Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Gm15087-201ENSMUST00000117465 1172 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm13273-201ENSMUST00000119737 159 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Uqcrh-ps2-201ENSMUST00000121613 269 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Olfr406-201ENSMUST00000133561 1101 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 AI847159-204ENSMUST00000148997 753 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 4930515L19Rik-201ENSMUST00000152352 769 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm23702-201ENSMUST00000158840 130 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm20777-201ENSMUST00000177818 699 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm21874-201ENSMUST00000178374 699 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm20873-201ENSMUST00000179410 699 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm24520-201ENSMUST00000179510 110 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm20737-201ENSMUST00000179665 699 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm21310-201ENSMUST00000180130 699 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm29044-201ENSMUST00000188916 283 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm29365-201ENSMUST00000189461 699 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm42958-201ENSMUST00000197595 318 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 1700042D02Rik-201ENSMUST00000198232 389 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm17893-201ENSMUST00000203017 770 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm18225-201ENSMUST00000216708 742 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm9973-202ENSMUST00000220926 166 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm7745-202ENSMUST00000222914 567 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 AC162934.3-201ENSMUST00000223015 841 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 CT573085.1-201ENSMUST00000224279 1197 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 1110032A03Rik-202ENSMUST00000042576 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Hamp-201ENSMUST00000062620 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Olfr815-201ENSMUST00000071557 951 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Olfr911-ps1-201ENSMUST00000074987 940 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Tas2r124-201ENSMUST00000076150 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Olfr814-201ENSMUST00000081367 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Nlrp9a-202ENSMUST00000108387 3336 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm37802-201ENSMUST00000194998 2643 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm5347-201ENSMUST00000210542 2327 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Strbp-201ENSMUST00000028279 16348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Olfr1469-202ENSMUST00000216910 4106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Prlr-205ENSMUST00000128921 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Olfr970-202ENSMUST00000213975 1630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Slc22a30-203ENSMUST00000120540 2598 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Olfr1249-202ENSMUST00000216124 3047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm43486-201ENSMUST00000196431 4339 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Olfr987-203ENSMUST00000216347 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Igkv4-69-201ENSMUST00000103349 348 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm22497-201ENSMUST00000104499 131 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm23532-201ENSMUST00000104569 112 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm13731-201ENSMUST00000117332 196 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm12982-201ENSMUST00000117408 190 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm12509-201ENSMUST00000118033 609 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm14731-201ENSMUST00000119216 376 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm6762-201ENSMUST00000121769 289 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm13943-201ENSMUST00000144043 343 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm12603-202ENSMUST00000146678 618 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm15640-201ENSMUST00000152070 527 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm25883-201ENSMUST00000157781 271 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm26933-201ENSMUST00000182320 827 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm18403-201ENSMUST00000192907 529 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 4930558C23Rik-201ENSMUST00000196239 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm42947-201ENSMUST00000198230 675 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm43975-201ENSMUST00000203023 481 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm44016-201ENSMUST00000203463 164 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm45317-201ENSMUST00000210385 223 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 AC160134.1-201ENSMUST00000213450 551 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm46103-201ENSMUST00000217614 341 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm18892-201ENSMUST00000217628 881 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 CT025157.1-201ENSMUST00000226241 292 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Olfr824-201ENSMUST00000074161 948 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Smcp-201ENSMUST00000098888 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Olfr1404-202ENSMUST00000216556 3305 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Olfr235-202ENSMUST00000207969 2447 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Olfr744-203ENSMUST00000216690 1765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm26696-201ENSMUST00000181941 2848 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Olfr1253-202ENSMUST00000213484 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Sucnr1-201ENSMUST00000029326 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Nebl-207ENSMUST00000132418 1734 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Vmn2r90-201ENSMUST00000169805 2592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 AC154677.1-201ENSMUST00000227636 2805 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Sycp2-201ENSMUST00000081134 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 A630010A05Rik-201ENSMUST00000100165 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm24951-201ENSMUST00000102182 109 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Ighv3-3-201ENSMUST00000103476 296 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm24376-201ENSMUST00000104399 127 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm15110-201ENSMUST00000117545 881 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm13184-201ENSMUST00000149932 626 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm14707-201ENSMUST00000152793 398 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm24060-201ENSMUST00000157494 95 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm26171-201ENSMUST00000158422 131 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm15689-201ENSMUST00000160604 1159 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm6486-201ENSMUST00000166202 434 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm17030-201ENSMUST00000167016 393 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm8816-201ENSMUST00000182280 1163 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm20897-201ENSMUST00000185240 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm20883-201ENSMUST00000185245 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm21117-202ENSMUST00000185327 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm20916-202ENSMUST00000185338 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm28897-201ENSMUST00000185340 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm20736-202ENSMUST00000185550 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm20835-201ENSMUST00000185565 923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm29564-201ENSMUST00000185575 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm29299-201ENSMUST00000185609 923 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm21317-201ENSMUST00000185636 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm21095-202ENSMUST00000185776 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm28553-201ENSMUST00000185924 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms