Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Gm29093-201ENSMUST00000187366 409 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Znf48Q3US17 Gm29489-201ENSMUST00000188934 324 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Znf48Q3US17 Ighv1-32-201ENSMUST00000195149 351 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Znf48Q3US17 Gm43250-201ENSMUST00000196536 273 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Znf48Q3US17 Gm43427-201ENSMUST00000198188 331 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Znf48Q3US17 Gm38670-201ENSMUST00000199248 77 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Znf48Q3US17 Gm6615-201ENSMUST00000199426 631 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Znf48Q3US17 Gm42579-201ENSMUST00000200512 734 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Znf48Q3US17 Gm44922-201ENSMUST00000206690 90 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Znf48Q3US17 Gm45273-201ENSMUST00000211559 281 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Znf48Q3US17 Gm30262-201ENSMUST00000219137 791 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Znf48Q3US17 AC101945.1-201ENSMUST00000226734 466 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Znf48Q3US17 Lelp1-201ENSMUST00000029535 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Znf48Q3US17 n-R5s180-201ENSMUST00000082770 106 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Znf48Q3US17 Mir10a-201ENSMUST00000083585 110 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Znf48Q3US17 Mir181b-2-201ENSMUST00000083644 89 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Znf48Q3US17 Slc6a15-202ENSMUST00000179636 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Znf48Q3US17 Qser1-201ENSMUST00000117237 8973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Znf48Q3US17 Akap11-201ENSMUST00000022593 5688 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Znf48Q3US17 AC124569.3-201ENSMUST00000224860 1621 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Znf48Q3US17 Kcnj2-201ENSMUST00000042970 5444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Znf48Q3US17 Ugt2b35-201ENSMUST00000031186 3359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Znf48Q3US17 Olfr913-201ENSMUST00000081095 2441 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Znf48Q3US17 Trps1-203ENSMUST00000183421 3446 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Znf48Q3US17 Slc7a2-203ENSMUST00000117077 7626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Znf48Q3US17 Rad21l-201ENSMUST00000096439 1650 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Znf48Q3US17 Utp14b-201ENSMUST00000053760 7393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Znf48Q3US17 Gm44171-201ENSMUST00000203701 2109 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Znf48Q3US17 Xpo1-203ENSMUST00000102870 3471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Znf48Q3US17 Nlrp5-202ENSMUST00000086341 3471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Znf48Q3US17 AC153365.1-201ENSMUST00000219016 2031 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Znf48Q3US17 Gm45304-201ENSMUST00000210303 2828 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Znf48Q3US17 Vmn1r67-202ENSMUST00000226237 2352 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Znf48Q3US17 4932415D10Rik-201ENSMUST00000171401 3163 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Znf48Q3US17 Zranb2-202ENSMUST00000106057 2737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Znf48Q3US17 Rtl9-201ENSMUST00000165829 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Znf48Q3US17 Gm36298-201ENSMUST00000223394 1732 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Znf48Q3US17 Gm884-201ENSMUST00000059279 10977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Znf48Q3US17 Gm25538-201ENSMUST00000101943 107 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Znf48Q3US17 Gm5751-201ENSMUST00000115561 444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Znf48Q3US17 Gm14267-201ENSMUST00000119751 496 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Znf48Q3US17 Gm15223-201ENSMUST00000120989 826 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Znf48Q3US17 Gm28020-201ENSMUST00000157739 67 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Znf48Q3US17 Gm22312-201ENSMUST00000158005 130 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Znf48Q3US17 Gm23209-201ENSMUST00000158667 110 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Znf48Q3US17 Rpl26-ps4-201ENSMUST00000170279 438 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Znf48Q3US17 Pkib-211ENSMUST00000177473 525 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Znf48Q3US17 Gm25121-201ENSMUST00000179846 79 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Znf48Q3US17 Zfp87-202ENSMUST00000181341 480 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Znf48Q3US17 Gm19206-201ENSMUST00000186401 827 