Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Ankar-203ENSMUST00000212573 3952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Vmn1r67-202ENSMUST00000226237 2352 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gabra6-202ENSMUST00000109286 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Arrdc3-205ENSMUST00000161441 1908 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Cep57l1-201ENSMUST00000019951 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Olfr1493-ps1-202ENSMUST00000208667 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Fbxw26-201ENSMUST00000071917 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 AC116797.1-201ENSMUST00000223988 3955 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gm2004-201ENSMUST00000109049 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gm14419-202ENSMUST00000126358 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Ktn1-203ENSMUST00000185940 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Ktn1-208ENSMUST00000187039 3875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Bclaf1-201ENSMUST00000043881 5437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Zfp143-202ENSMUST00000169638 2914 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Zfp951-202ENSMUST00000186219 2904 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Pramef6-202ENSMUST00000105767 1967 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Vmn1r89-204ENSMUST00000227239 1992 ntAPPRIS P2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Mdm4-210ENSMUST00000188090 7105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gm25538-201ENSMUST00000101943 107 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gm13321-201ENSMUST00000117101 400 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gm14803-201ENSMUST00000117163 361 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gm15162-201ENSMUST00000119325 283 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gm5937-201ENSMUST00000119715 643 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Olfr660-ps1-201ENSMUST00000121526 375 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 3110004A20Rik-201ENSMUST00000123904 385 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gm23197-201ENSMUST00000158809 112 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gm25834-201ENSMUST00000158916 101 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gm16545-201ENSMUST00000161968 463 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gm7335-201ENSMUST00000172475 373 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Mir6343-201ENSMUST00000183584 84 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Mir6903-201ENSMUST00000183597 88 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gm27285-201ENSMUST00000183875 127 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gm27465-201ENSMUST00000184290 91 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Mir6412-201ENSMUST00000184477 97 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Ighv1-19-1-201ENSMUST00000192823 351 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gm37123-201ENSMUST00000192994 1171 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gm37997-201ENSMUST00000193515 267 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gm37030-201ENSMUST00000194254 295 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Ighv1-35-201ENSMUST00000195265 351 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gm42855-201ENSMUST00000197388 253 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Olfr375-ps1-201ENSMUST00000198131 249 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gm44214-201ENSMUST00000204153 606 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gm5002-201ENSMUST00000207145 223 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gm45236-201ENSMUST00000208632 229 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 AC159709.1-201ENSMUST00000220445 349 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 AC211878.2-201ENSMUST00000222486 488 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 AC091783.4-201ENSMUST00000224940 611 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 AC125223.1-203ENSMUST00000225304 498 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 AC118639.1-201ENSMUST00000227204 338 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Rps4x-201ENSMUST00000033683 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 A630091E08Rik-201ENSMUST00000069035 828 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Mir134-201ENSMUST00000083492 71 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gm11808-201ENSMUST00000089430 504 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Wfdc9-201ENSMUST00000099095 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Olfr1090-201ENSMUST00000099875 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Olfr1443-201ENSMUST00000049724 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Ehf-201ENSMUST00000090475 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 AC153526.2-201ENSMUST00000218206 2031 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gm37767-201ENSMUST00000193239 1834 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Olfr235-204ENSMUST00000214613 2217 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 A530083M17Rik-201ENSMUST00000199877 3376 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gm26582-201ENSMUST00000181481 3135 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Vmn1r175-202ENSMUST00000228383 2878 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Setd2-201ENSMUST00000153838 8350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Olfr985-202ENSMUST00000214981 1879 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gm14295-202ENSMUST00000132883 2505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Olfr1348-207ENSMUST00000209029 2696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gria2-201ENSMUST00000075316 10371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Olfr491-202ENSMUST00000209545 1944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Il6-203ENSMUST00000199183 2343 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Olfr123-202ENSMUST00000214770 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gm23422-201ENSMUST00000102000 107 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Vmn1r124-201ENSMUST00000105200 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gm25783-201ENSMUST00000122525 190 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gm12336-201ENSMUST00000125962 322 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gm21973-201ENSMUST00000157020 358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Tcrg-C3-201ENSMUST00000164407 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Spin2g-201ENSMUST00000178425 687 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Mir6400-201ENSMUST00000184870 92 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gm29140-201ENSMUST00000190187 476 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gm18325-201ENSMUST00000203228 835 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gm45367-201ENSMUST00000210171 347 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 AC241593.1-201ENSMUST00000224768 397 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Amelx-201ENSMUST00000066112 802 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gm5899-201ENSMUST00000071770 270 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 n-R5s62-201ENSMUST00000082780 96 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Olfr78-201ENSMUST00000060187 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Stard9-207ENSMUST00000180041 15102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Vmn2r39-201ENSMUST00000174388 3577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Slfn8-203ENSMUST00000108152 3083 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Olfr1065-202ENSMUST00000216162 2148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Olfr1180-203ENSMUST00000217320 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Olfr1057-202ENSMUST00000217435 3249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gnal-202ENSMUST00000076605 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Clec9a-201ENSMUST00000058352 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Vmn1r71-201ENSMUST00000079113 4996 ntAPPRIS P2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Olfr395-202ENSMUST00000215690 4275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Cnot1-202ENSMUST00000098473 8390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gm5798-201ENSMUST00000164613 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gm8104-201ENSMUST00000168165 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
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