Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm22693-201ENSMUST00000175049 442 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Hoxd10P28359 Snord92-201ENSMUST00000175548 85 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Hoxd10P28359 Gm8926-202ENSMUST00000178158 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Hoxd10P28359 Gm21809-201ENSMUST00000178495 468 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Hoxd10P28359 Gm17467-201ENSMUST00000178553 468 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Hoxd10P28359 Gm8879-202ENSMUST00000178863 465 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Hoxd10P28359 Gm8922-202ENSMUST00000178989 465 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Hoxd10P28359 Gm17412-201ENSMUST00000179261 468 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Hoxd10P28359 Speer1-202ENSMUST00000179482 465 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Hoxd10P28359 Gm8897-202ENSMUST00000179679 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Hoxd10P28359 Gm17577-201ENSMUST00000179916 468 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Hoxd10P28359 Gtpbp4-ps4-201ENSMUST00000184813 258 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Hoxd10P28359 Olfr1055-202ENSMUST00000188023 939 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Hoxd10P28359 Gm43355-201ENSMUST00000196541 346 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Hoxd10P28359 4930437M23Rik-201ENSMUST00000197456 968 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Hoxd10P28359 Gm6639-204ENSMUST00000199182 800 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Hoxd10P28359 Gm44941-201ENSMUST00000204216 627 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Hoxd10P28359 Gm20948-201ENSMUST00000211091 449 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Hoxd10P28359 Gm18585-201ENSMUST00000215197 556 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Hoxd10P28359 AC160970.1-201ENSMUST00000219311 475 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Hoxd10P28359 D830005E20Rik-202ENSMUST00000219691 971 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Hoxd10P28359 Gm4263-202ENSMUST00000221392 667 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Hoxd10P28359 Vmn1r25-202ENSMUST00000228585 909 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Hoxd10P28359 Olfr779-201ENSMUST00000069063 390 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Hoxd10P28359 Olfr952-201ENSMUST00000073895 1056 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Hoxd10P28359 Gm26176-201ENSMUST00000083795 105 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Hoxd10P28359 Olfr583-201ENSMUST00000098211 960 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Hoxd10P28359 Vmn1r206-202ENSMUST00000227244 3970 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Hoxd10P28359 Cdk13-205ENSMUST00000222800 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Hoxd10P28359 Gm37672-201ENSMUST00000192682 4014 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Hoxd10P28359 Gm38699-201ENSMUST00000221301 1740 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Hoxd10P28359 Gm609-201ENSMUST00000114585 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
Hoxd10P28359 2810428J06Rik-201ENSMUST00000198336 2696 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
Hoxd10P28359 Gm24715-201ENSMUST00000102377 95 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Hoxd10P28359 Olfr393-201ENSMUST00000102523 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Hoxd10P28359 Traj44-201ENSMUST00000103698 61 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Hoxd10P28359 Traj40-201ENSMUST00000103702 61 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Hoxd10P28359 Gm12788-201ENSMUST00000119090 308 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Hoxd10P28359 Gm12071-201ENSMUST00000121968 469 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Hoxd10P28359 Gm22722-201ENSMUST00000157467 132 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Hoxd10P28359 Gm22833-201ENSMUST00000158292 132 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Hoxd10P28359 Gm22532-201ENSMUST00000158822 140 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Hoxd10P28359 Gm17194-201ENSMUST00000164610 348 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Hoxd10P28359 Gm16430-201ENSMUST00000169006 615 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Hoxd10P28359 Gm17727-201ENSMUST00000171898 643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Hoxd10P28359 Gm18520-201ENSMUST00000174783 658 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Hoxd10P28359 1700010J16Rik-202ENSMUST00000189116 890 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Hoxd10P28359 Gm24350-202ENSMUST00000198309 132 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Hoxd10P28359 Gm28563-201ENSMUST00000201179 211 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Hoxd10P28359 Bsph1-202ENSMUST00000204715 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Hoxd10P28359 