Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Rps13-ps8-201ENSMUST00000118906 401 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm11429-201ENSMUST00000119089 144 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm7079-201ENSMUST00000119726 171 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm15331-201ENSMUST00000120225 385 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm13396-201ENSMUST00000120617 271 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm13153-201ENSMUST00000120969 637 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 AA413626-201ENSMUST00000121125 494 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm12779-201ENSMUST00000121496 143 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Rps11-ps2-201ENSMUST00000121547 456 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm23233-201ENSMUST00000157301 137 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm23759-201ENSMUST00000158351 268 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Pkib-209ENSMUST00000177325 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm24520-201ENSMUST00000179510 110 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm26844-201ENSMUST00000181690 673 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm26983-201ENSMUST00000182051 388 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Mir6412-201ENSMUST00000184477 97 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Ska2l-ps-201ENSMUST00000186208 360 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm37609-201ENSMUST00000191778 678 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm8939-201ENSMUST00000192577 964 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm34882-201ENSMUST00000193245 974 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm37624-201ENSMUST00000193751 219 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm37571-201ENSMUST00000195048 614 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm44391-201ENSMUST00000198490 93 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm45069-201ENSMUST00000208604 317 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 AC126267.1-201ENSMUST00000214282 284 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 AC158622.1-201ENSMUST00000217107 230 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 AC133650.1-201ENSMUST00000217243 578 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 AC132474.2-201ENSMUST00000217414 573 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 AC127242.4-201ENSMUST00000221242 470 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
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Hoxb1P17919 AC126554.2-201ENSMUST00000223259 400 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Prss37-201ENSMUST00000031967 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Ccl26-201ENSMUST00000094226 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Slfn8-202ENSMUST00000092838 3529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm44439-201ENSMUST00000203379 3592 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 AC151734.1-201ENSMUST00000227023 1740 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Olfr902-202ENSMUST00000213105 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Olfr1348-207ENSMUST00000209029 2696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Usp29-203ENSMUST00000198068 4420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Psg27-201ENSMUST00000094794 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Nxf2-201ENSMUST00000010085 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Nxf2-203ENSMUST00000113189 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm38299-201ENSMUST00000193214 3789 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Erv3-201ENSMUST00000040941 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
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Hoxb1P17919 Gm42481-201ENSMUST00000196822 2178 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Olfr1500-202ENSMUST00000214475 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Fbxl17-204ENSMUST00000112840 3667 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Mier1-202ENSMUST00000097945 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Olfr220-202ENSMUST00000194229 3286 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Trav8d-2-201ENSMUST00000103605 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm13329-201ENSMUST00000117063 265 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm15783-201ENSMUST00000117521 633 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm14971-201ENSMUST00000117980 663 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm11699-201ENSMUST00000119016 401 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
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Hoxb1P17919 2310016D23Rik-201ENSMUST00000130082 388 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
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Hoxb1P17919 Sprr2d-201ENSMUST00000047477 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm23041-201ENSMUST00000083868 106 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Ktn1-203ENSMUST00000185940 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Ktn1-208ENSMUST00000187039 3875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Vmn1r34-202ENSMUST00000226262 2952 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Foxr2-202ENSMUST00000163801 3072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Btbd35f1-201ENSMUST00000178070 1955 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Glcci1-203ENSMUST00000161494 3248 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm15011-201ENSMUST00000117724 1480 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Setd2-201ENSMUST00000153838 8350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Tmc1-201ENSMUST00000039500 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Bclaf1-201ENSMUST00000043881 5437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm19950-204ENSMUST00000208167 4196 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Abcb5-201ENSMUST00000035515 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Usp46-202ENSMUST00000119154 4738 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Ugt2b1-201ENSMUST00000031183 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Olfr870-202ENSMUST00000215984 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm8979-201ENSMUST00000183386 7296 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 D030040B21Rik-201ENSMUST00000181371 2788 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm24951-201ENSMUST00000102182 109 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Igkv13-85-201ENSMUST00000114212 347 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm14806-201ENSMUST00000116606 2110 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm23178-201ENSMUST00000116782 95 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.4 ms