Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Olfr133-204ENSMUST00000215549 2944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Atp5j-203ENSMUST00000114193 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm14558-201ENSMUST00000117458 381 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm13386-201ENSMUST00000117677 124 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm11698-201ENSMUST00000117948 455 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm12571-201ENSMUST00000118132 243 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 1700123O12Rik-203ENSMUST00000145856 425 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 1700013N06Rik-201ENSMUST00000156376 663 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm23743-201ENSMUST00000157389 274 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm22597-201ENSMUST00000157602 80 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm23124-201ENSMUST00000157650 107 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm25386-201ENSMUST00000157814 288 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm22434-201ENSMUST00000158549 122 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm2389-201ENSMUST00000160487 189 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Clec5a-204ENSMUST00000177178 665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Mir6382-201ENSMUST00000184055 110 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Ly6c1-203ENSMUST00000185200 540 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm29031-201ENSMUST00000185316 614 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm29000-201ENSMUST00000185444 614 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm28204-201ENSMUST00000185934 614 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm28304-201ENSMUST00000185977 312 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm28290-201ENSMUST00000186505 614 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm28161-201ENSMUST00000186669 614 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm29256-201ENSMUST00000189094 312 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm28749-209ENSMUST00000189599 614 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm28484-201ENSMUST00000190606 312 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm33163-201ENSMUST00000194504 614 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm43043-201ENSMUST00000196579 412 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm30484-201ENSMUST00000200327 449 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm29848-201ENSMUST00000203107 295 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm5876-201ENSMUST00000203735 243 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Spcs2-205ENSMUST00000207580 868 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm45523-201ENSMUST00000210712 799 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Rpl26-ps6-201ENSMUST00000216693 434 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 AC157570.3-201ENSMUST00000219281 205 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm7753-201ENSMUST00000221007 867 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 AC132315.1-201ENSMUST00000221771 390 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm7093-201ENSMUST00000223004 581 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 AC159621.1-201ENSMUST00000223249 163 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm30409-201ENSMUST00000223302 229 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 AC154788.1-201ENSMUST00000225003 340 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 AC116656.1-201ENSMUST00000227040 755 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 AC163646.2-201ENSMUST00000227962 141 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Defb8-201ENSMUST00000033854 287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Olfr1031-201ENSMUST00000050942 1011 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Mup5-201ENSMUST00000082287 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Mir26a-2-201ENSMUST00000083496 84 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm25512-201ENSMUST00000083863 107 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Vmn1r215-202ENSMUST00000228092 2790 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 CAAA01194877.1-201ENSMUST00000213137 4233 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Olfr1318-205ENSMUST00000217533 3747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Olfr824-203ENSMUST00000215217 3619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 P2ry10-201ENSMUST00000053375 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm36229-201ENSMUST00000218737 1855 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 March1-202ENSMUST00000072482 3953 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Olfr112-204ENSMUST00000208832 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 4932414N04Rik-204ENSMUST00000128259 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Olfr613-202ENSMUST00000214173 3840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Xrn1-202ENSMUST00000185633 10256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Olfr235-204ENSMUST00000214613 2217 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Abca5-201ENSMUST00000043961 8231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm37195-201ENSMUST00000192006 3018 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Igkv14-111-201ENSMUST00000103320 368 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm12719-201ENSMUST00000118859 241 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm14656-201ENSMUST00000120342 502 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm14240-201ENSMUST00000120353 546 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm14915-201ENSMUST00000120747 204 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm13557-201ENSMUST00000120771 382 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm10444-201ENSMUST00000126708 148 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm24550-201ENSMUST00000158648 279 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Mir5134-201ENSMUST00000175529 78 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm21788-201ENSMUST00000177878 543 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm23144-201ENSMUST00000180226 107 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm27226-201ENSMUST00000184676 511 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm27332-201ENSMUST00000184893 112 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm29296-201ENSMUST00000188146 320 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Nabp1-207ENSMUST00000188204 972 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm37577-203ENSMUST00000194712 991 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
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Nedd9O35177 Gm3010-201ENSMUST00000198805 448 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm26691-203ENSMUST00000200444 479 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm4045-201ENSMUST00000204076 310 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm6112-201ENSMUST00000208037 629 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm9068-201ENSMUST00000217393 455 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 AC133207.3-201ENSMUST00000217694 464 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 AC125020.2-201ENSMUST00000218894 348 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm31849-201ENSMUST00000220306 375 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 AC159231.1-201ENSMUST00000225365 226 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Sprr2e-201ENSMUST00000068399 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm10038-201ENSMUST00000077233 441 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm22508-201ENSMUST00000082772 110 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Olfr1249-201ENSMUST00000099769 957 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 AC125532.1-201ENSMUST00000216210 2334 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Olfr1535-202ENSMUST00000217519 3959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Frmpd3-201ENSMUST00000044702 3141 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm45093-201ENSMUST00000206859 2463 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Elavl4-202ENSMUST00000102723 4024 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Olfr1270-206ENSMUST00000217139 4803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 C2cd6-201ENSMUST00000097080 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Nedd9O35177 Gm32061-201ENSMUST00000207232 3478 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
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