Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Sucnr1-201ENSMUST00000029326 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Ctdspl2-202ENSMUST00000110572 4160 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gm14288-201ENSMUST00000109020 3438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Olfr166-202ENSMUST00000213531 4205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gm6207-201ENSMUST00000120075 1386 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gm6228-201ENSMUST00000178856 1386 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Iglv3-201ENSMUST00000103751 381 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gm12149-201ENSMUST00000117511 654 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gm15060-201ENSMUST00000119550 948 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gm14581-201ENSMUST00000121726 198 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 4933416E03Rik-201ENSMUST00000133091 1126 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gm12649-201ENSMUST00000137509 581 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gm9785-202ENSMUST00000144563 593 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gm24854-201ENSMUST00000158025 98 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gm23205-201ENSMUST00000158671 103 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r-ps84-201ENSMUST00000172853 923 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Mir3104-201ENSMUST00000174911 63 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r-ps48-201ENSMUST00000176352 886 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gm5473-201ENSMUST00000179326 642 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gm25412-201ENSMUST00000180258 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gm21294-201ENSMUST00000186443 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gm20888-202ENSMUST00000186890 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gm21497-201ENSMUST00000189455 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gm20811-201ENSMUST00000190500 553 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Csn1s2a-203ENSMUST00000196749 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gm42818-201ENSMUST00000198869 987 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 4933402J10Rik-202ENSMUST00000198882 1167 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 CT025525.1-201ENSMUST00000226325 1054 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 AC118639.1-201ENSMUST00000227204 338 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 AC166369.1-201ENSMUST00000228126 351 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Olfr167-201ENSMUST00000054606 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gm2710-201ENSMUST00000073196 603 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gm22507-201ENSMUST00000082773 160 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Olfr382-201ENSMUST00000092921 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gm38031-201ENSMUST00000191819 3015 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc18-201ENSMUST00000047677 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Olfr197-202ENSMUST00000207772 1320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 AC167250.1-201ENSMUST00000213739 3813 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gm29730-201ENSMUST00000192986 1396 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gm10486-201ENSMUST00000101647 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1058-201ENSMUST00000102631 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gm25833-201ENSMUST00000104137 133 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Pigp-201ENSMUST00000113905 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gm9432-201ENSMUST00000117810 759 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gm14681-201ENSMUST00000118047 411 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gm12891-201ENSMUST00000119358 240 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gm5937-201ENSMUST00000119715 643 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gemin6-ps-201ENSMUST00000120444 501 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gm7350-201ENSMUST00000120964 636 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gm11582-201ENSMUST00000121041 236 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gm13686-201ENSMUST00000122851 350 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gm13656-201ENSMUST00000123829 345 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gm26099-201ENSMUST00000157248 109 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gm24289-201ENSMUST00000157629 135 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gm16026-202ENSMUST00000159695 772 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gm16563-201ENSMUST00000162673 423 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gm5967-201ENSMUST00000172723 494 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Ptma-ps1-201ENSMUST00000181079 309 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Mir6385-201ENSMUST00000184295 105 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gm28623-201ENSMUST00000187219 192 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1055-202ENSMUST00000188023 939 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gm29553-201ENSMUST00000189692 279 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 4921511E07Rik-201ENSMUST00000194790 827 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Olfr428-ps1-201ENSMUST00000201135 466 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gm44072-201ENSMUST00000203666 383 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gm44061-201ENSMUST00000203962 1195 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gm44919-201ENSMUST00000208587 1073 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gm34779-201ENSMUST00000210036 263 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gm40658-203ENSMUST00000222210 1070 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gm3565-201ENSMUST00000222670 609 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 AC139294.2-201ENSMUST00000227159 285 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 AC123860.1-201ENSMUST00000228033 481 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Spata45-201ENSMUST00000077889 432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Fnd3c2-201ENSMUST00000091282 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Tfpi-204ENSMUST00000111714 3614 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gm29968-201ENSMUST00000222815 1387 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Arhgef6-202ENSMUST00000114735 1614 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Trbv16-201ENSMUST00000103274 398 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gm26423-201ENSMUST00000104277 128 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gm23530-201ENSMUST00000104564 137 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Nectin3-206ENSMUST00000121803 541 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gm24936-201ENSMUST00000122598 247 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gm23470-201ENSMUST00000157129 120 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gm22320-201ENSMUST00000157149 312 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gm16117-201ENSMUST00000160544 324 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gm3123-201ENSMUST00000163480 480 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gm22853-201ENSMUST00000174974 131 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Obox4-ps6-201ENSMUST00000176578 724 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gm27527-201ENSMUST00000183903 99 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gm9696-202ENSMUST00000191541 830 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gm34811-201ENSMUST00000206580 445 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gm18116-201ENSMUST00000220920 537 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 AC136976.1-201ENSMUST00000221440 381 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1135-202ENSMUST00000213835 2648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Olfr789-201ENSMUST00000213236 4235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gm14442-201ENSMUST00000119690 1736 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gm28360-201ENSMUST00000187455 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gm6545-201ENSMUST00000217186 1786 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Olfr799-204ENSMUST00000216446 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 A530053G22Rik-201ENSMUST00000060147 1526 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
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