Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Olfr1111-202ENSMUST00000214492 1616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r211-202ENSMUST00000228645 5447 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Crisp2-201ENSMUST00000024724 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Gm15097-202ENSMUST00000112741 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Olfr107-203ENSMUST00000215947 3954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Gm816-201ENSMUST00000191156 2456 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Ighv16-1-201ENSMUST00000103470 299 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Mup6-203ENSMUST00000107521 642 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Gm14981-201ENSMUST00000117325 943 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Gm14537-201ENSMUST00000117464 599 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Rpl31-ps5-201ENSMUST00000118086 375 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Gm10230-201ENSMUST00000119362 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Gm7308-201ENSMUST00000121087 447 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Gm27192-201ENSMUST00000136428 581 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Gm11665-201ENSMUST00000148136 285 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Gm24138-201ENSMUST00000157572 114 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Gm23895-201ENSMUST00000158108 160 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Gm15508-201ENSMUST00000160330 325 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Gm14819-202ENSMUST00000169396 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Gm17166-201ENSMUST00000172006 431 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Gm25748-201ENSMUST00000175487 70 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Gm10487-201ENSMUST00000177566 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Gm14632-202ENSMUST00000177917 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Gm10058-202ENSMUST00000178152 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Gm10096-201ENSMUST00000178672 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Gm10230-202ENSMUST00000178745 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Gm2092-201ENSMUST00000178887 639 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Gm10147-202ENSMUST00000178966 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Gm2759-201ENSMUST00000179938 639 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Gm7909-201ENSMUST00000182688 614 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Gm26915-201ENSMUST00000183080 748 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Mir6405-201ENSMUST00000184584 124 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Gm29452-201ENSMUST00000187996 313 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Gm28860-201ENSMUST00000188103 313 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 1700010J16Rik-202ENSMUST00000189116 890 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Gm18403-201ENSMUST00000192907 529 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Gm9989-202ENSMUST00000193125 258 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Igkv15-97-201ENSMUST00000197637 339 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Gm6112-201ENSMUST00000208037 629 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Olfr907-202ENSMUST00000214003 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 AC159472.1-201ENSMUST00000218178 463 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 CT025525.3-201ENSMUST00000228858 366 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Olfr948-201ENSMUST00000076516 966 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Slc16a7-206ENSMUST00000211781 10981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Vmn2r71-201ENSMUST00000172338 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Olfr844-202ENSMUST00000220268 1686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Rag2-201ENSMUST00000044031 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 AC152159.1-201ENSMUST00000226719 2769 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Trbv19-201ENSMUST00000103276 566 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Traj40-201ENSMUST00000103702 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Gm23911-201ENSMUST00000104596 134 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Prl8a2-202ENSMUST00000110363 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Gm5754-201ENSMUST00000118774 892 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Gm13574-201ENSMUST00000120482 394 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Gm15272-201ENSMUST00000120865 233 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Gm14578-201ENSMUST00000122166 391 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Gm15147-201ENSMUST00000122263 483 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Gm14903-201ENSMUST00000122435 537 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Gm24443-201ENSMUST00000157242 132 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Gm23380-201ENSMUST00000158448 103 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Gm8338-201ENSMUST00000163928 363 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Cfap54-204ENSMUST00000164979 945 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Olfr1187-ps1-201ENSMUST00000177576 334 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Mir7578-201ENSMUST00000183455 82 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Tmem167-ps3-201ENSMUST00000186718 178 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Gm33819-201ENSMUST00000194008 1221 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Gm43115-201ENSMUST00000196244 160 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Gm43848-201ENSMUST00000198060 1247 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Gm44076-201ENSMUST00000203072 520 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Gm43894-201ENSMUST00000203274 688 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Gm44208-201ENSMUST00000205199 421 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Gm45016-201ENSMUST00000208375 396 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Olfr892-ps1-201ENSMUST00000211998 932 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 AC168266.1-201ENSMUST00000216024 226 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 AC132384.9-201ENSMUST00000218085 277 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 CT010498.1-201ENSMUST00000225382 546 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 AC130477.2-201ENSMUST00000228158 274 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Prr32-201ENSMUST00000040002 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Olfr65-203ENSMUST00000214300 2855 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Gm37928-201ENSMUST00000193265 4131 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Gm13103-201ENSMUST00000094522 1833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Olfr898-203ENSMUST00000217063 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 AC124561.2-201ENSMUST00000226657 1973 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r76-203ENSMUST00000226947 8145 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Ifi213-202ENSMUST00000150649 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Gm22516-201ENSMUST00000158266 124 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Gm3470-201ENSMUST00000160819 420 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 1700016C15Rik-201ENSMUST00000016106 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Prl3d2-202ENSMUST00000164964 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r88-201ENSMUST00000171783 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Ifi213-205ENSMUST00000180215 643 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Gm29576-201ENSMUST00000188020 678 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Scgb2b31-ps-201ENSMUST00000188734 328 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Gm29423-207ENSMUST00000189580 255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Gm28354-201ENSMUST00000190904 678 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Gm37947-201ENSMUST00000192740 894 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Gm37853-201ENSMUST00000195748 660 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Gm43614-201ENSMUST00000197030 517 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Gm24350-202ENSMUST00000198309 132 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cpne9Q1RLL3 Gm36159-201ENSMUST00000206737 549 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.7 ms