Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Zfp280c-202ENSMUST00000076635 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
Gm20918J3QN17 Zfp979-201ENSMUST00000037565 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Gm20918J3QN17 Gm25308-201ENSMUST00000104171 158 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Gm20918J3QN17 Gm24376-201ENSMUST00000104399 127 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Gm20918J3QN17 Gm25500-201ENSMUST00000104426 123 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Gm20918J3QN17 Mir878-201ENSMUST00000104680 78 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Gm20918J3QN17 Gm13329-201ENSMUST00000117063 265 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Gm20918J3QN17 Rpl31-ps5-201ENSMUST00000118086 375 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Gm20918J3QN17 Klrc1-203ENSMUST00000118447 684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
Gm20918J3QN17 Gm12880-201ENSMUST00000120652 494 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Gm20918J3QN17 Gm9785-202ENSMUST00000144563 593 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Gm20918J3QN17 Gm11419-201ENSMUST00000150772 683 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
Gm20918J3QN17 Tpo-203ENSMUST00000155263 664 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
Gm20918J3QN17 Gm20407-201ENSMUST00000172891 598 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Gm20918J3QN17 Obox4-ps6-201ENSMUST00000176578 724 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Gm20918J3QN17 Mir7242-201ENSMUST00000183710 79 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Gm20918J3QN17 Prl8a8-201ENSMUST00000018389 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
Gm20918J3QN17 Mir6926-201ENSMUST00000184562 68 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Gm20918J3QN17 Gm37866-201ENSMUST00000191950 696 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Gm20918J3QN17 Gm37418-201ENSMUST00000195031 274 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Gm20918J3QN17 Gm33973-201ENSMUST00000195148 534 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Gm20918J3QN17 Gm42468-201ENSMUST00000200360 703 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Gm20918J3QN17 Gm29521-204ENSMUST00000216859 279 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Gm20918J3QN17 Gm18892-201ENSMUST00000217628 881 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Gm20918J3QN17 Gm7745-202ENSMUST00000222914 567 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
Gm20918J3QN17 Gnrh1-202ENSMUST00000223929 428 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Gm20918J3QN17 AC147628.1-201ENSMUST00000228193 688 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Gm20918J3QN17 Olfr867-201ENSMUST00000060780 996 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Gm20918J3QN17 Sult2a2-201ENSMUST00000086148 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
Gm20918J3QN17 Olfr68-202ENSMUST00000216811 4093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Gm20918J3QN17 Olfr800-202ENSMUST00000217094 3831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Gm20918J3QN17 Gm32693-201ENSMUST00000196538 2402 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
Gm20918J3QN17 Gm10377-201ENSMUST00000100695 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
Gm20918J3QN17 Gm14621-201ENSMUST00000117709 689 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Gm20918J3QN17 Gm1993-201ENSMUST00000120268 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Gm20918J3QN17 Gm12693-201ENSMUST00000121965 483 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Gm20918J3QN17 Gm25292-201ENSMUST00000122797 322 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Gm20918J3QN17 Gm13901-201ENSMUST00000137252 468 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Gm20918J3QN17 Gm16300-201ENSMUST00000160031 1279 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Gm20918J3QN17 Gm8338-201ENSMUST00000163928 363 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Gm20918J3QN17 Gm17166-201ENSMUST00000172006 431 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Gm20918J3QN17 Gm12002-203ENSMUST00000174550 923 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Gm20918J3QN17 Gm23633-201ENSMUST00000175293 119 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Gm20918J3QN17 Gm20619-202ENSMUST00000176283 1085 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
