Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Gm44435-201ENSMUST00000204379 4119 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 C2cd6-201ENSMUST00000097080 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Diaph2-202ENSMUST00000113320 8196 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Gm45321-201ENSMUST00000209286 2863 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Olfr1220-203ENSMUST00000213288 4223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Pias1-201ENSMUST00000098651 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Nr3c1-204ENSMUST00000115571 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Cdh6-201ENSMUST00000036439 8167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 AC121598.3-201ENSMUST00000227179 1643 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Ing3-201ENSMUST00000031680 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Olfr1251-202ENSMUST00000214639 3071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 AC133498.1-201ENSMUST00000222871 2925 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Clcn5-201ENSMUST00000004428 8390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Gprc6a-203ENSMUST00000219286 2574 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Gm3033-201ENSMUST00000112792 438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Gm15223-201ENSMUST00000120989 826 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Gm22984-201ENSMUST00000122751 122 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Gm29094-201ENSMUST00000138109 664 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 4930517O19Rik-202ENSMUST00000145018 571 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Gm16218-201ENSMUST00000155424 388 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Gm20480-201ENSMUST00000173953 250 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Mirt2-201ENSMUST00000175179 285 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Gm24303-201ENSMUST00000178237 126 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Mrgpra9-202ENSMUST00000179005 1090 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Gm28755-201ENSMUST00000185773 199 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Gm18444-201ENSMUST00000191239 629 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Gm10048-201ENSMUST00000194196 372 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Gm44494-201ENSMUST00000196760 129 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 AC122464.1-201ENSMUST00000202789 770 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Gm44108-201ENSMUST00000203525 422 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Gm4045-201ENSMUST00000204076 310 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Gm31717-201ENSMUST00000213044 668 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 AC151968.1-201ENSMUST00000214437 568 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 AC129017.1-201ENSMUST00000228363 270 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Pirb-201ENSMUST00000078451 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Gm23517-201ENSMUST00000082830 192 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Gm22744-201ENSMUST00000083444 65 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Gm33609-201ENSMUST00000198559 2694 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Olfr1496-202ENSMUST00000209137 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Vmn2r89-201ENSMUST00000159611 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Prr14l-201ENSMUST00000120129 9959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Dnah2-201ENSMUST00000035539 13569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Slc38a4-201ENSMUST00000023101 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Olfr1104-202ENSMUST00000214857 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Ryr3-201ENSMUST00000080673 15422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Vmn1r219-202ENSMUST00000226845 5979 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Vmn1r219-205ENSMUST00000228666 5993 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Angel2-201ENSMUST00000027947 3562 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Ppargc1a-203ENSMUST00000132734 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Dlx6os1-201ENSMUST00000159568 4608 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 AC112142.1-203ENSMUST00000228670 2472 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Wdr17-202ENSMUST00000127511 4668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Gm20342-201ENSMUST00000185480 9720 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Pja2-201ENSMUST00000024888 4531 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Cylc1-201ENSMUST00000101282 1923 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Trappc1-203ENSMUST00000102602 751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Catsper4-202ENSMUST00000105878 632 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Gm13451-201ENSMUST00000117649 592 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Gm11456-201ENSMUST00000121070 256 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Rps15a-ps3-201ENSMUST00000121072 395 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Gm8761-201ENSMUST00000121507 955 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Trav20-201ENSMUST00000142754 347 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Gm25459-201ENSMUST00000157953 114 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Gm23662-201ENSMUST00000158046 111 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Gm26169-201ENSMUST00000158420 135 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Gm25654-201ENSMUST00000158467 88 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Gm3076-201ENSMUST00000161613 451 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Gm20542-201ENSMUST00000174582 372 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Nutf2-ps2-201ENSMUST00000179225 384 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Gm19427-201ENSMUST00000183619 208 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Mir6383-201ENSMUST00000184545 116 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Olfr1304-ps1-201ENSMUST00000208032 189 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 CT485612.4-201ENSMUST00000223405 250 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Gm23737-201ENSMUST00000082547 159 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Gm22685-201ENSMUST00000082848 106 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Olfr1090-201ENSMUST00000099875 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Olfr905-202ENSMUST00000214377 4429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Gm6205-202ENSMUST00000190001 2515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Gm42986-201ENSMUST00000201618 3385 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Hapln1-201ENSMUST00000022108 5715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Olfr1382-202ENSMUST00000213152 4236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Gm6645-201ENSMUST00000118505 2726 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Olfr1058-202ENSMUST00000213998 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Olfr1281-202ENSMUST00000208176 4905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Gm28679-201ENSMUST00000186013 1499 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Gm28291-202ENSMUST00000186921 1499 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Gm29547-201ENSMUST00000187258 1499 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Gm29265-201ENSMUST00000188697 1499 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Gm28947-203ENSMUST00000188701 1499 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Gm28842-202ENSMUST00000190289 1499 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Gm28633-202ENSMUST00000190867 1485 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Gm28632-202ENSMUST00000191193 1499 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Chl1-203ENSMUST00000203830 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Gm43185-201ENSMUST00000197507 2775 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Mkrn3Q60764 Psd3-214ENSMUST00000212960 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Mkrn3Q60764 Tnpo1-201ENSMUST00000109399 8445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Mkrn3Q60764 B3gnt5-203ENSMUST00000121344 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Mkrn3Q60764 Olfr1406-202ENSMUST00000201132 2952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Mkrn3Q60764 Xrn1-209ENSMUST00000190665 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Mkrn3Q60764 Olfr1065-202ENSMUST00000216162 2148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms