Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm15148-201ENSMUST00000117602 156 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm11913-201ENSMUST00000119094 336 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm12693-201ENSMUST00000121965 483 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm11351-201ENSMUST00000139335 583 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm10721-201ENSMUST00000143083 669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm10715-201ENSMUST00000155807 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm24244-201ENSMUST00000157317 130 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm26271-201ENSMUST00000158349 104 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm17542-201ENSMUST00000169859 99 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm17535-201ENSMUST00000178641 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm11168-204ENSMUST00000179881 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm3543-202ENSMUST00000179947 231 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm18448-201ENSMUST00000186286 599 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 1810022K09Rik-204ENSMUST00000186870 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm28625-201ENSMUST00000188309 205 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm37337-201ENSMUST00000192601 993 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm38080-201ENSMUST00000194035 268 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm42438-201ENSMUST00000197832 974 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm3143-202ENSMUST00000198364 675 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Olfr436-ps1-201ENSMUST00000203108 284 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm44059-201ENSMUST00000204048 351 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm45146-201ENSMUST00000207108 221 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Olfr512-202ENSMUST00000209620 1056 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Olfr490-202ENSMUST00000211345 1275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Olfr936-202ENSMUST00000216912 937 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 AC153924.1-201ENSMUST00000220117 312 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm45941-201ENSMUST00000221907 675 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 CT030184.1-201ENSMUST00000222393 416 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 CR974485.1-201ENSMUST00000222408 402 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 AC130823.2-201ENSMUST00000226169 290 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 AC154598.1-201ENSMUST00000227079 347 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Klra6-201ENSMUST00000074056 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Olfr512-201ENSMUST00000074730 1056 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm10718-201ENSMUST00000099046 681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Olfr1277-202ENSMUST00000214760 5944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Vmn1r89-204ENSMUST00000227239 1992 ntAPPRIS P2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm14696-201ENSMUST00000144294 3976 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm9911-201ENSMUST00000211467 2802 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm14445-201ENSMUST00000117051 1484 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Vmn1r46-204ENSMUST00000228231 13338 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Mga-202ENSMUST00000079934 13304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Slc25a36-201ENSMUST00000035024 4043 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 AC134917.1-201ENSMUST00000220517 1449 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm25764-201ENSMUST00000104092 134 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 n-R5s219-201ENSMUST00000104328 132 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm22091-201ENSMUST00000116908 127 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm14731-201ENSMUST00000119216 376 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Hmgb1-ps5-201ENSMUST00000121058 557 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm16458-201ENSMUST00000121428 502 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Tarbp2-207ENSMUST00000142114 420 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm15323-201ENSMUST00000156109 429 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm25667-201ENSMUST00000157701 275 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Ear-ps10-201ENSMUST00000161871 460 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm5263-201ENSMUST00000163646 601 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm17332-201ENSMUST00000165626 87 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm6486-201ENSMUST00000166202 434 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm20693-201ENSMUST00000177431 211 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm24925-201ENSMUST00000178157 107 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm23269-201ENSMUST00000178701 107 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm28010-201ENSMUST00000179485 126 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm22307-201ENSMUST00000180019 107 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Snhg5-202ENSMUST00000182232 781 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 2210017I01Rik-201ENSMUST00000195278 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
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Grik3B1AS29 Gm18635-201ENSMUST00000199020 1060 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Spcs2-202ENSMUST00000207063 727 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm39154-201ENSMUST00000210257 560 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm36243-201ENSMUST00000211546 610 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm35371-201ENSMUST00000216204 579 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 AC116726.2-201ENSMUST00000217629 986 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 CT009754.1-201ENSMUST00000223489 558 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 AC239878.1-201ENSMUST00000224212 506 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Vmn1r81-203ENSMUST00000227973 14002 ntAPPRIS P2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm25480-201ENSMUST00000083217 133 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Olfr1404-203ENSMUST00000217374 3686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm13912-201ENSMUST00000156541 1860 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Iigp1-201ENSMUST00000032473 3121 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Mmrn1-203ENSMUST00000204333 4472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm38260-201ENSMUST00000193573 3995 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Olfr1043-204ENSMUST00000216028 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Olfr1009-203ENSMUST00000216443 4047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Zfp616-201ENSMUST00000074813 5014 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm45389-201ENSMUST00000211163 3399 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Iglv3-201ENSMUST00000103751 381 ntAPPRIS P1 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm22591-201ENSMUST00000104243 106 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm3443-201ENSMUST00000112772 285 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm15108-201ENSMUST00000116160 803 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm12598-201ENSMUST00000117333 830 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm14358-201ENSMUST00000118458 403 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Mup-ps20-201ENSMUST00000121132 389 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 8030453O22Rik-201ENSMUST00000128919 370 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 1700071G01Rik-201ENSMUST00000146728 367 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm11640-201ENSMUST00000155987 272 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm22310-201ENSMUST00000157509 116 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm25555-201ENSMUST00000158078 111 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm26005-201ENSMUST00000158802 134 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm15689-201ENSMUST00000160604 1159 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 D830030K20Rik-202ENSMUST00000178670 441 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm5527-201ENSMUST00000179821 642 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm29641-201ENSMUST00000188955 259 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
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