Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H1

Trbv12-2, T cell receptor beta, variable 12-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm20906-201ENSMUST00000186493 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm20929-201ENSMUST00000186578 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm21518-202ENSMUST00000186938 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm20855-202ENSMUST00000186996 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm20911-201ENSMUST00000187135 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm28102-201ENSMUST00000187146 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm28827-201ENSMUST00000187165 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm20931-202ENSMUST00000187293 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm21760-202ENSMUST00000187433 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm20920-201ENSMUST00000187477 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm28615-201ENSMUST00000187527 482 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm21627-201ENSMUST00000187768 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm29554-201ENSMUST00000187922 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm28650-201ENSMUST00000188413 411 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm20850-201ENSMUST00000188672 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm21488-201ENSMUST00000188744 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm20820-201ENSMUST00000188754 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm20894-201ENSMUST00000188864 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm20869-201ENSMUST00000188958 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm21173-201ENSMUST00000189238 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm20870-201ENSMUST00000189315 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm20903-201ENSMUST00000189346 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm21209-202ENSMUST00000189354 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm20937-203ENSMUST00000189422 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm20890-201ENSMUST00000189518 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm21477-202ENSMUST00000189543 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm29110-201ENSMUST00000189924 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm20814-201ENSMUST00000190173 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm29573-201ENSMUST00000190291 919 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Sly-202ENSMUST00000190292 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm21650-202ENSMUST00000190551 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm20905-201ENSMUST00000190782 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm20817-201ENSMUST00000191123 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tmem167-ps1-201ENSMUST00000191236 214 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm20843-202ENSMUST00000191305 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm21258-202ENSMUST00000191553 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm29866-201ENSMUST00000191675 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm31571-201ENSMUST00000192521 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm30737-201ENSMUST00000192683 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm21366-201ENSMUST00000192892 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm37979-201ENSMUST00000193065 712 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm35134-201ENSMUST00000194086 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 AL603834.1-201ENSMUST00000198372 121 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm43897-201ENSMUST00000204019 309 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Olfr783-ps1-201ENSMUST00000205105 441 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm35262-201ENSMUST00000215133 267 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 AC140785.1-201ENSMUST00000217782 383 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 AC140381.1-201ENSMUST00000219168 367 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 AC101945.3-201ENSMUST00000226568 153 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 AC118639.1-201ENSMUST00000227204 338 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Obp1a-201ENSMUST00000088201 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ctdspl2-202ENSMUST00000110572 4160 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm9972-201ENSMUST00000069051 1533 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 AC122850.1-201ENSMUST00000220380 5690 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Olfr68-202ENSMUST00000216811 4093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm13761-201ENSMUST00000117238 807 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm14681-201ENSMUST00000118047 411 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm12268-201ENSMUST00000118398 442 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm14877-201ENSMUST00000119803 478 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm7308-201ENSMUST00000121087 447 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm15969-201ENSMUST00000151967 236 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm12976-202ENSMUST00000153817 412 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm26276-201ENSMUST00000157099 109 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 1700016C15Rik-201ENSMUST00000016106 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm23816-201ENSMUST00000179617 132 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm26928-201ENSMUST00000182674 572 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm6801-201ENSMUST00000190697 339 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm45368-202ENSMUST00000210944 416 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Olfr837-201ENSMUST00000212482 1040 ntAPPRIS P1 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm45941-201ENSMUST00000221907 675 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 2010005H15Rik-201ENSMUST00000063539 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Olfr854-201ENSMUST00000072419 948 ntAPPRIS P2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tmsb15a-201ENSMUST00000073674 299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Olfr506-201ENSMUST00000077343 1008 ntAPPRIS P1 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm25856-201ENSMUST00000082786 75 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Olfr807-202ENSMUST00000213379 1866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Olfr25-203ENSMUST00000214155 6479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Olfr652-203ENSMUST00000216131 4773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Olfr1354-202ENSMUST00000204587 3781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm32693-201ENSMUST00000196538 2402 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm16082-201ENSMUST00000115992 377 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Defa-ps9-201ENSMUST00000118264 276 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm15268-201ENSMUST00000118845 352 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm14517-201ENSMUST00000119040 337 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm9308-201ENSMUST00000119073 448 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm13541-201ENSMUST00000119519 283 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm1993-201ENSMUST00000120268 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Olfr1186-201ENSMUST00000121619 1090 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm7209-201ENSMUST00000122339 333 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm24936-201ENSMUST00000122598 247 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm15521-201ENSMUST00000141752 835 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm15445-201ENSMUST00000146700 603 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm22794-201ENSMUST00000157228 306 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm24532-201ENSMUST00000157951 286 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm22840-201ENSMUST00000158444 136 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ear-ps3-201ENSMUST00000168308 445 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm20450-201ENSMUST00000173652 147 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm26061-201ENSMUST00000175584 108 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.6 ms