Gm36243-201ENSMUST00000211546 610 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Hoxd10P28359 Gm46233-201ENSMUST00000217831 449 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Hoxd10P28359 Gm5176-202ENSMUST00000220267 583 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Hoxd10P28359 AC167669.3-201ENSMUST00000224720 393 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Hoxd10P28359 Gm5152-202ENSMUST00000088625 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Hoxd10P28359 5730507A11Rik-201ENSMUST00000204297 3371 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Hoxd10P28359 Gm5362-201ENSMUST00000211968 3085 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Hoxd10P28359 Gm15127-203ENSMUST00000112753 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Hoxd10P28359 Ankrd28-207ENSMUST00000227863 6616 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Hoxd10P28359 Gm42534-201ENSMUST00000196063 1754 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Hoxd10P28359 Zbtb41-201ENSMUST00000039867 8361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Hoxd10P28359 Gm22019-201ENSMUST00000104359 96 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Hoxd10P28359 Gm14901-201ENSMUST00000119001 283 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Hoxd10P28359 Gm13131-201ENSMUST00000122228 321 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Hoxd10P28359 Gm25185-201ENSMUST00000157754 96 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Hoxd10P28359 Gm20405-201ENSMUST00000174002 229 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Hoxd10P28359 Vmn1r-ps57-201ENSMUST00000174879 288 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Hoxd10P28359 Gm17935-201ENSMUST00000196649 772 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Hoxd10P28359 Gm42438-201ENSMUST00000197832 974 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Hoxd10P28359 Gm9023-201ENSMUST00000198408 1038 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Hoxd10P28359 Gm18748-201ENSMUST00000198507 622 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Hoxd10P28359 Gm42516-201ENSMUST00000198691 767 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Hoxd10P28359 4933402J10Rik-202ENSMUST00000198882 1167 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Hoxd10P28359 Gm43899-201ENSMUST00000203675 246 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Hoxd10P28359 AC158631.1-201ENSMUST00000219202 138 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Hoxd10P28359 AC154527.5-201ENSMUST00000224448 496 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Hoxd10P28359 AC140210.1-201ENSMUST00000224961 534 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Hoxd10P28359 AC174797.4-201ENSMUST00000225510 347 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Hoxd10P28359 Olfr907-201ENSMUST00000052901 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Hoxd10P28359 Olfr843-201ENSMUST00000061365 1107 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Hoxd10P28359 Gm4945-201ENSMUST00000075152 453 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Hoxd10P28359 Olfr381-201ENSMUST00000078358 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Hoxd10P28359 Gm23975-201ENSMUST00000082685 106 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Hoxd10P28359 Vmn1r45-208ENSMUST00000228662 3309 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Hoxd10P28359 Olfr1325-203ENSMUST00000216108 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Hoxd10P28359 Rab27b-203ENSMUST00000121693 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Hoxd10P28359 Gm816-201ENSMUST00000191156 2456 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Hoxd10P28359 Strbp-201ENSMUST00000028279 16348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Hoxd10P28359 Gm15697-201ENSMUST00000121946 2902 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Hoxd10P28359 Krtap24-1-201ENSMUST00000052512 1571 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Hoxd10P28359 Gm44947-201ENSMUST00000208462 1981 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Hoxd10P28359 Vmn2r42-205ENSMUST00000146278 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Hoxd10P28359 Gm24273-201ENSMUST00000102332 164 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Hoxd10P28359 Trav8d-2-201ENSMUST00000103605 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Hoxd10P28359 Gm24340-201ENSMUST00000104208 97 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Hoxd10P28359 Gm14987-201ENSMUST00000117820 676 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Hoxd10P28359 Gm16053-201ENSMUST00000120511 188 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Hoxd10P28359 Gm12591-201ENSMUST00000122407 1177 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Hoxd10P28359 Pfdn4-205ENSMUST00000136839 452 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Hoxd10P28359 Gm13748-201ENSMUST00000149820 378 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.1 ms