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Znf48Q3US17 Gm28849-201ENSMUST00000188127 174 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Znf48Q3US17 Gm28330-201ENSMUST00000190353 171 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Znf48Q3US17 Gm29454-201ENSMUST00000190805 393 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Znf48Q3US17 Gm38015-201ENSMUST00000193048 188 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Znf48Q3US17 Gm3143-202ENSMUST00000198364 675 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Znf48Q3US17 Gm8013-201ENSMUST00000200139 462 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Znf48Q3US17 Gm42643-201ENSMUST00000200504 279 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Znf48Q3US17 Gm44076-201ENSMUST00000203072 520 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Znf48Q3US17 Gm10445-201ENSMUST00000203521 762 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Znf48Q3US17 Gm5318-201ENSMUST00000205249 406 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Znf48Q3US17 Gm44960-201ENSMUST00000207403 141 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Znf48Q3US17 AC154335.2-201ENSMUST00000225916 638 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Znf48Q3US17 Gm10916-201ENSMUST00000080330 483 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Znf48Q3US17 Zfp994-201ENSMUST00000179996 4880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Znf48Q3US17 Gm37971-201ENSMUST00000193516 3391 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Znf48Q3US17 Olfr78-204ENSMUST00000217123 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Znf48Q3US17 Fam107b-209ENSMUST00000226435 3602 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Znf48Q3US17 Vmn2r5-201ENSMUST00000170270 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Znf48Q3US17 Ktn1-221ENSMUST00000190535 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Znf48Q3US17 Mme-205ENSMUST00000194134 8039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Znf48Q3US17 Gm26984-201ENSMUST00000182345 3510 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Znf48Q3US17 Vmn2r101-201ENSMUST00000171914 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Znf48Q3US17 Gm43000-201ENSMUST00000198482 3343 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Znf48Q3US17 Vcam1-201ENSMUST00000029574 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Znf48Q3US17 Olfr178-203ENSMUST00000215032 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Znf48Q3US17 Olfr716-206ENSMUST00000215284 3515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Znf48Q3US17 Olfr753-ps1-203ENSMUST00000208970 2764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Znf48Q3US17 Olfr107-202ENSMUST00000215894 2512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Znf48Q3US17 Nsd1-201ENSMUST00000099490 12784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Znf48Q3US17 Gabrq-201ENSMUST00000033711 2000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Znf48Q3US17 Trim5-202ENSMUST00000098179 3655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Znf48Q3US17 Zpld1-202ENSMUST00000143914 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Znf48Q3US17 Gm26078-201ENSMUST00000104067 128 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Znf48Q3US17 Gm24671-201ENSMUST00000104159 158 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Znf48Q3US17 Gm13811-201ENSMUST00000117800 256 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Znf48Q3US17 Gm15206-201ENSMUST00000119143 454 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Znf48Q3US17 Gm12704-201ENSMUST00000119789 464 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Znf48Q3US17 Gm14875-201ENSMUST00000120881 319 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Znf48Q3US17 Gm15634-201ENSMUST00000147206 492 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Znf48Q3US17 Gm24481-201ENSMUST00000157210 102 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Znf48Q3US17 Gm25720-201ENSMUST00000157503 105 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Znf48Q3US17 Gm25664-201ENSMUST00000157697 107 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Znf48Q3US17 Gm22118-201ENSMUST00000175593 171 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Znf48Q3US17 Stx5a-215ENSMUST00000176570 563 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Znf48Q3US17 Gm22420-201ENSMUST00000178795 126 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Znf48Q3US17 Gm28017-201ENSMUST00000183434 126 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Znf48Q3US17 Gm27887-201ENSMUST00000184367 102 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Znf48Q3US17 Gm27245-201ENSMUST00000184385 376 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Znf48Q3US17 Gm2950-201ENSMUST00000185530 520 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Znf48Q3US17 Gm28453-203ENSMUST00000187041 189 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.4 ms