Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Gm12488-201ENSMUST00000122449 499 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Gm3250E9Q1M3 Gm11716-201ENSMUST00000154414 470 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Gm3250E9Q1M3 Gm23959-201ENSMUST00000157208 324 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Gm3250E9Q1M3 Gm26084-201ENSMUST00000157903 104 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Gm3250E9Q1M3 Gm24959-201ENSMUST00000157924 146 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Gm3250E9Q1M3 Gm22316-201ENSMUST00000158012 216 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Gm3250E9Q1M3 Gm21798-201ENSMUST00000180105 261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Gm3250E9Q1M3 Gm19427-201ENSMUST00000183619 208 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Gm3250E9Q1M3 Gm27761-201ENSMUST00000184091 131 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Gm3250E9Q1M3 Gm28271-201ENSMUST00000191369 351 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Gm3250E9Q1M3 Gm18956-201ENSMUST00000192857 480 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Gm3250E9Q1M3 Mir376a-201ENSMUST00000197584 68 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Gm3250E9Q1M3 Gm7780-201ENSMUST00000214787 406 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Gm3250E9Q1M3 CT030247.1-201ENSMUST00000216810 267 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Gm3250E9Q1M3 AC069074.2-201ENSMUST00000217819 428 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Gm3250E9Q1M3 AC027184.1-201ENSMUST00000226991 424 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Gm3250E9Q1M3 Gm22826-201ENSMUST00000083774 165 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Gm3250E9Q1M3 Gm22350-201ENSMUST00000083924 156 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Gm3250E9Q1M3 Gm5670-201ENSMUST00000093546 372 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Gm3250E9Q1M3 Mir452-201ENSMUST00000093629 85 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Gm3250E9Q1M3 Gm10799-201ENSMUST00000099666 312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Gm3250E9Q1M3 Synrg-208ENSMUST00000183714 3651 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Gm3250E9Q1M3 A930006L05Rik-201ENSMUST00000186821 2814 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Gm3250E9Q1M3 Gm45464-201ENSMUST00000210728 2844 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Gm3250E9Q1M3 P2ry13-201ENSMUST00000040622 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Gm3250E9Q1M3 Tnip3-201ENSMUST00000114236 3769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Gm3250E9Q1M3 A730020M07Rik-202ENSMUST00000196621 2370 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Gm3250E9Q1M3 Hlcs-209ENSMUST00000228910 4150 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Gm3250E9Q1M3 Vmn1r90-203ENSMUST00000226510 6674 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Gm3250E9Q1M3 Olfr790-202ENSMUST00000203966 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Gm3250E9Q1M3 Ncf2-202ENSMUST00000186568 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Gm3250E9Q1M3 Psg27-201ENSMUST00000094794 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Gm3250E9Q1M3 Ulbp1-202ENSMUST00000177585 3815 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Gm3250E9Q1M3 Trpm3-204ENSMUST00000099564 3653 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Gm3250E9Q1M3 Dnase2b-201ENSMUST00000029836 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Gm3250E9Q1M3 Dock2-203ENSMUST00000101365 3785 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Gm3250E9Q1M3 Gm16092-201ENSMUST00000161449 2405 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Gm3250E9Q1M3 Ankrd17-205ENSMUST00000197021 8067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Gm3250E9Q1M3 C230038L03Rik-201ENSMUST00000129409 2632 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Gm3250E9Q1M3 Olfr472-203ENSMUST00000216937 5392 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Gm3250E9Q1M3 Gm31371-201ENSMUST00000211848 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Gm3250E9Q1M3 Gm6786-201ENSMUST00000203165 1915 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Gm3250E9Q1M3 Olfr398-202ENSMUST00000117510 5135 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Gm3250E9Q1M3 Zfp27-204ENSMUST00000161904 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Gm3250E9Q1M3 Usp17lc-202ENSMUST00000106892 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Gm3250E9Q1M3 Gm26011-201ENSMUST00000104410 104 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Gm3250E9Q1M3 Gm14073-201ENSMUST00000117344 381 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Gm3250E9Q1M3 Gm11826-201ENSMUST00000118781 438 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Gm3250E9Q1M3 Gm14694-201ENSMUST00000121856 282 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Gm3250E9Q1M3 Gm25711-201ENSMUST00000158633 128 