Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

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Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm5396-201ENSMUST00000121222 532 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Gm15762-201ENSMUST00000126447 333 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Ifi206-202ENSMUST00000169797 429 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r-ps68-201ENSMUST00000174638 399 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Gm18327-201ENSMUST00000202426 830 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 AC160966.1-201ENSMUST00000217147 933 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 AC133598.4-202ENSMUST00000225267 469 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Gm17916-201ENSMUST00000186137 1342 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Mkln1-201ENSMUST00000026699 11395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Gm37470-201ENSMUST00000193378 2798 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Olfr420-202ENSMUST00000213748 3806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r184-202ENSMUST00000227230 7999 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Gm6325-201ENSMUST00000122015 3114 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Igkv4-61-201ENSMUST00000103353 284 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Klra7-204ENSMUST00000112013 1104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Gm13439-201ENSMUST00000117541 409 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Gm22947-201ENSMUST00000158559 91 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Gm9017-201ENSMUST00000159613 676 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Gm3030-201ENSMUST00000163410 516 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r-ps84-201ENSMUST00000172853 923 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Gm45474-201ENSMUST00000209471 408 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Gm5358-201ENSMUST00000212814 353 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Gm5374-201ENSMUST00000222868 657 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Olfr492-201ENSMUST00000079865 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Gm22622-201ENSMUST00000082870 129 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 4930467E23Rik-201ENSMUST00000098909 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 AC157570.1-201ENSMUST00000218052 3778 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Olfr681-204ENSMUST00000215564 4487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Gm23895-201ENSMUST00000158108 160 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Sumo1-203ENSMUST00000185265 532 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Gm33051-201ENSMUST00000192940 274 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Gm44724-202ENSMUST00000208251 531 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 AC171204.1-201ENSMUST00000215867 975 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Olfr1005-ps1-201ENSMUST00000216207 488 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 AC154510.1-201ENSMUST00000223925 737 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 AC115289.1-201ENSMUST00000224915 522 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 AC126690.1-201ENSMUST00000228898 397 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Tas2r109-201ENSMUST00000067539 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Olfr136-201ENSMUST00000077203 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Olfr299-202ENSMUST00000217253 4479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Olfr1355-201ENSMUST00000078414 3317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r36-201ENSMUST00000170402 2561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Gm14448-201ENSMUST00000116383 210 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Gm23551-201ENSMUST00000116852 121 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Gm7421-201ENSMUST00000119298 639 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Gm7365-201ENSMUST00000120877 639 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 2700069I18Rik-201ENSMUST00000128815 1020 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Gm22730-201ENSMUST00000158085 171 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Gm8224-201ENSMUST00000166178 497 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Mir7026-201ENSMUST00000184384 67 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Gm29633-204ENSMUST00000187737 675 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Scgb2b5-ps-201ENSMUST00000190227 270 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Gm38076-201ENSMUST00000193889 450 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Gm44694-201ENSMUST00000205317 1298 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 1110032A03Rik-202ENSMUST00000042576 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Olfr190-201ENSMUST00000071243 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Gm26458-201ENSMUST00000082832 128 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Gm5800-201ENSMUST00000095916 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r108-201ENSMUST00000167314 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Gm11893-201ENSMUST00000117829 491 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Gm13743-201ENSMUST00000121486 724 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Gm12956-201ENSMUST00000122184 414 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Gm15275-201ENSMUST00000154752 347 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r-ps74-201ENSMUST00000173518 570 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Olfr296-ps1-201ENSMUST00000173904 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r25-201ENSMUST00000176572 1101 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r-ps9-201ENSMUST00000177047 358 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Il6st-204ENSMUST00000183829 612 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Gm27160-201ENSMUST00000184837 199 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Olfr662-ps1-201ENSMUST00000210704 396 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 AC138330.1-201ENSMUST00000220690 1127 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Olfr825-201ENSMUST00000076814 1159 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Gm23847-201ENSMUST00000083829 110 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Olfr1164-201ENSMUST00000099834 1112 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Gm42445-201ENSMUST00000196996 2893 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Olfr1222-202ENSMUST00000214027 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Trdn-201ENSMUST00000095762 4514 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Ifi208-201ENSMUST00000085876 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Gabra6-202ENSMUST00000109286 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Ms4a2-204ENSMUST00000186978 2391 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Gm10486-201ENSMUST00000101647 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Gm6121-201ENSMUST00000119231 924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Gm23585-201ENSMUST00000157656 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Gm15974-201ENSMUST00000159103 531 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Prl3d2-202ENSMUST00000164964 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Gm3573-201ENSMUST00000168673 898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Mir7226-201ENSMUST00000184953 60 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Gm28625-201ENSMUST00000188309 205 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Fasl-202ENSMUST00000193648 406 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Gm45551-201ENSMUST00000211459 928 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Olfr198-201ENSMUST00000064452 1054 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Fbxw14-201ENSMUST00000112041 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Olfr1442-202ENSMUST00000207341 3126 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Olfr1442-204ENSMUST00000208657 3148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Zfp280c-202ENSMUST00000076635 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Olfr1129-203ENSMUST00000214773 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Gm10377-201ENSMUST00000100695 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Olfr393-201ENSMUST00000102523 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Olfr1171-ps1-201ENSMUST00000118079 837 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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