Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Kynu-202ENSMUST00000050511 2778 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Klhl4-202ENSMUST00000113371 3566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Klhl4-201ENSMUST00000040504 3584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Olfr446-202ENSMUST00000215369 4399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm36298-201ENSMUST00000223394 1732 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm37101-201ENSMUST00000191656 3660 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Trav16n-201ENSMUST00000103633 353 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm23990-201ENSMUST00000117031 117 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm6897-201ENSMUST00000117714 138 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Hspe1-ps5-201ENSMUST00000118080 297 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm15002-201ENSMUST00000118406 452 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm14758-201ENSMUST00000119104 138 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm12495-201ENSMUST00000119750 447 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm24596-201ENSMUST00000122504 107 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Platr27-201ENSMUST00000131365 629 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm23534-201ENSMUST00000157539 97 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm23137-201ENSMUST00000157559 107 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm28020-201ENSMUST00000157739 67 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm22726-201ENSMUST00000158089 179 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm17052-201ENSMUST00000165496 289 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm25211-201ENSMUST00000177553 107 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm24540-201ENSMUST00000177627 107 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm25256-201ENSMUST00000177746 107 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm22822-201ENSMUST00000177941 107 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Rnu6-201ENSMUST00000178023 107 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm25245-201ENSMUST00000178139 107 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm24753-201ENSMUST00000178183 107 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm25829-201ENSMUST00000178275 107 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm22092-201ENSMUST00000178290 107 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm24486-201ENSMUST00000178420 107 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm23217-201ENSMUST00000178482 107 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm26245-201ENSMUST00000178491 107 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm24019-201ENSMUST00000178620 107 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm23610-201ENSMUST00000178659 107 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm23092-201ENSMUST00000178688 107 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm25709-201ENSMUST00000178844 107 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm25547-201ENSMUST00000178877 107 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm25312-201ENSMUST00000178972 107 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm24722-201ENSMUST00000179017 107 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm22969-201ENSMUST00000179018 107 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm25101-201ENSMUST00000179057 107 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm26378-201ENSMUST00000179093 107 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm24873-201ENSMUST00000179101 107 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm23934-201ENSMUST00000179111 107 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm22623-201ENSMUST00000179244 107 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm26243-201ENSMUST00000179260 107 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm25737-201ENSMUST00000179274 107 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm22618-201ENSMUST00000179376 107 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm24182-201ENSMUST00000179419 107 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm24242-201ENSMUST00000179440 107 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm25064-201ENSMUST00000179535 107 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm26295-201ENSMUST00000179690 107 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm23712-201ENSMUST00000179713 107 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm22823-201ENSMUST00000179754 107 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm22360-201ENSMUST00000179775 107 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm24978-201ENSMUST00000179782 107 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm24967-201ENSMUST00000179791 107 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm25173-201ENSMUST00000179794 107 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm24870-201ENSMUST00000179897 107 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm22288-201ENSMUST00000179904 107 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm22645-201ENSMUST00000180010 107 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm24565-201ENSMUST00000180099 107 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm23805-201ENSMUST00000180129 107 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm23512-201ENSMUST00000180237 107 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm25327-201ENSMUST00000180263 107 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm26058-201ENSMUST00000180294 107 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm22418-201ENSMUST00000180326 107 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Mir195b-201ENSMUST00000184814 97 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm29031-201ENSMUST00000185316 614 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm29000-201ENSMUST00000185444 614 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm28204-201ENSMUST00000185934 614 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm28290-201ENSMUST00000186505 614 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm28161-201ENSMUST00000186669 614 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm9687-201ENSMUST00000189312 602 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm28749-209ENSMUST00000189599 614 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm38080-201ENSMUST00000194035 268 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm33163-201ENSMUST00000194504 614 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Rnu3a-202ENSMUST00000196710 213 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Mir7661-201ENSMUST00000197023 61 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm43402-201ENSMUST00000197159 159 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm5002-201ENSMUST00000207145 223 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Rpl18a-205ENSMUST00000212494 473 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PtpreP49446 AC188459.1-201ENSMUST00000216651 300 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtpreP49446 AC158798.1-201ENSMUST00000219714 711 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PtpreP49446 9430078K24Rik-202ENSMUST00000219857 348 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Ly6e-ps1-201ENSMUST00000222501 367 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtpreP49446 AC131178.1-201ENSMUST00000228649 492 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm23629-201ENSMUST00000082465 107 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm23924-201ENSMUST00000082474 108 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm22246-201ENSMUST00000082478 107 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm22747-201ENSMUST00000082495 107 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm23296-201ENSMUST00000082555 107 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm22063-201ENSMUST00000082560 107 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm26129-201ENSMUST00000082719 107 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm24859-201ENSMUST00000082729 107 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm23057-201ENSMUST00000082801 107 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm26328-201ENSMUST00000082821 107 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm26331-201ENSMUST00000082824 107 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm24205-201ENSMUST00000082953 107 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm25405-201ENSMUST00000082973 107 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.3 ms