Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ1

Vipas39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vipas39Q8BGQ1 Gm16274-201ENSMUST00000139251 592 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Vipas39Q8BGQ1 Gm12958-201ENSMUST00000141242 674 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Vipas39Q8BGQ1 Gm26045-201ENSMUST00000157862 97 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Vipas39Q8BGQ1 Gm23387-201ENSMUST00000158586 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Vipas39Q8BGQ1 Gm17038-201ENSMUST00000166586 494 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Vipas39Q8BGQ1 Gm16430-201ENSMUST00000169006 615 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Vipas39Q8BGQ1 Vmn1r-ps57-201ENSMUST00000174879 288 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Vipas39Q8BGQ1 Mir6405-201ENSMUST00000184584 124 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Vipas39Q8BGQ1 Mir7047-201ENSMUST00000184595 64 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Vipas39Q8BGQ1 Gm28706-201ENSMUST00000186830 355 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Vipas39Q8BGQ1 Scgb2b31-ps-201ENSMUST00000188734 328 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Vipas39Q8BGQ1 Gm1833-201ENSMUST00000191608 682 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Vipas39Q8BGQ1 Gm3933-201ENSMUST00000195391 439 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Vipas39Q8BGQ1 Igkv15-97-201ENSMUST00000197637 339 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Vipas39Q8BGQ1 Gm44633-201ENSMUST00000205925 439 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Vipas39Q8BGQ1 AC093926.1-201ENSMUST00000213730 243 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Vipas39Q8BGQ1 Gm36173-201ENSMUST00000219101 1163 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Vipas39Q8BGQ1 AC173115.1-201ENSMUST00000220835 211 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Vipas39Q8BGQ1 Lelp1-201ENSMUST00000029535 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Vipas39Q8BGQ1 Olfr745-201ENSMUST00000062534 1175 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Vipas39Q8BGQ1 Olfr825-201ENSMUST00000076814 1159 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Vipas39Q8BGQ1 Vmn2r75-201ENSMUST00000167830 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Vipas39Q8BGQ1 Gm43379-201ENSMUST00000196253 7726 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Vipas39Q8BGQ1 Gm12845-201ENSMUST00000203629 1767 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Vipas39Q8BGQ1 Gm29968-201ENSMUST00000222815 1387 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Vipas39Q8BGQ1 AC153881.3-201ENSMUST00000218494 1561 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
Vipas39Q8BGQ1 Gm45038-201ENSMUST00000207537 3838 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Vipas39Q8BGQ1 Olfr1242-203ENSMUST00000143935 2406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Vipas39Q8BGQ1 Gm1330-202ENSMUST00000109942 555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Vipas39Q8BGQ1 4933413L06Rik-201ENSMUST00000110292 809 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Vipas39Q8BGQ1 Prl2c2-201ENSMUST00000110594 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
Vipas39Q8BGQ1 Hnmt-202ENSMUST00000114497 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
Vipas39Q8BGQ1 Gm8569-201ENSMUST00000117630 647 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Vipas39Q8BGQ1 Vmn1r-ps109-201ENSMUST00000119308 725 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Vipas39Q8BGQ1 Gm14939-201ENSMUST00000120347 680 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Vipas39Q8BGQ1 Gm25109-201ENSMUST00000122474 114 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Vipas39Q8BGQ1 Gm26020-201ENSMUST00000122729 183 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Vipas39Q8BGQ1 Gm14562-201ENSMUST00000129885 543 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Vipas39Q8BGQ1 Gm23865-201ENSMUST00000157723 97 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Vipas39Q8BGQ1 Gm23028-201ENSMUST00000158773 265 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Vipas39Q8BGQ1 Vmn1r-ps146-201ENSMUST00000176131 525 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Vipas39Q8BGQ1 Gm26928-201ENSMUST00000182674 572 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Vipas39Q8BGQ1 4930532M18Rik-201ENSMUST00000187189 481 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
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Vipas39Q8BGQ1 Gm42516-201ENSMUST00000198691 767 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Vipas39Q8BGQ1 Gm42850-201ENSMUST00000202094 201 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Vipas39Q8BGQ1 Gm45063-201ENSMUST00000203726 472 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
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Vipas39Q8BGQ1 Arhgef6-202ENSMUST00000114735 1614 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
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Vipas39Q8BGQ1 S100a5-202ENSMUST00000107329 431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
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Vipas39Q8BGQ1 Scgb2b16-ps-201ENSMUST00000188720 333 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
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Vipas39Q8BGQ1 Tprkb-214ENSMUST00000202803 716 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
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Vipas39Q8BGQ1 AC133498.1-203ENSMUST00000221213 668 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
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Vipas39Q8BGQ1 AC121966.1-201ENSMUST00000221458 282 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Vipas39Q8BGQ1 AC174797.4-201ENSMUST00000225510 347 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Vipas39Q8BGQ1 AC154515.2-201ENSMUST00000226093 406 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Vipas39Q8BGQ1 Tshb-201ENSMUST00000029450 605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Vipas39Q8BGQ1 Gm9765-201ENSMUST00000043170 321 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Vipas39Q8BGQ1 Vmn1r72-201ENSMUST00000053134 921 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Vipas39Q8BGQ1 Olfr381-201ENSMUST00000078358 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Vipas39Q8BGQ1 Gm45130-201ENSMUST00000207574 3388 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Vipas39Q8BGQ1 AC122840.2-201ENSMUST00000221030 2659 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Vipas39Q8BGQ1 C87977-201ENSMUST00000105753 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
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Vipas39Q8BGQ1 Gm21035-201ENSMUST00000207867 2608 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Vipas39Q8BGQ1 Snord14c-201ENSMUST00000101927 86 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Vipas39Q8BGQ1 Gm22115-201ENSMUST00000103976 133 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Vipas39Q8BGQ1 Gm23923-201ENSMUST00000104108 133 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Vipas39Q8BGQ1 Olfr133-201ENSMUST00000113636 1090 ntAPPRIS P1 BASIC3.19□□□□□ -1.9
Vipas39Q8BGQ1 Gm6121-201ENSMUST00000119231 924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
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