Gm20918J3QN17 Gm21870-201ENSMUST00000179973 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Gm20918J3QN17 Gm27698-201ENSMUST00000184060 249 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Gm20918J3QN17 Mir6975-201ENSMUST00000184879 61 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Gm20918J3QN17 Fam122c-203ENSMUST00000186314 898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Gm20918J3QN17 4930553J12Rik-202ENSMUST00000187823 851 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Gm20918J3QN17 Gm19280-201ENSMUST00000190191 205 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Gm20918J3QN17 Gm30341-201ENSMUST00000194363 289 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Gm20918J3QN17 Gm37523-201ENSMUST00000194901 412 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Gm20918J3QN17 Gm43521-201ENSMUST00000197838 255 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Gm20918J3QN17 Gm43107-201ENSMUST00000198729 255 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Gm20918J3QN17 Gm43468-201ENSMUST00000199769 397 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Gm20918J3QN17 Gm19039-201ENSMUST00000204363 575 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Gm20918J3QN17 4930455B14Rik-203ENSMUST00000223613 640 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Gm20918J3QN17 AC161453.1-201ENSMUST00000226078 884 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Gm20918J3QN17 AC164100.1-201ENSMUST00000227214 508 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Gm20918J3QN17 Spata45-201ENSMUST00000077889 432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Gm20918J3QN17 Olfr814-201ENSMUST00000081367 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Gm20918J3QN17 n-R5s166-201ENSMUST00000082898 121 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Gm20918J3QN17 Gm24611-201ENSMUST00000083272 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Gm20918J3QN17 Zfp85-202ENSMUST00000144183 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
Gm20918J3QN17 Olfr1325-202ENSMUST00000216007 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Gm20918J3QN17 Olfr420-202ENSMUST00000213748 3806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Gm20918J3QN17 AC126673.3-201ENSMUST00000223414 3829 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Gm20918J3QN17 Gpr174-203ENSMUST00000118820 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
Gm20918J3QN17 Gm37645-201ENSMUST00000194285 3556 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Gm20918J3QN17 Ighv16-1-201ENSMUST00000103470 299 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Gm20918J3QN17 Gm26341-201ENSMUST00000104561 134 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Gm20918J3QN17 Olfr1327-ps1-201ENSMUST00000117953 835 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Gm20918J3QN17 Gm12230-201ENSMUST00000118301 454 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Gm20918J3QN17 Gimap4-204ENSMUST00000119575 900 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Gm20918J3QN17 Gm28039-201ENSMUST00000149128 254 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Gm20918J3QN17 Gm23168-201ENSMUST00000157156 143 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Gm20918J3QN17 Gm24879-201ENSMUST00000158386 143 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Gm20918J3QN17 Gm23380-201ENSMUST00000158448 103 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Gm20918J3QN17 Taf1d-202ENSMUST00000164079 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
Gm20918J3QN17 Vmn1r88-201ENSMUST00000171783 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Gm20918J3QN17 Gm21147-201ENSMUST00000186046 913 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Gm20918J3QN17 Obox4-ps5-201ENSMUST00000196368 397 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Gm20918J3QN17 Obox4-ps4-201ENSMUST00000196934 397 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Gm20918J3QN17 Gm44903-201ENSMUST00000206840 130 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Gm20918J3QN17 AC147545.1-201ENSMUST00000227528 108 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Gm20918J3QN17 Olfr1141-201ENSMUST00000099846 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Gm20918J3QN17 Gm38706-201ENSMUST00000182397 2617 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Gm20918J3QN17 Gm43780-201ENSMUST00000196510 3600 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Gm20918J3QN17 Gm42479-201ENSMUST00000198654 1356 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Gm20918J3QN17 Olfr65-203ENSMUST00000214300 2855 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Gm20918J3QN17 Olfr1111-203ENSMUST00000216378 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Gm20918J3QN17 U2surp-202ENSMUST00000079659 7630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
Gm20918J3QN17 Olfr594-202ENSMUST00000214051 2809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Gm20918J3QN17 Olfr1228-202ENSMUST00000215447 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Gm20918J3QN17 Gpr82-201ENSMUST00000053659 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
Gm20918J3QN17 Gm9972-201ENSMUST00000069051 1533 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Gm20918J3QN17 Traj44-201ENSMUST00000103698 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Gm20918J3QN17 Hmgb1-rs18-201ENSMUST00000117940 627 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Gm20918J3QN17 Gm2066-201ENSMUST00000118046 389 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Gm20918J3QN17 Gm14469-201ENSMUST00000118363 202 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.4 ms