Protein–RNA interactions for Protein: P62858

Rps28, 40S ribosomal protein S28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps28P62858 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Rps28P62858 Gm14073-201ENSMUST00000117344 381 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Rps28P62858 Gm14584-201ENSMUST00000118956 637 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Rps28P62858 Gm15029-201ENSMUST00000119742 199 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Rps28P62858 Gm15205-201ENSMUST00000129329 632 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Rps28P62858 Gm15692-201ENSMUST00000152173 352 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Rps28P62858 Gm12510-201ENSMUST00000152190 362 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Rps28P62858 Mir1970-201ENSMUST00000157839 104 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Rps28P62858 Gm23642-201ENSMUST00000157858 258 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Rps28P62858 Gm25989-201ENSMUST00000158761 133 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Rps28P62858 Gm7241-201ENSMUST00000159853 357 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Rps28P62858 Gm10357-201ENSMUST00000159886 264 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Rps28P62858 Gm15508-201ENSMUST00000160330 325 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Rps28P62858 Gm16298-201ENSMUST00000161107 420 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Rps28P62858 Gm20538-201ENSMUST00000166808 225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Rps28P62858 Gm5916-201ENSMUST00000168452 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
Rps28P62858 Gm9597-201ENSMUST00000171913 602 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Rps28P62858 1700001F09Rik-201ENSMUST00000178178 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
Rps28P62858 Gm6900-201ENSMUST00000178971 342 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Rps28P62858 Mir6987-201ENSMUST00000184789 73 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Rps28P62858 Mir6400-201ENSMUST00000184870 92 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Rps28P62858 Gm20897-201ENSMUST00000185240 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
Rps28P62858 Gm20883-201ENSMUST00000185245 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
Rps28P62858 Gm21117-202ENSMUST00000185327 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
Rps28P62858 Gm20916-202ENSMUST00000185338 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
Rps28P62858 Gm28897-201ENSMUST00000185340 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
Rps28P62858 Gm20736-202ENSMUST00000185550 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
Rps28P62858 Gm20835-201ENSMUST00000185565 923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Rps28P62858 Gm29564-201ENSMUST00000185575 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
Rps28P62858 Gm29299-201ENSMUST00000185609 923 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Rps28P62858 Gm21317-201ENSMUST00000185636 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
Rps28P62858 Gm21095-202ENSMUST00000185776 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
Rps28P62858 Gm28553-201ENSMUST00000185924 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
Rps28P62858 Gm20908-201ENSMUST00000186004 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
Rps28P62858 Gm20906-201ENSMUST00000186493 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
Rps28P62858 Gm20929-201ENSMUST00000186578 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
Rps28P62858 Gm21518-202ENSMUST00000186938 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
Rps28P62858 Gm20855-202ENSMUST00000186996 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
Rps28P62858 Gm20911-201ENSMUST00000187135 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
Rps28P62858 Gm28102-201ENSMUST00000187146 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
Rps28P62858 Gm28827-201ENSMUST00000187165 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
Rps28P62858 Gm20931-202ENSMUST00000187293 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
Rps28P62858 Gm21760-202ENSMUST00000187433 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
Rps28P62858 Gm20920-201ENSMUST00000187477 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
Rps28P62858 Gm21627-201ENSMUST00000187768 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
Rps28P62858 Gm29554-201ENSMUST00000187922 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Rps28P62858 Gm20850-201ENSMUST00000188672 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
Rps28P62858 Gm21488-201ENSMUST00000188744 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
Rps28P62858 Gm20820-201ENSMUST00000188754 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
Rps28P62858 Gm20894-201ENSMUST00000188864 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
Rps28P62858 Gm20869-201ENSMUST00000188958 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
Rps28P62858 Gm21173-201ENSMUST00000189238 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
Rps28P62858 Gm20870-201ENSMUST00000189315 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Rps28P62858 Gm20903-201ENSMUST00000189346 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
Rps28P62858 Gm21209-202ENSMUST00000189354 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
Rps28P62858 Gm20937-203ENSMUST00000189422 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
Rps28P62858 Gm20890-201ENSMUST00000189518 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
Rps28P62858 Gm21477-202ENSMUST00000189543 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
Rps28P62858 Gm29110-201ENSMUST00000189924 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
Rps28P62858 Gm20814-201ENSMUST00000190173 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
Rps28P62858 Gm29573-201ENSMUST00000190291 919 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Rps28P62858 Sly-202ENSMUST00000190292 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
Rps28P62858 Gm28188-201ENSMUST00000190483 236 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Rps28P62858 Gm21650-202ENSMUST00000190551 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
Rps28P62858 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
Rps28P62858 Gm20905-201ENSMUST00000190782 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
Rps28P62858 Gm20817-201ENSMUST00000191123 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
Rps28P62858 Gm20843-202ENSMUST00000191305 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
Rps28P62858 Gm28271-201ENSMUST00000191369 351 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Rps28P62858 Gm21258-202ENSMUST00000191553 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
Rps28P62858 Gm29866-201ENSMUST00000191675 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
Rps28P62858 Gm31571-201ENSMUST00000192521 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
Rps28P62858 Gm30737-201ENSMUST00000192683 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
Rps28P62858 Gm18956-201ENSMUST00000192857 480 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Rps28P62858 Gm21366-201ENSMUST00000192892 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
Rps28P62858 Gm37421-201ENSMUST00000193088 132 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Rps28P62858 Gm37416-201ENSMUST00000193596 318 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Rps28P62858 Gm35134-201ENSMUST00000194086 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
Rps28P62858 Gm43765-201ENSMUST00000196303 893 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Rps28P62858 Igkv4-75-201ENSMUST00000197204 359 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Rps28P62858 Gm18341-201ENSMUST00000197538 622 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Rps28P62858 Gm31693-201ENSMUST00000200150 909 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
Rps28P62858 Gm45080-201ENSMUST00000206648 283 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Rps28P62858 Gm44657-201ENSMUST00000208568 450 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Rps28P62858 AC158523.2-201ENSMUST00000222708 548 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Rps28P62858 Vmn1r39-202ENSMUST00000226783 918 ntAPPRIS P2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Rps28P62858 Olfr478-201ENSMUST00000049719 945 ntAPPRIS P1 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Rps28P62858 Olfr779-201ENSMUST00000069063 390 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Rps28P62858 Vmn1r80-201ENSMUST00000075053 927 ntAPPRIS P1 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Rps28P62858 Gm26226-201ENSMUST00000082509 116 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Rps28P62858 Gm25739-201ENSMUST00000082886 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Rps28P62858 Mir133a-2-201ENSMUST00000083526 104 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Rps28P62858 Mir93-201ENSMUST00000083593 88 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Rps28P62858 Mir449a-201ENSMUST00000083641 91 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Rps28P62858 Clec9a-202ENSMUST00000088075 1020 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
Rps28P62858 Gm5152-202ENSMUST00000088625 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Rps28P62858 Prl2b1-201ENSMUST00000091678 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
Rps28P62858 Olfr194-203ENSMUST00000216519 3705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Rps28P62858 Samt2-201ENSMUST00000101137 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
Rps28P62858 Trbv4-201ENSMUST00000103265 393 ntAPPRIS P1 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.2 ms