Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Mir669a-12-201ENSMUST00000197274 87 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Sh3bp1P55194 Mir669a-5-201ENSMUST00000197439 87 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Sh3bp1P55194 Mir669a-10-201ENSMUST00000197745 87 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Sh3bp1P55194 Mir669a-11-201ENSMUST00000197952 87 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Sh3bp1P55194 Mir669a-4-201ENSMUST00000198665 87 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Sh3bp1P55194 Mir669a-9-201ENSMUST00000200087 87 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Sh3bp1P55194 Gm44348-201ENSMUST00000200165 122 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Sh3bp1P55194 Mir669a-8-201ENSMUST00000200268 87 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Sh3bp1P55194 Gm45588-201ENSMUST00000211213 630 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Sh3bp1P55194 AC160123.1-201ENSMUST00000213443 570 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Sh3bp1P55194 Gm46194-201ENSMUST00000218136 320 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Sh3bp1P55194 Gm18557-201ENSMUST00000218710 433 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Sh3bp1P55194 AC132315.1-201ENSMUST00000221771 390 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Sh3bp1P55194 Gm3565-201ENSMUST00000222670 609 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Sh3bp1P55194 AC156790.5-201ENSMUST00000227075 231 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Sh3bp1P55194 Ifnk-201ENSMUST00000058595 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Sh3bp1P55194 Gm24150-201ENSMUST00000082759 104 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Sh3bp1P55194 Vdac3-ps1-201ENSMUST00000099736 853 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Sh3bp1P55194 Olfr1141-201ENSMUST00000099846 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Sh3bp1P55194 Vmn2r-ps104-201ENSMUST00000099416 1671 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Sh3bp1P55194 Vmn1r206-202ENSMUST00000227244 3970 ntAPPRIS P1 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Sh3bp1P55194 Ndst4-204ENSMUST00000173932 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Sh3bp1P55194 Vmn2r30-202ENSMUST00000174368 3688 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Sh3bp1P55194 Gm9911-201ENSMUST00000211467 2802 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Sh3bp1P55194 Rgs13-202ENSMUST00000111941 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
Sh3bp1P55194 Mga-202ENSMUST00000079934 13304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Sh3bp1P55194 Zfp62-212ENSMUST00000180016 3964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Sh3bp1P55194 Olfr107-203ENSMUST00000215947 3954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Sh3bp1P55194 Gm14936-201ENSMUST00000137765 2621 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
Sh3bp1P55194 Igkv3-7-201ENSMUST00000103399 299 ntAPPRIS P1 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Sh3bp1P55194 Hmgb1-ps2-201ENSMUST00000117548 636 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Sh3bp1P55194 Olfr1078-ps1-201ENSMUST00000117978 632 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Sh3bp1P55194 Gm13379-201ENSMUST00000118053 621 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Sh3bp1P55194 Hmgb1-ps3-201ENSMUST00000118415 636 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Sh3bp1P55194 Gm14899-201ENSMUST00000118673 548 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Sh3bp1P55194 Gm15387-201ENSMUST00000120421 648 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Sh3bp1P55194 Gm23183-201ENSMUST00000122595 323 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Sh3bp1P55194 Gm15218-201ENSMUST00000131006 618 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Sh3bp1P55194 Gm10721-201ENSMUST00000143083 669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Sh3bp1P55194 1700120G11Rik-201ENSMUST00000150273 491 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
Sh3bp1P55194 Gm10715-201ENSMUST00000155807 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Sh3bp1P55194 Gm23228-201ENSMUST00000157296 270 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Sh3bp1P55194 Gm22816-201ENSMUST00000157450 117 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Sh3bp1P55194 Gm17535-201ENSMUST00000178641 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Sh3bp1P55194 Hmgb1-ps9-201ENSMUST00000179479 645 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Sh3bp1P55194 Gm11168-204ENSMUST00000179881 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Sh3bp1P55194 Gm27921-201ENSMUST00000183968 108 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Sh3bp1P55194 Gm18448-201ENSMUST00000186286 599 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Sh3bp1P55194 Olfr625-ps1-202ENSMUST00000190218 927 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Sh3bp1P55194 Gm38353-201ENSMUST00000192351 617 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Sh3bp1P55194 