Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Gm27465-201ENSMUST00000184290 91 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Sh3bp2Q06649 Hmgb1-rs16-201ENSMUST00000185927 613 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Sh3bp2Q06649 1700010I02Rik-202ENSMUST00000188525 430 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Sh3bp2Q06649 Gm28468-201ENSMUST00000188536 615 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Sh3bp2Q06649 Gm28835-202ENSMUST00000189206 543 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Sh3bp2Q06649 Igkv2-95-1-201ENSMUST00000200279 272 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
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Sh3bp2Q06649 AC160123.1-201ENSMUST00000213443 570 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Sh3bp2Q06649 AC151971.3-201ENSMUST00000214694 404 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Sh3bp2Q06649 2010107E04Rik-201ENSMUST00000021719 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
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Sh3bp2Q06649 AC156798.1-201ENSMUST00000220508 224 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Sh3bp2Q06649 Gm9512-201ENSMUST00000223112 497 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Sh3bp2Q06649 Gm24705-201ENSMUST00000082808 107 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Sh3bp2Q06649 Gm42697-201ENSMUST00000198992 4092 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Sh3bp2Q06649 Xlr3c-201ENSMUST00000080839 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
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Sh3bp2Q06649 Fap-201ENSMUST00000000402 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Sh3bp2Q06649 AC144772.1-201ENSMUST00000226372 2398 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Sh3bp2Q06649 Zfy2-202ENSMUST00000187148 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Sh3bp2Q06649 9830107B12Rik-201ENSMUST00000063481 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Sh3bp2Q06649 Vmn1r200-204ENSMUST00000227326 5449 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Sh3bp2Q06649 Cenpj-201ENSMUST00000065302 4363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Sh3bp2Q06649 Vmn1r209-203ENSMUST00000227265 6550 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
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Sh3bp2Q06649 Svs2-201ENSMUST00000044953 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
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Sh3bp2Q06649 Gm25419-201ENSMUST00000104215 191 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Sh3bp2Q06649 Gm11020-201ENSMUST00000109447 186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
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Sh3bp2Q06649 Gm23990-201ENSMUST00000117031 117 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Sh3bp2Q06649 Gm6574-201ENSMUST00000120037 362 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
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Sh3bp2Q06649 Gm23463-201ENSMUST00000122468 99 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Sh3bp2Q06649 Gm22026-201ENSMUST00000122735 281 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
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Sh3bp2Q06649 Gm10421-202ENSMUST00000186114 132 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
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Sh3bp2Q06649 Wfdc18-201ENSMUST00000001009 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
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Sh3bp2Q06649 Gm16549-201ENSMUST00000160445 503 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
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Sh3bp2Q06649 Gm28769-201ENSMUST00000190176 615 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Sh3bp2Q06649 Gm8242-202ENSMUST00000193056 475 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Sh3bp2Q06649 Gm43712-201ENSMUST00000198020 291 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Sh3bp2Q06649 Gm44330-201ENSMUST00000200106 143 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Sh3bp2Q06649 Gm18453-201ENSMUST00000208000 626 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Sh3bp2Q06649 Gm32443-202ENSMUST00000220011 773 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Sh3bp2Q06649 Defb9-201ENSMUST00000057076 310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Sh3bp2Q06649 Mir134-201ENSMUST00000083492 71 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Sh3bp2Q06649 Kynu-202ENSMUST00000050511 2778 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Sh3bp2Q06649 Ahnak-202ENSMUST00000092956 18099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Sh3bp2Q06649 Gm43389-201ENSMUST00000196080 2595 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Sh3bp2Q06649 Gm43887-201ENSMUST00000204727 3186 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
Sh3bp2Q06649 Naip2-203ENSMUST00000167986 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
Sh3bp2Q06649 Tlr6-201ENSMUST00000062315 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
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