-201ENSMUST00000185575 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm29299-201ENSMUST00000185609 923 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm21317-201ENSMUST00000185636 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm21858-202ENSMUST00000185713 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm28553-201ENSMUST00000185924 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm20908-201ENSMUST00000186004 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm21409-201ENSMUST00000186110 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm20906-201ENSMUST00000186493 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm20929-201ENSMUST00000186578 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm20824-201ENSMUST00000186739 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm17929-201ENSMUST00000186851 627 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm21518-202ENSMUST00000186938 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm28827-201ENSMUST00000187165 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm20931-202ENSMUST00000187293 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm21760-202ENSMUST00000187433 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm20920-201ENSMUST00000187477 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm21627-201ENSMUST00000187768 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ssbp4Q3U4B1 Mrgprb1-202ENSMUST00000188095 472 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm20850-201ENSMUST00000188672 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm21488-201ENSMUST00000188744 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm20820-201ENSMUST00000188754 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm20894-201ENSMUST00000188864 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm21173-201ENSMUST00000189238 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm20870-201ENSMUST00000189315 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm20903-201ENSMUST00000189346 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm21209-202ENSMUST00000189354 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm20937-203ENSMUST00000189422 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm21497-201ENSMUST00000189455 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm20890-201ENSMUST00000189518 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm29110-201ENSMUST00000189924 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm20814-201ENSMUST00000190173 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm29573-201ENSMUST00000190291 919 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Ssbp4Q3U4B1 Sly-202ENSMUST00000190292 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm29334-201ENSMUST00000190334 357 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm21650-202ENSMUST00000190551 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm28961-201ENSMUST00000190573 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm20905-201ENSMUST00000190782 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
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Ssbp4Q3U4B1 Gm20817-201ENSMUST00000191123 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm21258-202ENSMUST00000191553 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm29866-201ENSMUST00000191675 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm31571-201ENSMUST00000192521 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm21366-201ENSMUST00000192892 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm29704-201ENSMUST00000196011 253 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm43224-201ENSMUST00000201567 898 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm44174-201ENSMUST00000205022 141 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ssbp4Q3U4B1 1700011C11Rik-201ENSMUST00000205268 365 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm19366-201ENSMUST00000206996 156 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm44611-201ENSMUST00000207507 355 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Ssbp4Q3U4B1 AC153852.1-201ENSMUST00000217881 567 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Ssbp4Q3U4B1 AC101677.1-201ENSMUST00000218590 158 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
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Ssbp4Q3U4B1 Mir30e-201ENSMUST00000083475 92 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
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Ssbp4Q3U4B1 Rian-201ENSMUST00000180876 8089 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm37143-201ENSMUST00000195180 3259 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Ssbp4Q3U4B1 4921539E11Rik-202ENSMUST00000097944 1683 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ssbp4Q3U4B1 Olfr898-202ENSMUST00000216304 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ssbp4Q3U4B1 Mrgprx2-201ENSMUST00000098433 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Ssbp4Q3U4B1 Olfr1356-202ENSMUST00000205100 3023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm5653-201ENSMUST00000223393 1337 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm17067-201ENSMUST00000166837 3673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Ssbp4Q3U4B1 Hormad1-202ENSMUST00000090797 1511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Ssbp4Q3U4B1 Igkv1-131-201ENSMUST00000103306 362 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Ssbp4Q3U4B1 Trav10n-201ENSMUST00000103612 343 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm26273-201ENSMUST00000104180 131 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ssbp4Q3U4B1 Mir465c-2-201ENSMUST00000104757 81 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm11372-201ENSMUST00000117348 570 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ssbp4Q3U4B1 Serpina3l-ps-201ENSMUST00000163975 1264 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm9613-201ENSMUST00000171662 196 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ssbp4Q3U4B1 Vmn1r-ps23-201ENSMUST00000175708 295 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm27317-201ENSMUST00000183533 95 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm27773-201ENSMUST00000184087 78 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ssbp4Q3U4B1 Gtpbp4-ps5-201ENSMUST00000184969 289 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm29389-201ENSMUST00000191562 352 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm38098-201ENSMUST00000194115 241 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ssbp4Q3U4B1 n-TSaga9-201ENSMUST00000197675 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ssbp4Q3U4B1 Igkv13-57-1-201ENSMUST00000198063 305 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm43487-201ENSMUST00000200331 1031 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm43028-201ENSMUST00000202561 481 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm45742-201ENSMUST00000212400 433 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ssbp4Q3U4B1 Olfr1088-ps1-201ENSMUST00000213686 863 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ssbp4Q3U4B1 Olfr1266-ps1-201ENSMUST00000214850 180 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ssbp4Q3U4B1 AC167977.1-201ENSMUST00000221384 234 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ssbp4Q3U4B1 1700030L22Rik-202ENSMUST00000222223 704 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Ssbp4Q3U4B1 AC124549.2-201ENSMUST00000224243 222 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.3 ms