Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Slamf6-207ENSMUST00000195656 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Cdk14-203ENSMUST00000115451 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 1700008H02Rik-201ENSMUST00000201220 1684 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Ubtfl1-203ENSMUST00000169398 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm24121-201ENSMUST00000102029 106 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Igkv8-19-201ENSMUST00000103389 305 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm24120-201ENSMUST00000103978 129 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm22266-201ENSMUST00000104011 138 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm25875-201ENSMUST00000104323 107 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Igkv13-85-201ENSMUST00000114212 347 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm12285-201ENSMUST00000117347 233 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm14142-201ENSMUST00000117833 296 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm13755-201ENSMUST00000118509 305 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm14520-201ENSMUST00000119258 387 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm14841-201ENSMUST00000121067 758 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm26279-201ENSMUST00000157095 102 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm25058-201ENSMUST00000157365 128 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm24402-201ENSMUST00000157873 91 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm25714-201ENSMUST00000158626 296 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm23209-201ENSMUST00000158667 110 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm7271-201ENSMUST00000172369 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm23151-201ENSMUST00000178061 107 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm25473-201ENSMUST00000180191 107 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm29504-201ENSMUST00000185605 537 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm28565-202ENSMUST00000186615 537 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm28297-201ENSMUST00000186679 537 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm29578-201ENSMUST00000188809 537 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm29166-202ENSMUST00000189600 537 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Scgb3a2-203ENSMUST00000189750 578 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm28765-201ENSMUST00000189752 537 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm28522-202ENSMUST00000190561 537 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm37624-201ENSMUST00000193751 219 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm37882-201ENSMUST00000195254 196 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm37445-201ENSMUST00000195318 242 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm43749-201ENSMUST00000199345 352 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 AC151971.3-201ENSMUST00000214694 404 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm19256-201ENSMUST00000218550 231 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 AC155922.1-201ENSMUST00000220100 373 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 AC163357.1-201ENSMUST00000220847 233 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 AC122298.1-201ENSMUST00000222574 165 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Tmed10-203ENSMUST00000222585 619 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 AC154576.1-201ENSMUST00000225864 563 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm23508-201ENSMUST00000083079 72 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm24045-201ENSMUST00000083113 98 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm25139-201ENSMUST00000083247 210 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm25187-201ENSMUST00000083906 133 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 BC100530-201ENSMUST00000096089 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Olfr417-203ENSMUST00000220394 6080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Slc6a15-201ENSMUST00000074204 3607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Tnrc6b-201ENSMUST00000067689 17332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Ankrd49-202ENSMUST00000214456 3207 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Lrrc4c-203ENSMUST00000162807 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Olfr984-202ENSMUST00000213858 5186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Vmn2r2-202ENSMUST00000177151 2727 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Eya4-201ENSMUST00000074366 3488 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm37456-201ENSMUST00000193176 5837 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Lrrc4c-202ENSMUST00000135431 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm15581-201ENSMUST00000131334 5640 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
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Hoxd9P28357 Vmn1r57-202ENSMUST00000227798 2409 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.61
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Hoxd9P28357 Nlrp4c-202ENSMUST00000121583 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
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Hoxd9P28357 Gm11419-201ENSMUST00000150772 683 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
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Hoxd9P28357 Pkib-209ENSMUST00000177325 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
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Hoxd9P28357 Gm27781-201ENSMUST00000185185 92 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
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Hoxd9P28357 Sprr2h-202ENSMUST00000191886 297 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gm43214-201ENSMUST00000199242 352 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gm42500-201ENSMUST00000199898 517 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Mgst1-208ENSMUST00000204628 471 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gm18007-201ENSMUST00000205019 844 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Spata19-202ENSMUST00000214158 627 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 AC159821.1-201ENSMUST00000214934 248 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 AC158622.1-201ENSMUST00000217107 230 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gm18904-201ENSMUST00000218756 329 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gm30262-201ENSMUST00000219137 791 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 AC132324.1-201ENSMUST00000221855 584 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 AC165953.1-201ENSMUST00000226386 357 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 n-R5s173-201ENSMUST00000082620 119 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gm25134-201ENSMUST00000082646 160 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gm16892-201ENSMUST00000180999 1726 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Ncoa7-203ENSMUST00000213836 2989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Vmn1r27-203ENSMUST00000228530 3115 ntAPPRIS P2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Ptprd-217ENSMUST00000174023 4530 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Zbtb38-212ENSMUST00000152594 7406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gm2366-201ENSMUST00000180753 3982 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gm42860-201ENSMUST00000196492 3991 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
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