Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm42614-201ENSMUST00000198724 1554 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Gm45104-201ENSMUST00000208748 4350 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Gm10340-201ENSMUST00000170790 1755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Olfr1158-201ENSMUST00000102622 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.62□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Igkv5-48-201ENSMUST00000103364 360 ntAPPRIS P1 BASIC2.62□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Olfr383-ps1-201ENSMUST00000118895 935 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Gm15244-201ENSMUST00000121122 130 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Gm13502-201ENSMUST00000121574 684 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Gm15563-201ENSMUST00000124953 410 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Gm12226-201ENSMUST00000144172 876 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Gm22380-201ENSMUST00000157479 95 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Gm22789-201ENSMUST00000157884 130 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Gm26171-201ENSMUST00000158422 131 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Gm3486-201ENSMUST00000169361 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Gm22108-201ENSMUST00000177961 106 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Gm24798-201ENSMUST00000179334 106 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Gm27964-201ENSMUST00000185195 62 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Gm28917-201ENSMUST00000187294 237 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Gm28688-201ENSMUST00000187301 268 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 1810007C17Rik-201ENSMUST00000187665 710 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Gm28766-201ENSMUST00000191086 234 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Gm37828-201ENSMUST00000192496 432 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Gm37288-201ENSMUST00000193963 334 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Gm43142-201ENSMUST00000198670 361 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Gm35570-201ENSMUST00000198730 681 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Gm42796-201ENSMUST00000199913 1087 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Gm18861-201ENSMUST00000202509 1186 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Gm44084-201ENSMUST00000203947 409 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 2610306O10Rik-201ENSMUST00000206512 612 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Gm7624-201ENSMUST00000209702 435 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 AL929285.1-201ENSMUST00000215522 229 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 AC174082.1-201ENSMUST00000221106 307 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 AC133498.1-203ENSMUST00000221213 668 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 CT009733.1-203ENSMUST00000224033 451 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 AC116395.1-201ENSMUST00000225480 1143 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 CT009604.2-201ENSMUST00000225531 377 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 AC124729.1-202ENSMUST00000225587 938 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Vmn1r89-206ENSMUST00000227319 985 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 4930447F04Rik-201ENSMUST00000033525 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Olfr1462-201ENSMUST00000076832 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.62□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Gm26439-201ENSMUST00000082592 106 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Gm24533-201ENSMUST00000083138 196 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Vmn1r194-201ENSMUST00000091737 891 ntAPPRIS P1 BASIC2.62□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Gm5127-201ENSMUST00000101296 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 C87977-201ENSMUST00000105753 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Pate3-201ENSMUST00000178236 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Mcmdc2-204ENSMUST00000140948 3249 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 4930533N22Rik-202ENSMUST00000206684 1503 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Krtap24-1-201ENSMUST00000052512 1571 ntAPPRIS P1 BASIC2.61□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Gm37999-201ENSMUST00000195178 1809 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Olfr355-201ENSMUST00000100147 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.61□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Ccnb2-ps-201ENSMUST00000118290 623 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
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Ccl20O89093 Mir21a-201ENSMUST00000083521 92 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
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Ccl20O89093 Olfr389-201ENSMUST00000122224 3057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
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Ccl20O89093 Gm37868-201ENSMUST00000195578 2735 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Olfr476-202ENSMUST00000217173 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Gm10745-201ENSMUST00000192022 1523 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Gm24119-201ENSMUST00000103979 246 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Gm25272-201ENSMUST00000104293 128 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Mir208b-201ENSMUST00000104735 77 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Gm14406-201ENSMUST00000108943 531 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Gm12982-201ENSMUST00000117408 190 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Gm13273-201ENSMUST00000119737 159 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Gm16017-201ENSMUST00000119834 208 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Gm14238-201ENSMUST00000120227 323 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Uqcrh-ps2-201ENSMUST00000121613 269 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Gm25109-201ENSMUST00000122474 114 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Gm26277-201ENSMUST00000157097 152 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms