Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Gm21518-202ENSMUST00000186938 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm20855-202ENSMUST00000186996 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm20911-201ENSMUST00000187135 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm28102-201ENSMUST00000187146 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm28827-201ENSMUST00000187165 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm20931-202ENSMUST00000187293 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm28688-201ENSMUST00000187301 268 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm21760-202ENSMUST00000187433 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm20920-201ENSMUST00000187477 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm28785-201ENSMUST00000187478 379 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm29633-204ENSMUST00000187737 675 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm21627-201ENSMUST00000187768 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm29554-201ENSMUST00000187922 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm20850-201ENSMUST00000188672 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm21488-201ENSMUST00000188744 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm20820-201ENSMUST00000188754 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm20894-201ENSMUST00000188864 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm20869-201ENSMUST00000188958 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm21173-201ENSMUST00000189238 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm20870-201ENSMUST00000189315 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm20903-201ENSMUST00000189346 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm21209-202ENSMUST00000189354 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm20937-203ENSMUST00000189422 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm20890-201ENSMUST00000189518 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm21477-202ENSMUST00000189543 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm29110-201ENSMUST00000189924 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm20814-201ENSMUST00000190173 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm29573-201ENSMUST00000190291 919 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Sly-202ENSMUST00000190292 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm21650-202ENSMUST00000190551 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm20905-201ENSMUST00000190782 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm20817-201ENSMUST00000191123 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm20843-202ENSMUST00000191305 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm21258-202ENSMUST00000191553 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm29866-201ENSMUST00000191675 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm31571-201ENSMUST00000192521 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm21366-201ENSMUST00000192892 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Ighv1-6-201ENSMUST00000193849 293 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm43525-201ENSMUST00000196460 616 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Fbxw15-203ENSMUST00000198397 927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm45063-201ENSMUST00000203726 472 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm8423-201ENSMUST00000211387 607 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm45530-201ENSMUST00000211658 225 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 AC122840.3-201ENSMUST00000221474 486 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 CT573085.1-201ENSMUST00000224279 1197 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 AC129202.3-201ENSMUST00000224413 733 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 AC147545.1-201ENSMUST00000227528 108 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 AC156574.2-201ENSMUST00000228023 282 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Sprr2i-201ENSMUST00000047264 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Olfr479-201ENSMUST00000063151 1111 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm25630-201ENSMUST00000084000 162 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Tfpi-203ENSMUST00000111711 3968 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Adam5-201ENSMUST00000050300 2560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Evi2b-201ENSMUST00000179322 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 AC116557.1-201ENSMUST00000219494 1521 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Olfr1226-202ENSMUST00000214709 5270 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Zbtb41-201ENSMUST00000039867 8361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Olfr1211-204ENSMUST00000215205 4220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm43092-201ENSMUST00000202986 1854 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm16440-201ENSMUST00000100900 1089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Igkv4-57-201ENSMUST00000103357 352 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm25272-201ENSMUST00000104293 128 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm24987-201ENSMUST00000104453 134 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Olfr483-201ENSMUST00000104917 1065 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Mup6-203ENSMUST00000107521 642 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Atp5j-203ENSMUST00000114193 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm16431-201ENSMUST00000117454 431 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm13076-201ENSMUST00000118041 204 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Klrc1-203ENSMUST00000118447 684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm13752-201ENSMUST00000138195 491 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm23754-201ENSMUST00000157576 63 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm25224-201ENSMUST00000158195 68 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm22532-201ENSMUST00000158822 140 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Ear-ps10-201ENSMUST00000161871 460 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Vmn1r115-201ENSMUST00000169374 888 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm3043-201ENSMUST00000170639 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Vmn2r-ps76-201ENSMUST00000173876 739 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm25026-201ENSMUST00000175017 188 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm22307-201ENSMUST00000180019 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm33571-201ENSMUST00000193271 657 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm37097-201ENSMUST00000193676 336 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Rpl23a-ps5-201ENSMUST00000194566 466 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm6510-201ENSMUST00000195916 574 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm43619-201ENSMUST00000197267 914 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Igkv13-82-201ENSMUST00000200308 346 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm44941-201ENSMUST00000204216 627 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm44727-201ENSMUST00000204225 451 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Ifitm6-202ENSMUST00000209328 678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm18228-201ENSMUST00000217297 1091 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 AC122301.3-201ENSMUST00000217707 716 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 AC140254.1-201ENSMUST00000220063 331 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 AC121966.1-201ENSMUST00000221458 282 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 AC154552.4-201ENSMUST00000222171 151 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 AC154552.5-201ENSMUST00000222352 207 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 Gm36525-201ENSMUST00000222590 638 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 AC102575.1-201ENSMUST00000225348 547 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 CT025157.1-201ENSMUST00000226241 292 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 AC117588.3-201ENSMUST00000228517 325 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm21818J3KMS6 3830403N18Rik-201ENSMUST00000033458 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.6 ms