Gm37164-201ENSMUST00000192809 637 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Sh3bp1P55194 Gm8790-201ENSMUST00000194108 322 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Sh3bp1P55194 Igkv13-56-1-201ENSMUST00000198481 209 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Sh3bp1P55194 Gm43171-201ENSMUST00000199882 291 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Sh3bp1P55194 Gm17887-201ENSMUST00000200194 547 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Sh3bp1P55194 Gm8132-201ENSMUST00000204938 640 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Sh3bp1P55194 Olfr184-ps1-201ENSMUST00000205922 516 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Sh3bp1P55194 AC107808.1-201ENSMUST00000213260 386 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Sh3bp1P55194 Slfn5os-202ENSMUST00000216469 550 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Sh3bp1P55194 AC165164.2-201ENSMUST00000220313 392 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Sh3bp1P55194 AC134254.5-201ENSMUST00000223436 400 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Sh3bp1P55194 AC158521.1-201ENSMUST00000225295 660 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Sh3bp1P55194 Olfr617-201ENSMUST00000048265 957 ntAPPRIS P1 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Sh3bp1P55194 Olfr972-201ENSMUST00000079767 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Sh3bp1P55194 Gm5518-201ENSMUST00000084171 648 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Sh3bp1P55194 Clec9a-202ENSMUST00000088075 1020 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
Sh3bp1P55194 Gm10718-201ENSMUST00000099046 681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Sh3bp1P55194 Oog1-201ENSMUST00000095509 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
Sh3bp1P55194 Olfr215-201ENSMUST00000061723 4112 ntAPPRIS P1 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Sh3bp1P55194 Olfr1130-202ENSMUST00000216580 2648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Sh3bp1P55194 Zfp638-206ENSMUST00000203324 3822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Sh3bp1P55194 Gm45352-201ENSMUST00000210140 1452 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
Sh3bp1P55194 Zfp934-202ENSMUST00000101547 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Sh3bp1P55194 Olfr1369-ps1-204ENSMUST00000215207 3794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Sh3bp1P55194 Zfp708-201ENSMUST00000109742 2416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Sh3bp1P55194 Gm22591-201ENSMUST00000104243 106 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Sh3bp1P55194 Gm22204-201ENSMUST00000122654 327 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Sh3bp1P55194 Gm24289-201ENSMUST00000157629 135 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Sh3bp1P55194 Gm26271-201ENSMUST00000158349 104 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Sh3bp1P55194 1700016C15Rik-201ENSMUST00000016106 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Sh3bp1P55194 Vmn2r-ps80-201ENSMUST00000173697 914 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Sh3bp1P55194 Gm26219-201ENSMUST00000175216 71 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Sh3bp1P55194 Gm27190-201ENSMUST00000184890 542 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Sh3bp1P55194 Gm28153-201ENSMUST00000189853 629 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Sh3bp1P55194 Gm43096-201ENSMUST00000196173 421 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Sh3bp1P55194 Gm9379-201ENSMUST00000196790 646 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Sh3bp1P55194 AL935138.1-201ENSMUST00000215309 196 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Sh3bp1P55194 AC122301.3-201ENSMUST00000217707 716 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Sh3bp1P55194 AC122317.1-201ENSMUST00000218404 708 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Sh3bp1P55194 AC144942.1-201ENSMUST00000220425 597 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Sh3bp1P55194 AC123705.4-201ENSMUST00000222411 493 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Sh3bp1P55194 AC160958.1-201ENSMUST00000224833 368 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Sh3bp1P55194 AC130823.2-201ENSMUST00000226169 290 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Sh3bp1P55194 Gm5548-201ENSMUST00000055878 397 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Sh3bp1P55194 Gm10042-201ENSMUST00000079884 78 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Sh3bp1P55194 Gm10267-201ENSMUST00000091916 258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Sh3bp1P55194 Olfr187-202ENSMUST00000207673 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Sh3bp1P55194 Olfr769-203ENSMUST00000216906 4325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Sh3bp1P55194 Gm14443-201ENSMUST00000109054 4516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Sh3bp1P55194 Gm7173-201ENSMUST00000101410 2832 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.3 ms