Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Gm23120-201ENSMUST00000157654 287 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Gm24191-201ENSMUST00000157977 122 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Gm23262-201ENSMUST00000158323 168 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Gm5750-201ENSMUST00000218711 801 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 1700030L22Rik-201ENSMUST00000221214 567 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Gm19786-201ENSMUST00000222589 580 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Gm4987-201ENSMUST00000078326 408 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 BC100530-201ENSMUST00000096089 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Olfr1270-203ENSMUST00000215578 4982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Vmn1r171-210ENSMUST00000228484 2421 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Copg2-201ENSMUST00000048774 3961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Mboat2-204ENSMUST00000221952 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Psd3-206ENSMUST00000120071 9203 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Olfr1109-202ENSMUST00000214636 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Slc22a27-202ENSMUST00000182102 1801 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Gtdc1-203ENSMUST00000112810 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Ptgs2os-202ENSMUST00000181915 2937 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Gm43000-201ENSMUST00000198482 3343 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Gm11633-201ENSMUST00000118176 444 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Gm13880-201ENSMUST00000118421 474 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Gm12779-201ENSMUST00000121496 143 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 n-R5s61-201ENSMUST00000122711 118 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Gm23318-201ENSMUST00000158000 108 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Gm22383-201ENSMUST00000158188 327 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Rpl26-ps4-201ENSMUST00000170279 438 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Gm29320-201ENSMUST00000185235 615 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Gm28257-201ENSMUST00000185244 463 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Gm29179-202ENSMUST00000186138 615 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Gm29448-201ENSMUST00000186675 615 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Gm29314-201ENSMUST00000186800 615 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Gm28253-202ENSMUST00000187971 615 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Gm29169-201ENSMUST00000189835 615 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Gm10292-202ENSMUST00000193165 585 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Kcnmb2-206ENSMUST00000194796 338 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Gm42825-201ENSMUST00000198883 723 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Snhg1-205ENSMUST00000205825 495 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Gm44871-201ENSMUST00000207821 497 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Gm18252-201ENSMUST00000214814 527 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Olfr1070-ps1-201ENSMUST00000215939 388 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 1700019M22Rik-201ENSMUST00000073560 354 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Defb41-201ENSMUST00000088463 467 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Gm25207-201ENSMUST00000093745 107 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Postn-204ENSMUST00000117373 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Olfr1295-203ENSMUST00000217772 5539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 4921515E04Rik-202ENSMUST00000226383 1738 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Olfr190-203ENSMUST00000216495 8240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Mef2c-202ENSMUST00000163888 6277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 AC137871.4-201ENSMUST00000226323 3901 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Catsperg2-201ENSMUST00000061193 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Kcnj2-201ENSMUST00000042970 5444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 AC162908.1-201ENSMUST00000219164 4563 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Ccl28-201ENSMUST00000099241 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Olfr446-203ENSMUST00000215686 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Mier1-202ENSMUST00000097945 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Erbin-202ENSMUST00000053927 6103 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Ktn1-203ENSMUST00000185940 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Ktn1-208ENSMUST00000187039 3875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Gm44026-201ENSMUST00000203985 2088 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Gm37890-201ENSMUST00000195610 3992 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Igkv1-133-201ENSMUST00000103304 374 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
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Prdm16A2A935 Vma21-ps-201ENSMUST00000114578 306 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
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Prdm16A2A935 Rny1-201ENSMUST00000083767 112 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Sulf1-202ENSMUST00000177608 5598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
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Prdm16A2A935 Ncl-201ENSMUST00000027438 8202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Olfr516-203ENSMUST00000217279 1441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Smc5-206ENSMUST00000226111 3265 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Gm42860-201ENSMUST00000196492 3991 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Gm43605-201ENSMUST00000199663 3426 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Gm42528-201ENSMUST00000200697 3418 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Virma-203ENSMUST00000108307 6571 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Zfp322a-201ENSMUST00000050101 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Gbp9-201ENSMUST00000031238 4381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Elavl2-202ENSMUST00000102799 3840 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Vmn2r110-201ENSMUST00000169559 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Iqca-207ENSMUST00000212394 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Olfr870-202ENSMUST00000215984 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Slc7a2-203ENSMUST00000117077 7626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Gm23941-201ENSMUST00000101953 107 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Gm13046-201ENSMUST00000117391 501 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Gm13752-201ENSMUST00000138195 491 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 P2ry12-202ENSMUST00000170388 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Gm7271-201ENSMUST00000172369 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Gm29429-201ENSMUST00000187071 121 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Gm29665-201ENSMUST00000191457 528 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Obox4-ps25-201ENSMUST00000199090 210 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 AC157515.1-201ENSMUST00000220953 450 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 AC121804.2-201ENSMUST00000222531 316 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 AC129202.3-201ENSMUST00000224413 733 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
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