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Gm3250E9Q1M3 Gm28552-201ENSMUST00000190725 388 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Gm3250E9Q1M3 Ighv1-6-201ENSMUST00000193849 293 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Gm3250E9Q1M3 Igkv14-118-2-201ENSMUST00000198287 339 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Gm3250E9Q1M3 Gm32754-201ENSMUST00000199442 257 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Gm3250E9Q1M3 N4bp2os-201ENSMUST00000201547 235 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Gm3250E9Q1M3 Gm18470-201ENSMUST00000207467 420 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Gm3250E9Q1M3 Gm18464-201ENSMUST00000207803 420 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Gm3250E9Q1M3 Gm18461-201ENSMUST00000208421 420 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Gm3250E9Q1M3 Gm35552-201ENSMUST00000214355 396 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Gm3250E9Q1M3 AC123067.1-201ENSMUST00000217711 462 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Gm3250E9Q1M3 AC091783.2-201ENSMUST00000224626 740 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Gm3250E9Q1M3 Gm8724-201ENSMUST00000081668 483 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Gm3250E9Q1M3 Gm23626-201ENSMUST00000082458 133 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Gm3250E9Q1M3 C3ar1-201ENSMUST00000042081 4305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Gm3250E9Q1M3 B3gnt5-203ENSMUST00000121344 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Gm3250E9Q1M3 Gm20775-201ENSMUST00000100115 1851 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Gm3250E9Q1M3 Txndc9-201ENSMUST00000162031 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Gm3250E9Q1M3 Skap2-205ENSMUST00000204778 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Gm3250E9Q1M3 Abca6-201ENSMUST00000044003 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Gm3250E9Q1M3 Amd1-201ENSMUST00000099945 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Gm3250E9Q1M3 Chd8-201ENSMUST00000089752 8190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Gm3250E9Q1M3 Gm43359-201ENSMUST00000197944 2200 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Gm3250E9Q1M3 Gm44827-201ENSMUST00000207963 2229 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Gm3250E9Q1M3 Gm8401-201ENSMUST00000120248 1739 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Gm3250E9Q1M3 Olfr859-203ENSMUST00000217280 9596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Gm3250E9Q1M3 2610001J05Rik-201ENSMUST00000139231 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Gm3250E9Q1M3 Slc28a3-201ENSMUST00000022036 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Gm3250E9Q1M3 Gdap10-201ENSMUST00000180613 5003 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Gm3250E9Q1M3 Ehf-203ENSMUST00000111176 3696 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Gm3250E9Q1M3 Kif4-ps-201ENSMUST00000184686 3665 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Gm3250E9Q1M3 Ctps2-204ENSMUST00000112301 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Gm3250E9Q1M3 Vmn2r105-201ENSMUST00000167382 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Gm3250E9Q1M3 Xpnpep3-203ENSMUST00000163754 5383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Gm3250E9Q1M3 Sytl2-202ENSMUST00000107210 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Gm3250E9Q1M3 Dennd6a-203ENSMUST00000224111 2692 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Gm3250E9Q1M3 Igkv4-92-201ENSMUST00000103332 351 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Gm3250E9Q1M3 Gm22020-201ENSMUST00000104358 136 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Gm3250E9Q1M3 Gm13443-201ENSMUST00000120770 555 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Gm3250E9Q1M3 Gm12466-201ENSMUST00000121199 620 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Gm3250E9Q1M3 Gm15747-201ENSMUST00000141216 460 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Gm3250E9Q1M3 Gm26098-201ENSMUST00000157247 288 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Gm3250E9Q1M3 Gm22870-201ENSMUST00000157501 112 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Gm3250E9Q1M3 Clec9a-203ENSMUST00000164513 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Gm3250E9Q1M3 Zfp169-202ENSMUST00000167682 411 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Gm3250E9Q1M3 Gm27834-201ENSMUST00000183427 125 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Gm3250E9Q1M3 Mir6401-201ENSMUST00000184499 109 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Gm3250E9Q1M3 Mir7062-201ENSMUST00000185038 66 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Gm3250E9Q1M3 Gm28103-201ENSMUST00000188392 416 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Gm3250E9Q1M3 Il3-201ENSMUST00000019058 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Gm3250E9Q1M3 Rhoay-ps1-201ENSMUST00000191243 581 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.3 ms