Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Gm23709-201ENSMUST00000104364 130 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Mir1193-201ENSMUST00000116761 121 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Gm15058-201ENSMUST00000117689 458 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Gm11408-201ENSMUST00000117889 519 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Gm14303-201ENSMUST00000121320 171 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Olfr1172-ps1-201ENSMUST00000121530 192 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Gm11506-201ENSMUST00000122414 470 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Gm25606-201ENSMUST00000158363 95 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 4930505G20Rik-201ENSMUST00000176582 561 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Gm20656-201ENSMUST00000176925 518 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Gm8247-202ENSMUST00000178759 375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 1700029M03Rik-201ENSMUST00000187300 444 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 2010005H15Rik-203ENSMUST00000187742 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 4930532M18Rik-202ENSMUST00000190980 534 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Gm37636-201ENSMUST00000193583 359 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Ighv1-40-201ENSMUST00000194231 345 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Gm37732-201ENSMUST00000194377 316 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Gm3952-201ENSMUST00000195093 573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Gm43115-201ENSMUST00000196244 160 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Gm4734-201ENSMUST00000200117 777 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 H2al1o-201ENSMUST00000079952 509 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Gm26121-201ENSMUST00000083364 162 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 AC160115.1-201ENSMUST00000224678 1574 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Gm37868-201ENSMUST00000195578 2735 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Evi2b-201ENSMUST00000179322 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Olfr1313-203ENSMUST00000216071 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Zp3r-201ENSMUST00000039862 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Gm37970-201ENSMUST00000193865 1732 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Gm28465-202ENSMUST00000220779 1701 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Tgtp2-201ENSMUST00000046745 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 A930017M01Rik-205ENSMUST00000227721 4167 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Vmn2r106-201ENSMUST00000167464 2589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Olfr2-206ENSMUST00000216375 5828 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Ubtfl1-203ENSMUST00000169398 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Gm14627-201ENSMUST00000118931 567 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Gm11631-201ENSMUST00000119220 156 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Gm15745-201ENSMUST00000119807 115 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Gm14821-201ENSMUST00000121975 435 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Gm6969-201ENSMUST00000140065 342 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Gm28039-201ENSMUST00000149128 254 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Gm26024-201ENSMUST00000158657 322 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Gm22243-201ENSMUST00000178754 120 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Gm26866-201ENSMUST00000180414 802 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Rp31-ps19-201ENSMUST00000180929 353 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Gm8816-201ENSMUST00000182280 1163 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Gm29009-201ENSMUST00000186340 496 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Gm43151-201ENSMUST00000201093 657 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Gm39473-201ENSMUST00000223498 522 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Prl-203ENSMUST00000224228 888 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 AV026068-237ENSMUST00000226075 572 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Tas2r110-201ENSMUST00000082014 1002 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Trim30b-201ENSMUST00000106831 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm884-201ENSMUST00000059279 10977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Vmn2r-ps45-201ENSMUST00000174138 2435 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 AY512915-203ENSMUST00000159937 3650 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 CT009754.2-201ENSMUST00000221683 3661 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Vmn2r50-201ENSMUST00000074943 2586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Csde1-215ENSMUST00000199420 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Zfp442-202ENSMUST00000185796 1833 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Ino80d-205ENSMUST00000165066 13529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 4732496C06Rik-201ENSMUST00000206533 2500 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Olfr689-202ENSMUST00000215413 5819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Erbin-204ENSMUST00000169083 5435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Zfp788-201ENSMUST00000045720 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 AC154329.1-201ENSMUST00000224408 3129 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 AI987944-204ENSMUST00000206801 1701 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 A530099J19Rik-201ENSMUST00000151029 2764 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Zscan4-ps3-201ENSMUST00000210559 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm25806-201ENSMUST00000122782 122 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm24439-201ENSMUST00000157894 117 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm13249-201ENSMUST00000177803 345 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm13144-201ENSMUST00000179385 345 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm28163-201ENSMUST00000187099 325 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Mrgprb1-202ENSMUST00000188095 472 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm44161-201ENSMUST00000203532 253 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm35876-201ENSMUST00000205044 459 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm36816-202ENSMUST00000205197 504 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Olfr1108-ps1-201ENSMUST00000216930 121 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 AC132437.1-201ENSMUST00000218308 320 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 AC121966.1-201ENSMUST00000221458 282 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Cycs-ps3-201ENSMUST00000223240 321 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 AC174459.2-201ENSMUST00000226036 160 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Ear-ps9-202ENSMUST00000226796 245 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm29221-201ENSMUST00000186092 2894 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Ptprd-204ENSMUST00000102834 8084 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Olfr629-202ENSMUST00000213906 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm43696-201ENSMUST00000199385 6071 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm42552-201ENSMUST00000196754 4497 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Ehf-201ENSMUST00000090475 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Pi15-201ENSMUST00000088476 6923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Olfr575-203ENSMUST00000216420 3500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Vmn2r-ps42-201ENSMUST00000174123 2083 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Ifit2-201ENSMUST00000102826 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Trbv5-201ENSMUST00000103266 368 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm23577-201ENSMUST00000103950 110 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm22021-201ENSMUST00000104353 107 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm11862-201ENSMUST00000119678 659 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm14736-201ENSMUST00000121470 336 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm5123-201ENSMUST00000121905 837 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hdac6Q9Z2V5 Rps13-ps7-201ENSMUST00000122045 368 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.5 ms