Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm24504-201ENSMUST00000157679 100 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Gm24944-201ENSMUST00000158330 128 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Gm25902-201ENSMUST00000158493 318 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Gm16569-201ENSMUST00000160526 314 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Gm3851-201ENSMUST00000168653 318 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Obox4-ps14-201ENSMUST00000177198 1127 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Gm24968-201ENSMUST00000179817 107 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Gm27233-201ENSMUST00000184030 307 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Ly6c1-203ENSMUST00000185200 540 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Gm21673-201ENSMUST00000186640 436 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Gm21135-201ENSMUST00000189023 436 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Gm34224-201ENSMUST00000204606 364 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Gm36816-202ENSMUST00000205197 504 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Olfr192-203ENSMUST00000206214 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Gm19126-201ENSMUST00000207896 509 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Gm45730-201ENSMUST00000212560 395 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Olfr1114-ps1-201ENSMUST00000213896 456 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 AC102312.1-201ENSMUST00000217752 475 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 AC158803.1-201ENSMUST00000219495 316 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 AC118639.1-201ENSMUST00000227204 338 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Scgb1a1-201ENSMUST00000025554 476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Gm22826-201ENSMUST00000083774 165 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 AC103672.3-201ENSMUST00000227649 3243 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Olfr133-203ENSMUST00000215078 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Mrpl1-203ENSMUST00000121477 1550 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Gm8104-201ENSMUST00000168165 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Cyld-204ENSMUST00000209206 4032 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Dmxl2-202ENSMUST00000118600 9465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Clk4-203ENSMUST00000109113 1627 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Slco1b2-201ENSMUST00000042812 3307 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Vmn1r169-205ENSMUST00000228832 2749 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Mir599-201ENSMUST00000102378 88 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 Mir466b-8-201ENSMUST00000103883 86 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 Ctps2-203ENSMUST00000112300 741 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 Gm13650-201ENSMUST00000117729 433 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 Gm15981-201ENSMUST00000119196 457 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 Gm11325-201ENSMUST00000119967 469 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 Gm24546-201ENSMUST00000158652 102 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 Gm17183-201ENSMUST00000171170 493 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 Gm21746-201ENSMUST00000177612 543 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 Gm28552-201ENSMUST00000190725 388 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 Gm38180-201ENSMUST00000192381 395 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 Mir466e-201ENSMUST00000198862 84 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 Mir466c-1-201ENSMUST00000200654 84 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 Gm42458-201ENSMUST00000201914 369 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 Gm44083-201ENSMUST00000203114 337 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 AL450317.1-201ENSMUST00000213941 291 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 Serf1-201ENSMUST00000022145 601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 AC132315.1-201ENSMUST00000221771 390 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 Ly6e-ps1-201ENSMUST00000222501 367 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 Olfr988-202ENSMUST00000111597 1702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 Arpp19-203ENSMUST00000166549 1747 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 Clec5a-202ENSMUST00000101491 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 Kcnt2-202ENSMUST00000120709 5790 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 Gm37363-201ENSMUST00000192336 2233 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 Gm15581-201ENSMUST00000131334 5640 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 Zscan4a-201ENSMUST00000210573 2279 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 Gm10324-201ENSMUST00000092528 1815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 Vmn2r42-204ENSMUST00000142934 3694 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 Olfr733-204ENSMUST00000216195 3669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 Olfr33-202ENSMUST00000216312 2372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 Wdr64-201ENSMUST00000094288 3817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 Zfp758-203ENSMUST00000121315 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 Gm26814-201ENSMUST00000181178 4149 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 F9-201ENSMUST00000033477 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 Ptprd-217ENSMUST00000174023 4530 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 Ptprd-203ENSMUST00000098005 4542 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 AC131743.1-201ENSMUST00000222138 4024 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 Gm29536-201ENSMUST00000189296 3283 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 AC123705.2-201ENSMUST00000221653 2009 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 Gm28964-202ENSMUST00000186771 1502 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 Gm29301-202ENSMUST00000189344 1502 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 4930444P10Rik-201ENSMUST00000115367 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 Gm25316-201ENSMUST00000116826 118 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 Gm13321-201ENSMUST00000117101 400 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 Gm15671-201ENSMUST00000124160 576 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 Gm12974-201ENSMUST00000129875 333 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 C330018D20Rik-202ENSMUST00000139243 726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 Gm26490-201ENSMUST00000157879 140 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 Gm8207-201ENSMUST00000171204 502 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 Mir5624-201ENSMUST00000176635 61 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 Gm21874-201ENSMUST00000178374 699 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 1700022E09Rik-201ENSMUST00000185295 299 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 Mrgprc1-ps-201ENSMUST00000185552 952 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 Gm28399-201ENSMUST00000186221 318 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 Gm8600-201ENSMUST00000186320 905 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 Gm28572-201ENSMUST00000187444 318 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 Gm23925-202ENSMUST00000188429 132 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 Gm29365-201ENSMUST00000189461 699 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 Igkv12-40-201ENSMUST00000199208 347 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 Gm40293-201ENSMUST00000202596 485 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 Gm44077-201ENSMUST00000203453 435 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 Nasp-ps1-201ENSMUST00000205050 691 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 Gm44720-201ENSMUST00000206076 260 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 Olfr499-ps1-201ENSMUST00000208811 930 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 Olfr1217-202ENSMUST00000213669 3839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 AC109180.1-201ENSMUST00000218676 398 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 Olfr123-201ENSMUST00000054748 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 Olfr1176-201ENSMUST00000057439 949 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 Olfr346-201ENSMUST00000078854 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.4 ms